More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1096 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1096  major facilitator transporter  100 
 
 		 399 aa  771    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.454099 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2328  major facilitator transporter  49.86 
 
 		 406 aa  339  5.9999999999999996e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0114986  normal  0.818656 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2064  major facilitator superfamily transporter  46.53 
 
 		 409 aa  310  2e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.380103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0995  putative membrane transport protein  47.09 
 
 		 416 aa  301  2e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3614  major facilitator transporter  46.22 
 
 		 401 aa  226  4e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2783  major facilitator transporter  34.12 
 
 		 409 aa  186  8e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.35447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5891  major facilitator transporter  37.12 
 
 		 402 aa  177  3e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2478  major facilitator transporter  33.42 
 
 		 398 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.456918  normal  0.405324 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2819  major facilitator transporter  33.42 
 
 		 408 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.601855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3222  major facilitator superfamily MFS_1  34.01 
 
 		 408 aa  170  4e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.40917  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6507  major facilitator superfamily MFS_1  36.48 
 
 		 393 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3562  major facilitator transporter  33.86 
 
 		 428 aa  161  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.66626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4758  major facilitator transporter  32.65 
 
 		 417 aa  160  4e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0130699 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4473  major facilitator superfamily permease  33.42 
 
 		 402 aa  159  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544881  normal  0.908548 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1830  major facilitator transporter  31.84 
 
 		 398 aa  156  7e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.121743  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1740  major facilitator transporter  29.87 
 
 		 403 aa  152  8e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.162816  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0232  major facilitator superfamily MFS_1  28.69 
 
 		 380 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6693  major facilitator superfamily MFS_1  25.5 
 
 		 402 aa  100  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.302951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0527  MDR-like permease  24.16 
 
 		 387 aa  100  3e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2528  multidrug resistance protein  21.98 
 
 		 398 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000149033  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4478  major facilitator transporter  31.03 
 
 		 398 aa  90.5  5e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2183  multidrug resistance protein  21.7 
 
 		 400 aa  89.7  7e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.532431  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2463  multidrug resistance protein, putative  22.28 
 
 		 398 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.190584  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2222  multidrug resistance protein  22.28 
 
 		 398 aa  88.6  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000329957  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4226  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.06 
 
 		 465 aa  85.5  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.693691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1842  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.19 
 
 		 516 aa  83.6  0.000000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2184  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  24.19 
 
 		 514 aa  83.6  0.000000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.208618  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2753  major facilitator superfamily MFS_1  27.39 
 
 		 397 aa  82.8  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1604  major facilitator family transporter  25.92 
 
 		 417 aa  82.8  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4479  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.54 
 
 		 505 aa  80.1  0.00000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1898  major facilitator superfamily MFS_1  26.52 
 
 		 424 aa  79.7  0.00000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.164459  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5112  major facilitator superfamily protein  24.8 
 
 		 418 aa  79.3  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01565  predicted transporter  25.67 
 
 		 417 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2047  major facilitator superfamily MFS_1  25.67 
 
 		 417 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.349329  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01555  hypothetical protein  25.67 
 
 		 417 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1803  major facilitator family transporter  25.67 
 
 		 417 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1670  major facilitator family transporter  25.67 
 
 		 417 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2034  major facilitator transporter  25.67 
 
 		 417 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1514  major facilitator superfamily MFS_1  28.35 
 
 		 393 aa  79  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1917  major facilitator transporter  25.7 
 
 		 417 aa  79  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1919  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.58 
 
 		 513 aa  79  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0639753  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2306  major facilitator family transporter  25.67 
 
 		 417 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.200396 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4089  major facilitator transporter  28.87 
 
 		 415 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1285  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.8 
 
 		 469 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.151462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2219  major facilitator transporter  24.42 
 
 		 384 aa  78.2  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0098  EmrB/QacA family drug resistance transporter  21.77 
 
 		 508 aa  78.2  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.700736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5217  major facilitator superfamily MFS_1  24.44 
 
 		 404 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.877552  normal  0.0536068 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5744  major facilitator transporter  28.95 
 
