143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1187 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1187  hypothetical protein  100 
 
 		 180 aa  370  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2664  flavin reductase domain protein FMN-binding  78.77 
 
 		 180 aa  305  3e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1944  flavin reductase domain protein FMN-binding  77.78 
 
 		 180 aa  301  4.0000000000000003e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.334773  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2498  flavin reductase domain-containing protein  69.44 
 
 		 180 aa  279  2e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.198101  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1739  flavin reductase domain protein FMN-binding  67.78 
 
 		 180 aa  267  5.9999999999999995e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1062  flavin reductase domain-containing protein  63.89 
 
 		 180 aa  258  4e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1600  hypothetical protein  60 
 
 		 185 aa  238  2.9999999999999997e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0519  flavin reductase domain-containing protein  48.57 
 
 		 176 aa  169  2e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.348159  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3068  flavin reductase domain-containing protein  47.43 
 
 		 176 aa  166  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.293275  normal  0.441099 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3722  flavin reductase domain protein FMN-binding  44.57 
 
 		 176 aa  160  1e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0423931 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1916  putative flavin reductase-like protein  44.32 
 
 		 177 aa  154  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0609748  normal  0.257395 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0862  flavin reductase-like, FMN-binding  46.75 
 
 		 178 aa  152  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374228  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0590  hypothetical protein  44.71 
 
 		 185 aa  152  2e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.237388 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0124  flavin reductase domain protein FMN-binding  47.13 
 
 		 186 aa  150  8e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3753  flavin reductase-like, FMN-binding  43.53 
 
 		 186 aa  150  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.722732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1925  flavin reductase-like protein  43.68 
 
 		 178 aa  146  1.0000000000000001e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.802506 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7416  hypothetical protein  40.8 
 
 		 188 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.933873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5217  flavin reductase domain-containing protein  41.14 
 
 		 182 aa  145  4.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2510  flavin reductase domain protein FMN-binding  42.94 
 
 		 186 aa  144  9e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.365491  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5713  flavin reductase domain protein FMN-binding  41.38 
 
 		 189 aa  138  3.9999999999999997e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.483715  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40150  Flavin reductase-like protein  37.79 
 
 		 177 aa  135  4e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.710187  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3226  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.83 
 
 		 185 aa  130  1.0000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.352328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0524  hypothetical protein  37.13 
 
 		 184 aa  129  3e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000000440007  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3128  flavin reductase domain-containing protein  37.89 
 
 		 185 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1289  flavin reductase domain protein FMN-binding  46.49 
 
 		 123 aa  104  8e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3733  hypothetical protein  36.54 
 
 		 160 aa  100  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2839  flavin reductase-like, FMN-binding  30.57 
 
 		 202 aa  97.4  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2978  flavin reductase-like, FMN-binding  28.57 
 
 		 205 aa  94.7  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2083  flavin reductase-like, FMN-binding  30.43 
 
 		 208 aa  87  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0249  putative flavin reductase  30.34 
 
 		 195 aa  85.1  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.688531  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1222  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.34 
 
 		 215 aa  85.1  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.996876  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7131  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.03 
 
 		 194 aa  85.1  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2072  flavin reductase domain-containing protein  28.42 
 
 		 190 aa  82.4  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4078  flavin reductase domain-containing protein  29.14 
 
 		 204 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2046  hypothetical protein  29.1 
 
 		 194 aa  80.5  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.179971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0382  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  32.62 
 
 		 160 aa  77.8  0.00000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.610168  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4765  flavin reductase-like, FMN-binding  28.72 
 
 		 199 aa  77.8  0.00000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.119665 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2185  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  28.33 
 
 		 189 aa  76.3  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00717772  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1546  flavin reductase domain-containing protein  28.33 
 
 		 189 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.917994  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0980  flavin reductase domain-containing protein  29.41 
 
 		 194 aa  76.3  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1712  flavin reductase domain-containing protein  28.33 
 
 		 189 aa  76.3  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.190889  normal  0.0473113 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01420  hypothetical protein  27.22 
 
 		 189 aa  75.5  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01432  hypothetical protein  27.22 
 
 		 189 aa  75.5  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1643  flavin reductase domain-containing protein  27.22 
 
