More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1123 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_1123  phosphate transporter  100 
 
 
335 aa  658    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000161634  normal  0.936007 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1777  phosphate transporter  67.26 
 
 
336 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5168  phosphate transporter  67.56 
 
 
336 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0592  phosphate transporter  67.56 
 
 
336 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1805  phosphate transporter  67.26 
 
 
336 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.3367  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1406  phosphate transporter  66.96 
 
 
336 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.596183  normal  0.662482 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1313  inorganic phosphate transporter  67.56 
 
 
336 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1891  phosphate transporter  67.26 
 
 
336 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00123921  hitchhiker  0.0000000789991 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1249  phosphate transporter  67.86 
 
 
336 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0366515  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1188  phosphate transporter  67.86 
 
 
336 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.198901  normal  0.0620893 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2706  phosphate transporter  67.07 
 
 
336 aa  445  1.0000000000000001e-124  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.906266  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6211  phosphate transporter  67.26 
 
 
336 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.450178  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1868  phosphate transporter  67.26 
 
 
336 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3358  phosphate transporter  67.07 
 
 
336 aa  445  1.0000000000000001e-124  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.450825 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1973  phosphate transporter  66.07 
 
 
336 aa  441  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137015  normal  0.10663 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1470  phosphate transporter  66.07 
 
 
336 aa  443  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2000  phosphate transporter  65.67 
 
 
335 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1687  phosphate transporter  66.37 
 
 
336 aa  437  1e-121  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2395  phosphate transporter  67.86 
 
 
336 aa  434  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.38618  normal  0.093565 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1161  phosphate transporter family protein  69.55 
 
 
336 aa  431  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2245  phosphate transporter family protein  69.55 
 
 
336 aa  431  1e-120  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.513907  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1398  phosphate transporter family protein  69.55 
 
 
336 aa  431  1e-120  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.476301  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0008  phosphate transporter family protein  69.55 
 
 
336 aa  431  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0756499  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2410  phosphate transporter family protein  69.55 
 
 
354 aa  431  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.201685  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2284  phosphate transporter family protein  69.55 
 
 
336 aa  431  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2185  phosphate transporter family protein  69.55 
 
 
354 aa  431  1e-120  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.552455  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0678  phosphate transporter  66.14 
 
 
336 aa  433  1e-120  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1881  phosphate transporter  68.88 
 
 
336 aa  433  1e-120  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1888  phosphate transporter family protein  69.55 
 
 
336 aa  431  1e-120  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.527303  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3015  putative low-affinity phosphate transporter lipoprotein transmembrane  65.48 
 
 
336 aa  429  1e-119  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.360288  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0917  phosphate transporter  69.64 
 
 
336 aa  428  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  normal  0.295731 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1152  phosphate transporter  65.48 
 
 
336 aa  428  1e-119  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1399  phosphate transporter  65.19 
 
 
336 aa  419  1e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1404  phosphate transporter  64.58 
 
 
336 aa  415  9.999999999999999e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5348  phosphate transporter  66.56 
 
 
336 aa  407  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1792  phosphate transporter  68.22 
 
 
336 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.60749  normal  0.0142834 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0559  phosphate transporter  65.5 
 
 
313 aa  400  9.999999999999999e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3761  putative low-affinity phosphate transport protein  60.91 
 
 
336 aa  380  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.253043  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2031  phosphate transporter  58.66 
 
 
334 aa  359  5e-98  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.357489  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1678  phosphate transporter  57.45 
 
 
334 aa  355  5.999999999999999e-97  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.397083  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0043  phosphate transporter  58.51 
 
 
331 aa  355  6.999999999999999e-97  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2335  phosphate transporter  58.68 
 
 
336 aa  348  6e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.90978  normal  0.624995 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2523  phosphate transporter  58.66 
 
 
338 aa  348  7e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0983692  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2946  phosphate transporter  57.88 
 
 
334 aa  347  1e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.747547  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4378  phosphate transporter  54.07 
 
 
353 aa  345  5e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0749407 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0843  phosphate transporter  53.5 
 
 
332 aa  345  6e-94  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.240506  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3605  phosphate transporter  58.23 
 
 
332 aa  342  5e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3393  phosphate transporter  57.75 
 
 
334 aa  342  5.999999999999999e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0414241  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3161  phosphate transporter  58.81 
 
 
336 aa  341  9e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4384  phosphate transporter  54.83 
 
