More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1273 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_1273  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
307 aa  628  1e-179  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3990  glycosyl transferase family protein  61.51 
 
 
304 aa  383  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.965976 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2729  glycosyl transferase family protein  52.9 
 
 
298 aa  279  5e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0619  glycosyl transferase, group 2 family protein  48.65 
 
 
311 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773869  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5349  glycosyl transferase family protein  45.36 
 
 
314 aa  271  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0628  glycosyl transferase family protein  44.41 
 
 
306 aa  260  2e-68  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.154474 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2683  glycosyl transferase family 2  43.52 
 
 
361 aa  255  8e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3501  glycosyl transferase family 2  41.5 
 
 
310 aa  207  3e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.222757  normal  0.064344 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1579  glycosyl transferase family protein  45.02 
 
 
318 aa  203  3e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.35814 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3624  glycosyl transferase family 2  42.19 
 
 
319 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.519026 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3301  glycosyl transferase family protein  41.72 
 
 
319 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.904037  normal  0.657687 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  38.58 
 
 
311 aa  171  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  37.41 
 
 
312 aa  167  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6543  glycosyl transferase family protein  35.16 
 
 
329 aa  157  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1576  glycosyl transferase family protein  35.52 
 
 
313 aa  155  7e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.169867 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4234  glycosyl transferase family protein  34.25 
 
 
310 aa  153  4e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0220827  hitchhiker  0.000823038 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  31.12 
 
 
298 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1007  glycosyl transferase family protein  33.46 
 
 
336 aa  142  5e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.47724 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2720  glycosyl transferase family protein  32.25 
 
 
318 aa  142  8e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.372811  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3135  glycosyl transferase, putative  32.47 
 
 
318 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.331017  normal  0.385632 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2579  glycosyl transferase family protein  32.47 
 
 
318 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1013  glycosyl transferase family 2  33.09 
 
 
334 aa  137  2e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00302426  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0759  glycosyl transferase family protein  34.95 
 
 
340 aa  137  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1825  glycosyl transferase family protein  34.91 
 
 
324 aa  136  5e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07585  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.25 
 
 
379 aa  136  5e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.547919  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2910  glycosyl transferase family protein  30.52 
 
 
318 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4145  glycosyl transferase family protein  31.23 
 
 
334 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.417391 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3226  glycosyl transferase family protein  30.98 
 
 
317 aa  130  4.0000000000000003e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4989  glycosyl transferase family protein  31.62 
 
 
387 aa  129  4.0000000000000003e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1840  glycosyl transferase family 2  31.2 
 
 
324 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.939946  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1044  b-glycosyltransferase  30.47 
 
 
652 aa  129  8.000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00623044  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0264  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.74 
 
 
355 aa  128  1.0000000000000001e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2168  glycosyl transferase family protein  31.92 
 
 
360 aa  124  2e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1368  glycosyl transferase family protein  30.69 
 
 
324 aa  124  2e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.537191  normal  0.711331 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1388  glycosyl transferase family protein  31.23 
 
 
324 aa  122  5e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4607  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
306 aa  122  7e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.71448  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4474  glycosyl transferase family 2  29.48 
 
 
290 aa  122  7e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0377  glycosyl transferase family protein  33.84 
 
 
314 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.359383  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2949  glycosyl transferase family protein  31.56 
 
 
299 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0463  glycosyl transferase family protein  33.47 
 
 
293 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.580187 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4605  glycosyl transferase family protein  33.22 
 
 
318 aa  120  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.151832  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0220  glycosyl transferase family 2  31.71 
 
 
705 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1298  glycosyl transferase family protein  30.63 
 
 
289 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0375  glycosyl transferase family protein  30.68 
 
 
311 aa  116  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4741  glycosyl transferase family protein  29.29 
 
 
308 aa  116  5e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  31.92 
 
 
313 aa  116  5e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1949  glycosyl transferase family protein  30.88 
 
 
308 aa  116  5e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.535237 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0817  hypothetical protein  28.74 
 
 
297 aa  115  7.999999999999999e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1638  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3032  glycosyl transferase family protein  29.45 
 
 
714 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3119  glycosyl transferase family protein  32.81 
 
 
282 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2407  glycosyl transferase family protein  31.54 
 
