More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1166 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_1166  secretion protein HlyD  100 
 
 
412 aa  823    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.912906  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1726  efflux transporter, RND family, MFP subunit  50.75 
 
 
395 aa  335  7e-91  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000359698  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3595  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.82 
 
 
404 aa  272  6e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0852698  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2024  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.77 
 
 
419 aa  271  2e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000305818 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2203  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.22 
 
 
419 aa  269  8e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3168  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.67 
 
 
430 aa  259  7e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.479459  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0496  RND family efflux transporter MFP subunit  41.75 
 
 
402 aa  257  2e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1178  RND family efflux transporter MFP subunit  39.84 
 
 
390 aa  254  2.0000000000000002e-66  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3643  RND family efflux transporter MFP subunit  39.44 
 
 
455 aa  253  5.000000000000001e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.384349  normal  0.340778 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2972  secretion protein HlyD  42.44 
 
 
429 aa  252  7e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3060  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.68 
 
 
424 aa  252  7e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3233  RND family efflux transporter MFP subunit  42.74 
 
 
405 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000196171  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3038  secretion protein HlyD  43.16 
 
 
403 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000167095  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4941  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.4 
 
 
419 aa  241  1e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.321445  normal  0.921537 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1129  RND family efflux transporter MFP subunit  42.78 
 
 
407 aa  238  2e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3127  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.2 
 
 
416 aa  236  8e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0307  RND family efflux transporter MFP subunit  38.62 
 
 
413 aa  229  5e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0899354  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2811  RND family efflux transporter MFP subunit  35.16 
 
 
444 aa  228  1e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0782  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.39 
 
 
428 aa  221  1.9999999999999999e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00204407  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2314  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.08 
 
 
466 aa  220  3.9999999999999997e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2825  Fis family transcriptional regulator  35.08 
 
 
466 aa  220  3.9999999999999997e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.506795  normal  0.45265 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3548  RND family efflux transporter MFP subunit  34.81 
 
 
442 aa  218  1e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.489121  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1414  secretion protein HlyD  36.39 
 
 
430 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0385  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.77 
 
 
409 aa  212  1e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0906  secretion protein HlyD  31.87 
 
 
449 aa  211  3e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.101628  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2777  RND family efflux transporter MFP subunit  34.66 
 
 
489 aa  210  3e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000975793  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1814  RND family efflux transporter MFP subunit  36.6 
 
 
432 aa  210  3e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3185  secretion protein HlyD  34.48 
 
 
446 aa  209  8e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3021  RND family efflux transporter MFP subunit  36.78 
 
 
418 aa  209  9e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0354964  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3375  HlyD family membrane fusion protein  36.78 
 
 
425 aa  209  1e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3918  secretion protein HlyD  38.5 
 
 
433 aa  206  6e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1084  RND family efflux transporter MFP subunit  35.73 
 
 
429 aa  205  1e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1892  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.26 
 
 
430 aa  204  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.133123 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0102  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.93 
 
 
465 aa  202  9.999999999999999e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2151  RND family efflux transporter MFP subunit  35.15 
 
 
471 aa  202  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.563694  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1706  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.09 
 
 
430 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.353178  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3707  RND family efflux transporter MFP subunit  33.49 
 
 
437 aa  201  1.9999999999999998e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00914113 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3864  ABC transporter related  37.08 
 
 
418 aa  200  3e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.606554  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2610  RND family efflux transporter MFP subunit  36.5 
 
 
493 aa  198  2.0000000000000003e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.787622 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2041  secretion protein HlyD  34.58 
 
 
398 aa  197  3e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0365  membrane-fusion protein  42.12 
 
 
394 aa  196  7e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3605  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.51 
 
 
429 aa  179  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3523  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.5 
 
 
438 aa  177  2e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.51854  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0815  membrane-fusion protein  34.57 
 
 
434 aa  172  9e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3171  RND family efflux transporter MFP subunit  31.34 
 
 
416 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000224755  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0800  RND family efflux transporter MFP subunit  31.67 
 
 
416 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000642362  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0820  HlyD family secretion protein  31.51 
 
 
405 aa  163  7e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0832  RND family efflux transporter MFP subunit  32.29 
 
 
416 aa  160  3e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000487508  normal  0.99457 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0825  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.03 
 
 
410 aa  159  1e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000019827  hitchhiker  0.00000000236896 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1259  RND family efflux transporter MFP subunit  30.66 
 
 
415 aa  159  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3536  RND family efflux transporter MFP subunit  32.03 
 