 
352 aa  341  1e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.622735  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5202  phosphate transporter  60.19 
 
 
334 aa  338  5e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.204566 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4228  phosphate transporter  54.83 
 
 
352 aa  337  9.999999999999999e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4361  phosphate transporter  54.21 
 
 
352 aa  335  5.999999999999999e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5972  phosphate transporter  58.43 
 
 
334 aa  335  5.999999999999999e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.115846 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1414  phosphate transporter  59.44 
 
 
329 aa  335  9e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5472  phosphate transporter  60.19 
 
 
333 aa  332  6e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.57273 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0775  phosphate transporter  61.27 
 
 
328 aa  331  1e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.123226 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0027  hypothetical protein  54.87 
 
 
331 aa  330  3e-89  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0028  hypothetical protein  54.87 
 
 
331 aa  330  3e-89  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8018  phosphate transporter  58.68 
 
 
335 aa  328  9e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.325586  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0190  phosphate transporter  54.49 
 
 
336 aa  317  2e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.177955 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0717  phosphate transporter  52.69 
 
 
337 aa  310  2e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0892  phosphate transporter  50.9 
 
 
334 aa  305  8.000000000000001e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0180  phosphate transporter  51.94 
 
 
334 aa  301  9e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3131  phosphate transporter  57.1 
 
 
345 aa  300  3e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.150684  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3781  phosphate transporter  47.65 
 
 
333 aa  296  4e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.843739  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0389  phosphate transporter, putative  45.85 
 
 
333 aa  290  3e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.214855  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0450  phosphate transporter  51.2 
 
 
333 aa  288  7e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.275833  normal  0.360764 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3131  phosphate transporter  47.04 
 
 
333 aa  287  2e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00242659  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4358  phosphate transporter  47.45 
 
 
335 aa  285  8e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000836516  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4135  phosphate transporter  45.62 
 
 
333 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0161666  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3865  phosphate transporter  48.18 
 
 
333 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0587  phosphate transporter  45.62 
 
 
332 aa  280  3e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.527473  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1646  phosphate transporter  46.44 
 
 
329 aa  276  3e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0952  phosphate transporter  47.92 
 
 
336 aa  276  3e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.775195  normal  0.447908 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2887  phosphate transporter  48.56 
 
 
370 aa  275  8e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2385  phosphate transporter  43.24 
 
 
332 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.15597  normal  0.883996 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0740  phosphate transporter  48.16 
 
 
336 aa  274  2.0000000000000002e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.552844 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0762  phosphate transporter  51.29 
 
 
343 aa  273  3e-72  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.217274  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2117  phosphate transporter  47.4 
 
 
332 aa  273  3e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0147275  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1485  phosphate transporter  48.53 
 
 
332 aa  273  4.0000000000000004e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000164623  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0563  phosphate transporter family protein  45.17 
 
 
332 aa  270  2e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1966  phosphate transporter  41.6 
 
 
391 aa  270  2e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0416469 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2275  phosphate transporter  48.53 
 
 
337 aa  270  2e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.265898  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1960  phosphate transporter  49.52 
 
 
334 aa  270  2.9999999999999997e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2876  phosphate transporter  48.56 
 
 
332 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000456437  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0549  phosphate permease  45.17 
 
 
332 aa  270  2.9999999999999997e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1237  phosphate transporter  46.36 
 
 
326 aa  268  1e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0129  phosphate transporter  47.7 
 
 
338 aa  267  2e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4259  phosphate transporter  47.48 
 
 
332 aa  266  4e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2658  phosphate transporter  45.91 
 
 
332 aa  265  7e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3585  phosphate transporter  45.6 
 
 
333 aa  265  1e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0121636  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3021  phosphate transporter  46.63 
 
 
332 aa  264  2e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3421  phosphate transporter  49.38 
 
 
337 aa  262  4.999999999999999e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3185  phosphate transporter  45.11 
 
 
336 aa  261  1e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.987096 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0688  phosphate transporter  42.5 
 
 
335 aa  260  2e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000897538  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0703  phosphate transporter  42.5 
 
 
335 aa  260  2e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000147408  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0300  phosphate transporter  49.84 
 
 
332 aa  255  8e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.942291  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0589  phosphate transporter  46.65 
 
 
385 aa  255  9e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1083  phosphate transporter  46.84 
 
 
336 aa  253  4.0000000000000004e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>