More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0974 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0974  acetate kinase  100 
 
 		 393 aa  808    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.724455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3608  acetate kinase  57.79 
 
 		 398 aa  433  1e-120  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.880493  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3569  acetate kinase  53.22 
 
 		 411 aa  417  9.999999999999999e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44030  acetate kinase  52.79 
 
 		 394 aa  412  1e-114  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5046  acetate kinase  54.43 
 
 		 398 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3686  acetate kinase  54.96 
 
 		 393 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.320417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1128  acetate kinase  54.55 
 
 		 401 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.323074 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5745  acetate kinase  50 
 
 		 392 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.466778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7294  acetate kinase  51.55 
 
 		 396 aa  395  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.975242  normal  0.796012 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3806  acetate kinase  50.51 
 
 		 394 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.449542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2706  acetate kinase  50.9 
 
 		 398 aa  394  1e-108  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2633  acetate kinase  51.02 
 
 		 392 aa  391  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1027  acetate kinase  52.53 
 
 		 400 aa  388  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.529199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2377  acetate kinase  51.42 
 
 		 393 aa  391  1e-107  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000961127 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1203  acetate kinase  50 
 
 		 396 aa  381  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2655  acetate kinase  49.87 
 
 		 405 aa  379  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1954  acetate kinase  48.86 
 
 		 400 aa  377  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.151784  normal  0.354384 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2978  acetate kinase  49.38 
 
 		 404 aa  374  1e-102  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158659 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1467  acetate kinase  48.73 
 
 		 402 aa  372  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2138  putative phosphoketolase  50.63 
 
 		 1305 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0981949  normal  0.111283 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2060  acetate kinase  49.23 
 
 		 390 aa  368  1e-101  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2189  acetate kinase  48.59 
 
 		 397 aa  367  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0563  acetate kinase  48.98 
 
 		 400 aa  364  2e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0534  acetate kinase  48.75 
 
 		 405 aa  362  9e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1568  acetate kinase  48.84 
 
 		 400 aa  358  6e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.489684  normal  0.769699 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0199  acetate kinase  46.65 
 
 		 408 aa  358  8e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.111809  normal  0.353737 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1295  acetate kinase  48.2 
 
 		 402 aa  355  5e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0053  acetate kinase  47.94 
 
 		 402 aa  354  1e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2235  acetate kinase  48.84 
 
 		 390 aa  353  2e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3225  acetate kinase  49.75 
 
 		 1230 aa  353  2.9999999999999997e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0741  acetate kinase  48.87 
 
 		 395 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.660011 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2099  acetate kinase  46.92 
 
 		 403 aa  352  7e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6909  acetate kinase  48.34 
 
 		 401 aa  351  1e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0632  acetate kinase  49.21 
 
 		 382 aa  350  4e-95  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.214656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1895  acetate kinase  46.43 
 
 		 391 aa  348  1e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5415  acetate kinase  49.5 
 
 		 402 aa  348  1e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0865  acetate kinase  45.95 
 
 		 404 aa  346  4e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4216  acetate kinase  46.98 
 
 		 389 aa  344  2e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00713648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6098  acetate kinase  47.92 
 
 		 389 aa  342  9e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00705419 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3824  acetate kinase  49.08 
 
 		 385 aa  341  1e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56864  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0498  acetate kinase  48.48 
 
 		 400 aa  340  2e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2798  acetate kinase  45.89 
 
 		 416 aa  339  5e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00189465 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1589  acetate kinase  47.73 
 
 		 394 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4427  acetate kinase  48.85 
 
 		 393 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.209023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3310  putative phosphoketolase  49.24 
 
 		 1230 aa  336  2.9999999999999997e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4317  acetate kinase  48.85 
 
 		 393 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.113396 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3116  acetate kinase  48.73 
 
 		 1228 aa  335  1e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.550572  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3055  acetate kinase  46.95 
 
 		 392 aa  333  3e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1823  acetate kinase  46.48 
 
 		 399 aa  332  1e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0754  acetate kinase  47.1 
 
 		 410 aa  331  2e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.433474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3453  acetate kinase  46.62 
 
