More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1294 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_1294  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  100 
 
 
220 aa  438  1e-122  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.957461  normal  0.413121 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1763  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  53.88 
 
 
223 aa  221  5e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1119  catabolite gene activator (cAMP receptor protein) (cAMP-regulatory protein)  49.04 
 
 
222 aa  198  4e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1284  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  48.11 
 
 
224 aa  196  2e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.304913  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3800  Crp/FNR family transcriptional regulator  47.62 
 
 
225 aa  193  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0755  Crp/FNR family transcriptional regulator  47.37 
 
 
222 aa  188  5e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.2571 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3212  CRP/FNR family transcriptional regulator  46.51 
 
 
229 aa  183  2e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0543887  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38.76 
 
 
225 aa  154  8e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1061  Crp family transcriptional regulator  40.1 
 
 
214 aa  149  3e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0336611  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  39.34 
 
 
225 aa  146  3e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  39.34 
 
 
225 aa  146  3e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  39.05 
 
 
225 aa  140  1e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  36.28 
 
 
225 aa  140  2e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38.39 
 
 
228 aa  138  7e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.527594 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25400  cAMP-binding protein  34.13 
 
 
225 aa  137  1e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.67 
 
 
228 aa  137  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4099  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.41 
 
 
237 aa  130  1e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.55046e-09 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  36.49 
 
 
228 aa  130  2e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4102  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.76 
 
 
251 aa  127  1e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.363021  normal  0.0126572 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3550  cAMP-regulatory protein  37.04 
 
 
217 aa  127  2e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  35.55 
 
 
226 aa  127  2e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.18 
 
 
242 aa  126  2e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26230  cAMP-binding protein  34.63 
 
 
225 aa  126  2e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.39 
 
 
219 aa  126  3e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  6.07267e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.07 
 
 
226 aa  124  9e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0755  cAMP-regulatory protein  37.04 
 
 
211 aa  123  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.276204 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  33.82 
 
 
224 aa  122  3e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46100  cAMP-regulatory protein  35.5 
 
 
215 aa  122  4e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2797  cAMP-regulatory protein  33.67 
 
 
198 aa  121  8e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.207531  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3943  cAMP-regulatory protein  34.83 
 
 
214 aa  120  2e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0608  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.29 
 
 
225 aa  120  2e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1066  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.33 
 
 
225 aa  119  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08370  cAMP-regulatory protein  32.57 
 
 
214 aa  119  4e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  3.40418e-06 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  33.33 
 
 
226 aa  119  4e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.38 
 
 
224 aa  118  6e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2357  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.47 
 
 
212 aa  117  1e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.33 
 
 
226 aa  116  2e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0049  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.02 
 
 
252 aa  117  2e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.422683  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.33 
 
 
225 aa  116  3e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0139  cAMP-regulatory protein  33.7 
 
 
214 aa  114  8e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4219  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.14 
 
 
219 aa  114  1e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.408304  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5111  cAMP-regulatory protein  33.33 
 
 
214 aa  114  1e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8903  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.56 
 
 
224 aa  113  2e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5745  transcriptional regulator  30.37 
 
 
243 aa  114  2e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3095  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.17 
 
 
220 aa  113  2e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  1.48221e-05 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0596  catabolite gene activator Crp  32.11 
 
 
214 aa  113  2e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2074  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.67 
 
 
225 aa  113  3e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0424  cAMP-regulatory protein  32.34 
 
 
214 aa  112  4e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.328198  normal  0.870698 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0457  cAMP-regulatory protein  32.34 
 
 
223 aa  112  4e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.89409  normal  0.110467 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0662  cAMP-regulatory protein  31.32 
 
 
211 aa  111  1e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  3.39306e-08  hitchhiker  0.000137041 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2444  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.9 
 
 
238 aa  110  1e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000577484  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3873  cAMP-regulatory protein  31.49 
 
 
211 aa  111  1e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  1.05148e-07  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0954  cAMP-regulatory protein  32.87 
 
