More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1210 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1210  regulatory protein, TetR  100 
 
 		 207 aa  427  1e-119  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2269  transcriptional regulator, TetR family  60.56 
 
 		 197 aa  199  3e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1872  TetR family transcriptional regulator  45.68 
 
 		 194 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4700  transcriptional regulator, TetR family  45.28 
 
 		 217 aa  121  8e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.804657  normal  0.0108792 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3623  transcriptional regulator, TetR family  45.28 
 
 		 217 aa  121  8e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3251  regulatory protein, TetR  37.78 
 
 		 205 aa  103  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000584066  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42260  TetR family regulatory protein  33.54 
 
 		 198 aa  102  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0513  transcriptional regulator, TetR family  34.71 
 
 		 188 aa  99.8  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5303  TetR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 187 aa  96.3  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.398356  normal  0.30324 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2981  TetR family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 180 aa  94.4  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.341172 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1421  transcriptional regulator, TetR family  35.47 
 
 		 199 aa  92.8  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1299  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 202 aa  90.5  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.808118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1468  TetR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 186 aa  88.6  6e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.781673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4123  hypothetical protein  32.48 
 
 		 189 aa  87.4  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.39248 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2656  TetR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 179 aa  87  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.754114  normal  0.0141418 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3062  transcriptional regulator, TetR family  33.75 
 
 		 199 aa  86.3  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0638813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1596  TetR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 192 aa  86.3  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000620531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01665  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 202 aa  86.3  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.152407  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1901  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 187 aa  85.5  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2407  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 177 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0993242  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5497  TetR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 211 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5206  TetR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 211 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1527  TetR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 204 aa  80.1  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.093957 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5117  TetR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 211 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.602589  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0946  TetR family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 206 aa  79.3  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.826877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4888  TetR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 209 aa  79  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4460  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 187 aa  78.6  0.00000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.20619 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1595  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 211 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.201593  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1479  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 231 aa  77  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0301  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 180 aa  76.3  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.246546 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1619  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 188 aa  76.3  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.776591 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4754  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 215 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000397464  hitchhiker  0.00227458 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3681  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 224 aa  73.9  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.966495  normal  0.60312 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1565  TetR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 192 aa  72.8  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0883  transcriptional regulator, TetR family  32.1 
 
 		 185 aa  72  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.476269  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2100  regulatory protein TetR  33.12 
 
 		 191 aa  71.2  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.726154  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5294  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 188 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0307229 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4824  transcriptional regulator, TetR family  27.33 
 
 		 209 aa  68.2  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.870424 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4912  transcriptional regulator, TetR family  27.33 
 
 		 209 aa  67.8  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.095587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4608  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 182 aa  66.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.582977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3891  TetR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 207 aa  64.7  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.75762  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1196  TetR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 214 aa  63.9  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.228936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5605  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 		 184 aa  64.3  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5846  TetR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.472138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0802  regulatory protein, TetR  30.19 
 
 		 182 aa  62.4  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.334843  normal  0.796776 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3138  TetR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.293904  normal  1 
 
 
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NC_007435  BURPS1710b_A0282  TetR family regulatory protein  27.44 
 
 		 238 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.381975  n/a   
 
 
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NC_009140  SNSL254_pSN254_0043  tetracycline repressor protein R, class A  44.07 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011092  SeSA_B0033  tetracycline repressor protein, class A  44.07 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.370137  normal  0.333737 
 
 
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NC_010488  EcSMS35_A0152  tetracycline repressor protein, class A  44.07 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1312  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 238 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1007  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 238 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.85068  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1726  transcriptional regulator, TetR family protein  30.77 
 
 		 238 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0513672  n/a   
 
 
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NC_009075  BURPS668_A1810  transcriptional regulator, TetR family protein  30.77 
 
 		 238 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.976243  n/a   
 
 
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NC_008835  BMA10229_0284  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 238 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0846937  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3469  transcriptional regulator, TetR family  27.49 
 
 		 219 aa  57.8  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.930137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3310  hypothetical protein  29.86 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.106528 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3680  TetR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3415  TetR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.573909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2657  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.613192  normal  0.699424 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1535  transcriptional regulator, TetR family  45.1 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 332 aa  54.7  0.0000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0476  TetR family transcriptional regulator  23.78 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.146337 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5723  transcriptional regulator, TetR family  42 
 
 		 177 aa  54.3  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00322286 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0051  transcriptional regulator, TetR family  38.16 
 
 		 250 aa  53.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4995  TetR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 224 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.11542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0054  transcriptional regulator, TetR family  38.16 
 
 		 250 aa  53.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3094  TetR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 237 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5273  TetR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 237 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.461714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 245 aa  52.4  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4107  transcriptional regulator  37.29 
 
 		 187 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.198218  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47610  putative transcriptional regulator  37.29 
 
 		 186 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3457  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 238 aa  52  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2251  putative transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 187 aa  52  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0005  TetR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 195 aa  51.6  0.000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0931339  normal  0.381518 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2580  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 211 aa  51.6  0.000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.257801 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10210  transcriptional regulator  33.72 
 
 		 272 aa  51.6  0.000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.472309  normal  0.0650558 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5567  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 290 aa  51.2  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5866  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 236 aa  51.6  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5615  transcriptional regulator, TetR family  35.06 
 
 		 291 aa  51.6  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0658  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 211 aa  51.6  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3960  transcriptional regulator, TetR family  28.38 
 
 		 210 aa  50.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.879503  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5288  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 290 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5130  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 290 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5529  transcriptional regulator, TetR family  35.06 
 
 		 290 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0683  transcriptional regulator, TetR family  27.17 
 
 		 233 aa  51.2  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.124954 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5685  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 290 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1669  TetR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 235 aa  51.2  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0086  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0076  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 205 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 232 aa  50.8  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4327  regulatory protein, TetR  37.35 
 
 		 182 aa  51.2  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.809003  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0095  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0333517 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5113  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 290 aa  50.1  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0361  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.23201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1930  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 206 aa  50.1  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.189169  n/a   
 
 
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NC_008391  Bamb_4633  TetR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 224 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.458937  normal  1 
 
 
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NC_008392  Bamb_6105  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 201 aa  50.1  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.93473  normal  0.666323 
 
 
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NC_010552  BamMC406_5162  TetR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 224 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.122941 
 
 
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