 
312 aa  113  5e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.116461  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  35.65 
 
 
1340 aa  112  6e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  29.81 
 
 
294 aa  112  8.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0842  hypothetical protein  27.97 
 
 
297 aa  111  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1435  glycosyl transferase family protein  32.76 
 
 
324 aa  109  6e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1593  glycosyl transferase family protein  31.37 
 
 
317 aa  107  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3344  glycosyl transferase family protein  33.62 
 
 
274 aa  107  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.27907 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  29.66 
 
 
318 aa  107  3e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1213  glycosyl transferase family protein  33.48 
 
 
683 aa  106  5e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3706  glycosyl transferase family 2  28.08 
 
 
325 aa  105  8e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000558134  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  30.32 
 
 
624 aa  105  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1795  glycosyl transferase family protein  30.12 
 
 
306 aa  105  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4734  glycosyl transferase family protein  32.13 
 
 
294 aa  104  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4203  glycosyl transferase family 2  30.93 
 
 
841 aa  104  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.138699 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0233  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.85 
 
 
315 aa  103  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.885705  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0409  glycosyl transferase family 2  31.85 
 
 
315 aa  103  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.535242  hitchhiker  0.0010651 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  29.28 
 
 
703 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6344  glycosyl transferase family 2  29.74 
 
 
822 aa  102  8e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0187449  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 
679 aa  102  9e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4314  glycosyl transferase family protein  30.86 
 
 
401 aa  100  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2344  glycosyl transferase family 2  30.52 
 
 
301 aa  100  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.415521  hitchhiker  0.0000247035 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3852  glycosyl transferase family 2  26.35 
 
 
321 aa  100  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1773  glycosyl transferase family protein  30.15 
 
 
303 aa  100  4e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.314835  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0094  glycosyl transferase family 2  27.59 
 
 
312 aa  100  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2016  glycosyl transferase family protein  30.71 
 
 
322 aa  99.4  7e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.12313  normal  0.993196 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2246  glycosyl transferase family 2  26.67 
 
 
341 aa  99  8e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0322727  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5292  glycosyl transferase family 2  30.8 
 
 
327 aa  98.6  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3218  glycosyl transferase family protein  28.7 
 
 
902 aa  98.2  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0552261  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3795  glycosyl transferase family protein  29.82 
 
 
337 aa  97.4  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3033  glycosyl transferase family protein  30.69 
 
 
308 aa  96.3  5e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.244321  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4524  glycosyl transferase family protein  27.97 
 
 
308 aa  95.9  8e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.500037  normal  0.110607 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1320  glycosyl transferase family protein  27.09 
 
 
296 aa  95.9  8e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1337  glycosyl transferase family protein  27.09 
 
 
296 aa  95.9  8e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.945092 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1356  glycosyl transferase family protein  27.09 
 
 
296 aa  95.9  8e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00877043  normal  0.475844 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0256  glycosyl transferase family 2  31.51 
 
 
334 aa  95.9  8e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0188043  normal  0.110004 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2292  glycosyl transferase family protein  30.31 
 
 
281 aa  95.5  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  normal  0.600006 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2138  glycosyl transferase family 2  29.26 
 
 
311 aa  95.5  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5097  glycosyl transferase family protein  29.3 
 
 
340 aa  95.5  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.912612  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0754  glycosyl transferase family 2  31.65 
 
 
691 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.235056 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2441  glycosyl transferase family protein  27.4 
 
 
290 aa  95.1  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12413  glycosyltransferase  29.55 
 
 
330 aa  95.1  1e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4788  glycosyl transferase family protein  30.82 
 
 
315 aa  95.5  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0688  glycosyl transferase protein  29.18 
 
 
275 aa  94.4  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0120982  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1063  glycosyl transferase family 2  25.74 
 
 
305 aa  94  3e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.862808  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0791  glycosyl transferase family 2  31.25 
 
 
691 aa  94  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.62869  normal  0.0614605 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0077  glycosyl transferase family protein  28.37 
 
 
287 aa  93.6  4e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0831  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 
691 aa  93.2  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.74925  normal  0.236177 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0757  glycosyl transferase family protein  27.08 
 
 
358 aa  93.2  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11098 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2759  glycosyl transferase family 2  29.46 
 
 
337 aa  93.6  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>