 
416 aa  159  1e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000721535  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3456  RND family efflux transporter MFP subunit  31.62 
 
 
409 aa  157  4e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000285815  normal  0.0164702 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1617  secretion protein HlyD  34.1 
 
 
408 aa  152  8e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0160623  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1671  HlyD family secretion protein  34.1 
 
 
408 aa  152  8.999999999999999e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1298  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.91 
 
 
410 aa  152  1e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.61066  normal  0.83964 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2617  secretion protein HlyD  32.26 
 
 
385 aa  152  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000106145  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2037  secretion protein HlyD  28.84 
 
 
446 aa  149  9e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.35853  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2317  RND family efflux transporter MFP subunit  32.15 
 
 
393 aa  142  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.788366  normal  0.425659 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3282  RND family efflux transporter MFP subunit  29.74 
 
 
410 aa  141  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.68571  normal  0.617182 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3197  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.3 
 
 
387 aa  140  3e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.822347  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2042  secretion protein HlyD  30.96 
 
 
414 aa  139  1e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.617858  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2696  macrolide transporter subunit MacA  33.99 
 
 
370 aa  138  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.761507  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1597  macrolide transporter subunit MacA  33.99 
 
 
370 aa  138  2e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1339  RND family efflux transporter MFP subunit  31.65 
 
 
384 aa  138  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.611384  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2611  macrolide transporter subunit MacA  33.66 
 
 
370 aa  137  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1685  RND family efflux transporter MFP subunit  33.99 
 
 
387 aa  137  4e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261181  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0927  macrolide efflux protein MacA  29.57 
 
 
399 aa  137  5e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0725  HlyD family secretion protein  28.61 
 
 
397 aa  136  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.897812  normal  0.118835 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1101  RND family efflux transporter MFP subunit  33.21 
 
 
414 aa  136  5e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.402678  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2186  macrolide efflux protein MacA  29.5 
 
 
428 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0836  macrolide efflux protein MacA  29.5 
 
 
435 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0404665  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3531  secretion protein HlyD  28.22 
 
 
400 aa  136  7.000000000000001e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445744  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1857  secretion protein HlyD  33.99 
 
 
390 aa  136  8e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1791  macrolide efflux protein MacA  33.65 
 
 
420 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1084  MacA  29.77 
 
 
402 aa  134  3e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1970  secretion protein HlyD  29.85 
 
 
390 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0699832  normal  0.38447 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5333  RND family efflux transporter MFP subunit  27.98 
 
 
397 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.037024 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3415  secretion protein HlyD  27.98 
 
 
397 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.89814  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4953  RND family efflux transporter MFP subunit  27.98 
 
 
397 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.162755  normal  0.0662922 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33770  hypothetical protein  30.96 
 
 
391 aa  133  6e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.127582  hitchhiker  0.00383681 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2831  syringolide efflux protein SyfC  31.16 
 
 
383 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.580145  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1833  RND family efflux transporter MFP subunit  27.34 
 
 
464 aa  132  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.36059  unclonable  0.000000000906287 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6201  putative accessory protein to ABC-type macrolide transport protein MacB  31.73 
 
 
430 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.655632  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2871  hypothetical protein  30.96 
 
 
391 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.518674  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3235  secretion protein HlyD  30 
 
 
391 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.185962  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3721  putative membrane-fusion protein  29.51 
 
 
569 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.45383  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5132  RND family efflux transporter MFP subunit  31.6 
 
 
445 aa  132  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2214  secretion protein HlyD  31.48 
 
 
382 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155205  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2160  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.47 
 
 
390 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.337788  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1395  macrolide transporter subunit MacA  33.22 
 
 
371 aa  129  1.0000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.458807  normal  0.0347786 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1863  RND family efflux transporter MFP subunit  29.17 
 
 
393 aa  129  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3559  RND family efflux transporter MFP subunit  27.76 
 
 
396 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0492868  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1375  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.72 
 
 
401 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.140784  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0563  secretion protein HlyD  27.55 
 
 
456 aa  127  4.0000000000000003e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3533  RND family efflux transporter MFP subunit  33.66 
 
 
409 aa  126  6e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.722317 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0573  macrolide secretion protein MacA  27.21 
 
 
455 aa  125  1e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.00000000000123833  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1007  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.21 
 
 
398 aa  125  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1670  macrolide transporter subunit MacA  34.27 
 
 
348 aa  125  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3781  RND family efflux transporter MFP subunit  34 
 
 
407 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1256  membrane fusion protein (MFP) family auxiliary transport protein  26.7 
 
 
397 aa  124  3e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>