118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1027 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1027  TonB, C-terminal  100 
 
 		 235 aa  463  1e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2306  TonB-like protein  36.94 
 
 		 246 aa  82  0.000000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0143972 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4168  TonB family protein  35.87 
 
 		 268 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4374  TonB family protein  35.87 
 
 		 268 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4240  TonB family protein  34.78 
 
 		 268 aa  68.6  0.00000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2053  TonB like protein  27.75 
 
 		 256 aa  66.2  0.0000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2420  TonB family protein  35.87 
 
 		 285 aa  66.2  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1434  TonB family protein  32.98 
 
 		 290 aa  65.9  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214443  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4002  TonB-like  35.11 
 
 		 292 aa  65.5  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0938  TonB-like  34.04 
 
 		 286 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1243  TonB-like protein  32.98 
 
 		 292 aa  62.4  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.122386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0720  TonB, C-terminal  29.44 
 
 		 216 aa  60.8  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.274821 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3308  TonB family protein  33.7 
 
 		 239 aa  60.8  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0373  TonB family protein  33.93 
 
 		 250 aa  60.5  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2391  TonB family protein  35.48 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.533007 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0174  TonB-dependent colicin receptor protein, putative  22.73 
 
 		 248 aa  58.5  0.00000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.301208  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2906  TonB-like  36.51 
 
 		 235 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155829  normal  0.22869 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5308  TonB family protein  32.11 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.162445 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0453  TonB-like protein  37.66 
 
 		 289 aa  57.4  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832201  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2276  TonB family protein  35 
 
 		 336 aa  57.4  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000987559  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5217  TonB family protein  32.11 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.315671 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3402  hypothetical protein  28.57 
 
 		 431 aa  56.6  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.904792 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5356  TonB family protein  32.11 
 
 		 243 aa  57  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.772268  normal  0.884832 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2822  TonB-like  31.87 
 
 		 114 aa  56.2  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.628558  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0441  TonB family protein  27.73 
 
 		 305 aa  55.8  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0624564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1047  putative TonB-dependent colicin receptor protein  24.85 
 
 		 279 aa  55.8  0.0000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.710809  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4086  TonB family protein  29.67 
 
 		 295 aa  55.5  0.0000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0148952  normal  0.766616 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0183  TonB family protein  36.73 
 
 		 251 aa  54.3  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.144886  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0233  TonB family protein  29.67 
 
 		 269 aa  54.3  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5557  TonB-like  35.45 
 
 		 248 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02490  hypothetical protein  39.74 
 
 		 270 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.104412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2287  TonB, C-terminal  39.74 
 
 		 277 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00257812  decreased coverage  0.0000380211 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2359  TonB-like  37.89 
 
 		 278 aa  52.8  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3668  TonB family protein  30.95 
 
 		 244 aa  52.4  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2481  tonB protein  39.74 
 
 		 273 aa  52  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0773  TonB family protein  26.82 
 
 		 251 aa  52  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0279  hypothetical protein  39.74 
 
 		 264 aa  52  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2801  TonB family protein  24.03 
 
 		 282 aa  52.4  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0443  TonB family protein  32.29 
 
 		 284 aa  52  0.000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2981  TonB-dependent receptor, putative  31.18 
 
 		 289 aa  52  0.000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1435  TonB family protein  32.97 
 
 		 292 aa  51.2  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0067  tonB protein  31.25 
 
 		 248 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2216  TonB-like protein  32.89 
 
 		 235 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.226683 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4192  TonB family protein  29.21 
 
 		 273 aa  51.2  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5125  TonB family protein  35.79 
 
 		 263 aa  50.1  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1307  putative energy transducer TonB  25 
 
 		 263 aa  50.4  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.217867  normal  0.59147 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1537  TonB family protein  30.61 
 
 		 261 aa  49.7  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0951  TonB family protein  30.67 
 
 		 295 aa  49.7  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00168123  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5982  tonB protein  31.52 
 
 		 317 aa  49.7  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0559  TonB family protein  23.89 
 
 		 220 aa  49.7  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.334223 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2541  periplasmic protein TonB  28.87 
 
