49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1033 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_1033  hypothetical protein  100 
 
 
367 aa  734    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0067  hypothetical protein  65.65 
 
 
364 aa  476  1e-133  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.396841  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2812  hypothetical protein  66.95 
 
 
363 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0873158  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2959  hypothetical protein  59.4 
 
 
371 aa  444  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.569097  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2501  hypothetical protein  58.58 
 
 
371 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0697497  normal  0.340753 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2789  hypothetical protein  58.4 
 
 
372 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.278452  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0582  hypothetical protein  36.92 
 
 
361 aa  261  1e-68  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.43804  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1375  hypothetical protein  36.49 
 
 
361 aa  260  2e-68  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0661  hypothetical protein  36.63 
 
 
361 aa  260  3e-68  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.238233  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0149  hypothetical protein  39.11 
 
 
375 aa  231  2e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0138  hypothetical protein  39.28 
 
 
375 aa  215  9.999999999999999e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0479408  normal  0.0468167 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1387  hypothetical protein  35.42 
 
 
357 aa  209  7e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.669214  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0118  hypothetical protein  34.86 
 
 
367 aa  192  1e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2655  hypothetical protein  34.81 
 
 
650 aa  99.8  8e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1110  hypothetical protein  28.27 
 
 
379 aa  83.2  0.000000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1282  hypothetical protein  33.79 
 
 
632 aa  80.9  0.00000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0481957  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3511  hypothetical protein  26.64 
 
 
375 aa  80.9  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1493  hypothetical protein  33.79 
 
 
632 aa  81.3  0.00000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00418774  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30590  hypothetical protein  35.97 
 
 
369 aa  77.8  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4168  hypothetical protein  28.64 
 
 
367 aa  75.9  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3840  hypothetical protein  27.24 
 
 
376 aa  72.4  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26710  hypothetical protein  37.84 
 
 
450 aa  64.3  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.376533 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1987  putative integral membrane protein  32.48 
 
 
552 aa  63.2  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.285044  hitchhiker  0.000714658 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4048  hypothetical protein  23.57 
 
 
358 aa  62.4  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2709  membrane protein-like protein  30 
 
 
631 aa  57.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399622  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1227  hypothetical protein  30.94 
 
 
534 aa  58.2  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2548  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  32.84 
 
 
691 aa  57.8  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.678112 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2315  hypothetical protein  26.92 
 
 
609 aa  57.4  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.973812  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2067  hypothetical protein  30.08 
 
 
638 aa  57  0.0000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0012683  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0517  hypothetical protein  23.48 
 
 
363 aa  57  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0247  YccS/YhfK family integral membrane protein  27.94 
 
 
706 aa  49.7  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3946  YccS/YhfK family integral membrane protein  27.94 
 
 
706 aa  49.7  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2166  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  24.63 
 
 
719 aa  49.7  0.00009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0513514  normal  0.798484 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3703  YccS/YhfK family integral membrane protein  27.21 
 
 
706 aa  48.9  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2534  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  30.6 
 
 
651 aa  48.9  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2586  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  30.6 
 
 
651 aa  48.9  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3664  integral membrane protein, YccS/YhfK family  27.15 
 
 
695 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.423889  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3664  integral membrane protein, YccS/YhfK family  27.15 
 
 
695 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3772  hypothetical protein  27.15 
 
 
695 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.503591 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3738  integral membrane protein YccS/YhfK family  27.15 
 
 
695 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0105534 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4581  YccS/YhfK family integral membrane protein  28.06 
 
 
696 aa  47.8  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.271308  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2466  hypothetical protein  27.35 
 
 
372 aa  47.4  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3835  YccS/YhfK family integral membrane protein  26.49 
 
 
695 aa  47.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1143  hypothetical protein  23.83 
 
 
352 aa  47  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.602769  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01106  hypothetical protein  29.45 
 
 
680 aa  45.1  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1850  hypothetical protein  28.46 
 
 
332 aa  44.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.245812  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3199  hypothetical protein  33.11 
 
 
345 aa  43.9  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0290  hypothetical protein  21.9 
 
 
351 aa  43.9  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2001  YccS/YhfK family integral membrane protein  30.77 
 
 
756 aa  43.5  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0304152  hitchhiker  0.00152336 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>