 		 415 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.310357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3808  major facilitator transporter  28.95 
 
 		 415 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.150016  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4560  major facilitator transporter  28.95 
 
 		 415 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0558  major facilitator transporter  31.75 
 
 		 384 aa  77.8  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.257784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1653  major facilitator superfamily MFS_1  26.17 
 
 		 392 aa  77  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0146262  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2256  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.63 
 
 		 507 aa  77.4  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0484017  normal  0.408162 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5072  major facilitator family transporter  26.16 
 
 		 425 aa  76.3  0.0000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.348741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2238  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  28.14 
 
 		 507 aa  76.3  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.382837  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0420  major facilitator transporter  24.45 
 
 		 422 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0913  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.14 
 
 		 507 aa  75.9  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.31457 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3983  major facilitator transporter  30.88 
 
 		 415 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.134584 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03040  putative MFS transporter  31.93 
 
 		 501 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.479989  hitchhiker  0.0000743098 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.9 
 
 		 509 aa  74.7  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01157  multidrug resistance membrane translocase  28.27 
 
 		 501 aa  75.1  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.487953  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4220  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.72 
 
 		 510 aa  75.1  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.663619  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2281  major facilitator transporter  25.47 
 
 		 421 aa  75.1  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0316528 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1028  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.71 
 
 		 483 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.634124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5122  major facilitator transporter  25.74 
 
 		 414 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4425  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.71 
 
 		 483 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146647  normal  0.357206 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0857  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.27 
 
 		 510 aa  74.7  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4945  major facilitator transporter  25.74 
 
 		 414 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.395119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5767  major facilitator family transporter  26.21 
 
 		 438 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.554362  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66510  putative MFS transporter  26.21 
 
 		 438 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5185  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.88 
 
 		 525 aa  73.9  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.804488  normal  0.490544 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4750  major facilitator transporter  23.89 
 
 		 404 aa  73.6  0.000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3110  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.91 
 
 		 418 aa  73.6  0.000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3229  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.61 
 
 		 494 aa  73.2  0.000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.436149 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0331  MFS family transporter  31.36 
 
 		 515 aa  73.2  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2042  major facilitator superfamily MFS_1  22.69 
 
 		 422 aa  73.2  0.000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.316098  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1388  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.71 
 
 		 483 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4335  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.71 
 
 		 483 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.39024 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3908  major facilitator transporter  32.14 
 
 		 462 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4370  major facilitator transporter  31.55 
 
 		 462 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.701723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2343  major facilitator superfamily MFS_1  23.61 
 
 		 422 aa  72.4  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5292  major facilitator superfamily MFS_1  24.38 
 
 		 407 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.479452 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.05 
 
 		 521 aa  72  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0394  major facilitator transporter  25.74 
 
 		 414 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0416  general substrate transporter  26.89 
 
 		 424 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.225586 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2482  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.22 
 
 		 493 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15461  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2817  major facilitator transporter  28.7 
 
 		 426 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.850013  normal  0.439964 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4422  major facilitator transporter  32.12 
 
 		 410 aa  71.6  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.179143  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2326  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.23 
 
 		 579 aa  71.6  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000685947  hitchhiker  0.0026086 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2689  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.65 
 
 		 511 aa  71.2  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0761069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0414  major facilitator transporter  25.72 
 
 		 473 aa  71.2  0.00000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.444257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2456  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.74 
 
 		 418 aa  70.9  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.202004  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1289  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.23 
 
 		 529 aa  70.9  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.433628  normal  0.278369 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2674  major facilitator transporter  29.17 
 
 		 426 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4300  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  33.9 
 
 		 504 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4447  major facilitator transporter  29.95 
 
 		 415 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.362184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5055  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.97 
 
 		 522 aa  70.5  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.663135  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1662  major facilitator superfamily MFS_1  26.59 
 
 		 381 aa  70.5  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.127475 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.73 
 
 		 514 aa  70.5  0.00000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4471  major facilitator transporter  31.55 
 
 		 462 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.475899  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>