 		 272 aa  49.3  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  4.70786e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2994  TonB family protein  41.79 
 
 		 294 aa  48.9  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.7532  normal  0.152882 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21710  TonB-like protein, ferric siderophore transporter  35.9 
 
 		 275 aa  48.9  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2067  TonB family protein  28.74 
 
 		 324 aa  48.9  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.207889  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21840  TonB C-terminal domain protein, ferric siderophore transporter  35.9 
 
 		 286 aa  48.5  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0453954  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0689  TonB protein  32.22 
 
 		 250 aa  48.5  0.00008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0675786  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1487  TonB family protein  29.35 
 
 		 386 aa  48.5  0.00008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.39629 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0218  TonB-like  37.66 
 
 		 285 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  37.66 
 
 		 249 aa  48.1  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08080  TonB protein  35.9 
 
 		 274 aa  47.8  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0116  TonB family C-terminal domain protein  32.98 
 
 		 258 aa  48.1  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2717  TonB family protein  29.73 
 
 		 281 aa  47.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2153  TonB-like  28.18 
 
 		 276 aa  47.4  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.897555  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1845  TonB family protein  34.18 
 
 		 268 aa  47.4  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1020  TonB family protein  36.36 
 
 		 290 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00268646  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0165  TonB family protein  30.08 
 
 		 244 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0716  TonB family protein  23.48 
 
 		 212 aa  47.8  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.347415  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1499  TonB family protein  29.73 
 
 		 281 aa  47.4  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0204221  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3339  TonB family protein  36.36 
 
 		 284 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000004715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0824  TonB family protein  32.97 
 
 		 291 aa  47.4  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0481121 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2512  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  26.37 
 
 		 411 aa  47  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.929963  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2639  TonB family protein  37.18 
 
 		 285 aa  46.6  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2101  TonB family protein  32.22 
 
 		 171 aa  47  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.483665  normal  0.582725 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2605  TonB-like protein  36.36 
 
 		 273 aa  46.2  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.430219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0134  TonB domain-containing protein  29.79 
 
 		 267 aa  46.2  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3890  TonB domain-containing protein  29.79 
 
 		 267 aa  46.6  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.544733 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4082  TonB family protein  29.79 
 
 		 267 aa  46.6  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1564  TonB family protein  25.44 
 
 		 219 aa  46.2  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1053  TonB family protein  36.36 
 
 		 289 aa  45.8  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0250994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0737  TonB family protein  32.26 
 
 		 251 aa  45.8  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1544  TonB-like  23.2 
 
 		 248 aa  45.8  0.0006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3533  TonB family protein  36.36 
 
 		 266 aa  45.8  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0725055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3986  TonB family protein  36.36 
 
 		 266 aa  45.4  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.152676 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0754  TonB family protein  27.27 
 
 		 317 aa  45.4  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.278027  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0936  TonB family protein  27.37 
 
 		 283 aa  44.7  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.408733  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0135  TonB, C-terminal  41.07 
 
 		 274 aa  44.7  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4542  TonB-like  28.42 
 
 		 265 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0451  TonB family protein  25.51 
 
 		 242 aa  44.3  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.103845  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1242  protein TonB  30.49 
 
 		 283 aa  44.7  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.510655  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1944  TonB family protein  29.25 
 
 		 242 aa  44.3  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2301  TonB family protein  29.25 
 
 		 242 aa  44.3  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0922  putative TonB protein  35.37 
 
 		 294 aa  43.9  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.702209  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10610  TonB protein  39.29 
 
 		 280 aa  44.3  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.94051  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3641  TonB-like  23.4 
 
 		 251 aa  43.9  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0965  TonB family protein  38.16 
 
 		 283 aa  44.3  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4259  TonB family protein  30.93 
 
 		 241 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  42.86 
 
 		 270 aa  43.9  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1566  TonB family protein  34.62 
 
 		 251 aa  43.9  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2405  TonB family protein  27.96 
 
 		 310 aa  44.3  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3111  TonB, C-terminal  36.76 
 
 		 174 aa  43.5  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>