 		 412 aa  330  3e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.698429 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0408  acetate kinase  48.09 
 
 		 389 aa  329  4e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0750002  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2692  acetate kinase  49.61 
 
 		 396 aa  329  6e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3495  acetate kinase  49 
 
 		 402 aa  329  6e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4871  acetate kinase  49 
 
 		 402 aa  329  6e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3252  acetate kinase  44.05 
 
 		 403 aa  327  2.0000000000000001e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.770051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1810  acetate kinase  47.31 
 
 		 394 aa  327  3e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1295  acetate kinase  45.59 
 
 		 402 aa  327  3e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.317937  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0356  acetate kinase  45.5 
 
 		 397 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4675  acetate kinase  45.9 
 
 		 391 aa  326  4.0000000000000003e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0275467 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2914  acetate kinase  48.84 
 
 		 396 aa  325  1e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1254  acetate kinase  48.84 
 
 		 396 aa  324  2e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0416  acetate kinase  46.41 
 
 		 392 aa  323  2e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0625  acetate kinase  44.99 
 
 		 407 aa  323  4e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5898  acetate kinase  46.12 
 
 		 404 aa  323  4e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.239661 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1915  acetate kinase  44.33 
 
 		 399 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.305645  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2610  acetate kinase  46.55 
 
 		 371 aa  318  1e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.328672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1060  acetate kinase  46.29 
 
 		 392 aa  316  4e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2656  acetate kinase  46.29 
 
 		 392 aa  316  4e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.508707  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2799  acetate kinase  45.78 
 
 		 392 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0562  acetate kinase  44.99 
 
 		 405 aa  313  3.9999999999999997e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0120  acetate kinase  45.78 
 
 		 392 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.188552  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0144  acetate kinase  45.78 
 
 		 392 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1285  acetate kinase  45.78 
 
 		 392 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6386  acetate kinase  45.41 
 
 		 394 aa  312  6.999999999999999e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1523  acetate kinase  44.42 
 
 		 396 aa  312  7.999999999999999e-84  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4284  acetate kinase  46.84 
 
 		 399 aa  311  1e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.155669 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4653  acetate kinase  41.62 
 
 		 408 aa  310  2e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.350055  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0560  acetate kinase  44.72 
 
 		 413 aa  309  5.9999999999999995e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.844026 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2975  acetate kinase  43.91 
 
 		 391 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.409912  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3816  acetate kinase  46.67 
 
 		 399 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal  0.604346 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0422  acetate kinase  45.03 
 
 		 371 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0372136  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1669  propionate kinase  43.83 
 
 		 407 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.575965  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4372  acetate kinase  43 
 
 		 412 aa  301  1e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.920791  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0051  acetate kinase  44.9 
 
 		 397 aa  299  7e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.942272  normal  0.0351432 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1621  acetate kinase  41.67 
 
 		 393 aa  297  2e-79  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.880699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1936  acetate kinase  38.02 
 
 		 404 aa  289  5.0000000000000004e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0334  acetate kinase  39.69 
 
 		 401 aa  289  6e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0938  acetate kinase  39.65 
 
 		 405 aa  288  9e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000904206  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0933  acetate kinase  39.25 
 
 		 397 aa  288  1e-76  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.666104  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1133  acetate kinase  42.43 
 
 		 401 aa  287  2e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3176  acetate kinase  40.81 
 
 		 412 aa  283  3.0000000000000004e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10210  acetate kinase  38.17 
 
 		 398 aa  282  6.000000000000001e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000154307  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2216  acetate kinase  38.92 
 
 		 372 aa  282  9e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2188  acetate kinase  38.82 
 
 		 372 aa  281  1e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1271  acetate kinase  40.2 
 
 		 406 aa  279  5e-74  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1695  acetate kinase  38.15 
 
 		 398 aa  278  8e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0395303  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1977  acetate kinase  38.15 
 
 		 398 aa  278  1e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1325  acetate kinase  43.62 
 
 		 397 aa  278  1e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_5006  hypothetical protein  42.27 
 
 		 385 aa  278  2e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.9079 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>