 		 189 aa  75.5  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0743  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.65 
 
 		 185 aa  74.7  0.0000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2194  flavin reductase domain-containing protein  27.22 
 
 		 189 aa  74.7  0.0000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1145  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  31.03 
 
 		 197 aa  73.6  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2225  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.97 
 
 		 195 aa  73.2  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3881  flavin reductase domain-containing protein  31.06 
 
 		 209 aa  72.4  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1327  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.95 
 
 		 192 aa  70.5  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.646818  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0343  flavin reductase-like, FMN-binding  31.79 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.37872  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1232  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.37 
 
 		 215 aa  67.8  0.00000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0805  flavin reductase-like, FMN-binding  30.71 
 
 		 188 aa  67  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1144  flavin reductase-like, FMN-binding  33.08 
 
 		 189 aa  67  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.467484  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4083  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.99 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.575581 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3970  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.11 
 
 		 193 aa  66.6  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.169391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0126  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.23 
 
 		 194 aa  65.9  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0347  flavin reductase domain-containing protein  31.09 
 
 		 191 aa  65.5  0.0000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.643208  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2846  flavin reductase domain-containing protein  32.56 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000500824  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2530  hypothetical protein  33.33 
 
 		 169 aa  64.7  0.0000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0339415  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2040  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.41 
 
 		 186 aa  62.4  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.228084  hitchhiker  0.0000000489831 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2181  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.74 
 
 		 190 aa  61.6  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2781  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  25.66 
 
 		 167 aa  60.8  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000373643  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0720  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.46 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2155  flavin reductase domain-containing protein  26.49 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0457399 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2036  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.09 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000423527  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3486  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.1 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0687  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.4 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0995  hypothetical protein  32.82 
 
 		 185 aa  57.8  0.00000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.418174  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0520  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.75 
 
 		 189 aa  57.8  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3349  flavoredoxin Flr  29.27 
 
 		 188 aa  57.8  0.00000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0445888 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2205  flavin reductase-like, FMN-binding  28.86 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.361259  normal  0.347764 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0626  flavin reductase domain-containing protein  22.53 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02270  conserved protein of DIM6/NTAB family  27.91 
 
 		 168 aa  57  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.759277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1404  putative flavoredoxin  37.04 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2659  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  25.68 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.125103  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2393  flavin reductase-like  25.14 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.791312  normal  0.804831 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1189  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.34 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00243403  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0642  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.1 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0563737  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0437  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.71 
 
 		 185 aa  54.7  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0123004 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2210  flavin reductase domain-containing protein  27.27 
 
 		 189 aa  55.1  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1998  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  25 
 
 		 201 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.172615  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3444  flavin reductase domain-containing protein  26.98 
 
 		 216 aa  54.7  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.280033  unclonable  0.00000709652 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0699  hypothetical protein  25 
 
 		 201 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0606  flavin reductase family protein  25 
 
 		 201 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0678  flavoredoxin  28.57 
 
 		 184 aa  54.3  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.616599 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1572  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.75 
 
 		 190 aa  54.3  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3951  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.91 
 
 		 168 aa  53.9  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00405255 
 
 
-
 
NC_002950  PG0359  flavin reductase domain-containing protein  28.93 
 
 		 195 aa  53.1  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184245 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1443  flavin reductase-like, FMN-binding  26.45 
 
 		 189 aa  52.8  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2986  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  27.4 
 
 		 196 aa  52.4  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0078  flavoredoxin  30.53 
 
 		 189 aa  52.4  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00025705  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2701  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.2 
 
 		 189 aa  52  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1050  hypothetical protein  29.46 
 
 		 191 aa  52  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4577  flavin reductase domain-containing protein  23.63 
 
 		 189 aa  52  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0883  flavin reductase-like, FMN-binding  23.89 
 
 		 196 aa  52  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.519156  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1365  flavin reductase domain-containing protein  23.89 
 
 		 196 aa  52  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11280  putative flavoredoxin  28.04 
 
 		 168 aa  51.6  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00035262  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1524  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.7 
 
 		 215 aa  52  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1355  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.77 
 
 		 196 aa  51.6  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>