 
216 aa  111  1e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.575012  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4577  cAMP-regulatory protein  32.84 
 
 
214 aa  110  1e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3932  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.95 
 
 
224 aa  110  2e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.571672  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0454  cAMP-regulatory protein  31.34 
 
 
214 aa  110  2e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.993891  normal  0.32004 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0388  cAMP-regulatory protein  32.97 
 
 
212 aa  110  2e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0189183  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2129  Crp/Fnr family transcriptional regulator  35.58 
 
 
225 aa  110  2e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185639  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2102  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.84 
 
 
226 aa  110  2e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000889631  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3367  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.92 
 
 
230 aa  109  4e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3190  cAMP-regulatory protein  30.94 
 
 
211 aa  108  7e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  2.13612e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3292  cAMP-regulatory protein  31.49 
 
 
211 aa  108  7e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0112541  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1644  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.69 
 
 
223 aa  108  8e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3412  cAMP-regulatory protein  30.94 
 
 
211 aa  108  9e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  3.98691e-07  normal  0.338767 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4779  cAMP-regulatory protein  31.84 
 
 
214 aa  108  9e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.345439 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0624  cAMP-regulatory protein  30.94 
 
 
211 aa  108  9e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0652  cAMP-regulatory protein  30.94 
 
 
211 aa  108  9e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  4.33673e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0617  cAMP-regulatory protein  30.94 
 
 
211 aa  108  9e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  1.35204e-07  normal  0.325091 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0618  cAMP-regulatory protein  30.94 
 
 
211 aa  108  9e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  4.75791e-09  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3509  cAMP-regulatory protein  30.94 
 
 
211 aa  107  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  2.47338e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3690  cAMP-regulatory protein  30.94 
 
 
211 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0119951  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0578  cAMP-regulatory protein  30.94 
 
 
211 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.001638  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3873  cAMP-regulatory protein  30.94 
 
 
211 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000159716  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0585  cAMP-regulatory protein  30.94 
 
 
211 aa  107  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  9.188e-09  normal  0.481967 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3747  cAMP-regulatory protein  30.94 
 
 
211 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0179283  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3004  cAMP-regulatory protein  30.94 
 
 
211 aa  107  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  3.2723e-09  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0824  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.39 
 
 
225 aa  107  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928817  normal  0.0486748 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0879  cAMP-regulatory protein  31.25 
 
 
229 aa  107  2e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000144762  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0792  cAMP-regulatory protein  30.8 
 
 
229 aa  106  3e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2737  cAMP-regulatory protein  31.32 
 
 
210 aa  106  3e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5808  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.37 
 
 
231 aa  106  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.254135  normal  0.0101482 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1659  cyclic nucleotide-binding  34.69 
 
 
223 aa  106  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.834954  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1101  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.43 
 
 
246 aa  106  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4286  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
241 aa  105  6e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0700  CRP/FNR family transcriptional regulator  31.38 
 
 
228 aa  105  6e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.259996 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0993  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.99 
 
 
229 aa  105  8e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.98476 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3629  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.43 
 
 
263 aa  104  9e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04006  cAMP-regulatory protein  31.05 
 
 
222 aa  103  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5435  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.52 
 
 
224 aa  104  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.397858 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2803  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.88 
 
 
229 aa  104  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5205  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.05 
 
 
224 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703662  hitchhiker  0.000819508 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4388  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.48 
 
 
225 aa  103  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13707  Cpr/FNR family transcriptional regulator  29.05 
 
 
224 aa  103  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0333343 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2034  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.39 
 
 
243 aa  103  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.663242  normal  0.0439569 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4904  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.05 
 
 
224 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4818  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.05 
 
 
224 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0505  cyclic nucleotide-binding protein  29.52 
 
 
224 aa  103  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.287437  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8981  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.81 
 
 
222 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2191  cAMP-regulatory protein  30.77 
 
 
210 aa  103  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0293  cAMP-regulatory protein  30.77 
 
 
210 aa  102  3e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.160804  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>