More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0946 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_0946  phosphoglucosamine mutase  100 
 
 
450 aa  905    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2168  phosphoglucosamine mutase  68.01 
 
 
447 aa  611  9.999999999999999e-175  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2021  phosphoglucosamine mutase  66.89 
 
 
451 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1176  phosphoglucosamine mutase  67.34 
 
 
451 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.873875  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1188  phosphoglucosamine mutase  67.34 
 
 
451 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.282955 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1528  phosphoglucosamine mutase  66.89 
 
 
447 aa  604  1.0000000000000001e-171  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.226614  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4441  phosphoglucosamine mutase  66.44 
 
 
451 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1719  phosphoglucosamine mutase  66.44 
 
 
447 aa  603  1.0000000000000001e-171  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.905768 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2027  phosphoglucosamine mutase  66.22 
 
 
447 aa  598  1e-170  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0485  phosphoglucosamine mutase  65.85 
 
 
463 aa  598  1e-170  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.519608  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0881  phosphoglucosamine mutase  65.33 
 
 
452 aa  599  1e-170  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.389268  normal  0.0916323 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1264  phosphoglucosamine mutase  65.78 
 
 
452 aa  600  1e-170  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.595538 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1738  phosphoglucosamine mutase  68.08 
 
 
450 aa  598  1e-170  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.738973  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2186  phosphoglucosamine mutase  66.67 
 
 
447 aa  597  1e-169  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.24566 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0818  phosphoglucosamine mutase  67.11 
 
 
451 aa  597  1e-169  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1270  phosphoglucosamine mutase  67.11 
 
 
451 aa  597  1e-169  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1299  phosphoglucosamine mutase  67.11 
 
 
451 aa  597  1e-169  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61277  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2860  phosphoglucosamine mutase  65.11 
 
 
452 aa  593  1e-168  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.321505  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0573  phosphoglucosamine mutase  64.82 
 
 
467 aa  585  1e-166  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0791443  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1484  phosphoglucosamine mutase  64.82 
 
 
452 aa  587  1e-166  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0779  phosphoglucosamine mutase  64.82 
 
 
452 aa  587  1e-166  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1135  phosphoglucosamine mutase  65.69 
 
 
458 aa  587  1e-166  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1617  phosphoglucosamine mutase  64.82 
 
 
452 aa  587  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.953372  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2774  phosphoglucosamine mutase  65.04 
 
 
452 aa  587  1e-166  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0322399  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1290  phosphoglucosamine mutase  64.82 
 
 
452 aa  587  1e-166  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.985716  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0578  phosphoglucosamine mutase  64.82 
 
 
452 aa  587  1e-166  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1514  phosphoglucosamine mutase  64.82 
 
 
452 aa  587  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.149991  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1477  phosphoglucosamine mutase  63.31 
 
 
444 aa  563  1.0000000000000001e-159  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0785  phosphoglucosamine mutase  64.08 
 
 
453 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  unclonable  0.000000175981 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2381  phosphoglucosamine mutase  63.31 
 
 
444 aa  563  1.0000000000000001e-159  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2013  phosphoglucosamine mutase  62.53 
 
 
443 aa  550  1e-155  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.993566  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2850  phosphoglucosamine mutase  62.19 
 
 
443 aa  549  1e-155  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.45347 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1270  phosphoglucosamine mutase  59.83 
 
 
457 aa  545  1e-154  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.190809  normal  0.380438 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2609  phosphoglucosamine mutase  61.3 
 
 
443 aa  547  1e-154  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2619  phosphoglucosamine mutase  62.64 
 
 
444 aa  546  1e-154  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.317995  normal  0.824493 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0856  phosphoglucosamine mutase  60.09 
 
 
450 aa  543  1e-153  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.304504  normal  0.368726 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2626  phosphoglucosamine mutase  62.33 
 
 
445 aa  540  9.999999999999999e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.122301  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4923  phosphoglucosamine mutase  61.02 
 
 
447 aa  535  1e-151  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.106408 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2815  phosphoglucosamine mutase  61.16 
 
 
444 aa  538  1e-151  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3610  phosphoglucosamine mutase  60.49 
 
 
445 aa  536  1e-151  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00189073  normal  0.0821499 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01688  phosphoglucosamine mutase  58.67 
 
 
447 aa  533  1e-150  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000297141  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2567  phosphoglucosamine mutase  58.74 
 
 
451 aa  525  1e-148  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.474953  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1573  phosphoglucosamine mutase  57.94 
 
 
447 aa  528  1e-148  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.126154  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3449  phosphoglucosamine mutase  58.57 
 
 
445 aa  521  1e-147  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3553  phosphoglucosamine mutase  61.38 
 
 
445 aa  521  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3483  phosphoglucosamine mutase  61.38 
 
 
445 aa  521  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0848624  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3483  phosphoglucosamine mutase  61.38 
 
 
445 aa  521  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3589  phosphoglucosamine mutase  61.38 
 
 
445 aa  521  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2243  phosphoglucosamine mutase  60.49 
 
 
452 aa  524  1e-147  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.6083  normal  0.124274 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3651  phosphoglucosamine mutase  61.38 
 
 
445 aa  521  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1011  phosphoglucosamine mutase  60.09 
 
 
450 aa  520  1e-146  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.79008  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3350  phosphoglucosamine mutase  59.96 
 
 
445 aa  519  1e-146  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0843387  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0956  phosphoglucosamine mutase  59.1 
 
 
445 aa  519  1e-146  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0280063  normal  0.292928 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03041  phosphoglucosamine mutase  60.71 
 
 
445 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0250482  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0531  phosphoglucosamine mutase  60.71 
 
 
445 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0782231  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4498  phosphoglucosamine mutase  60.71 
 
 
445 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0140787  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3661  phosphoglucosamine mutase  60.71 
 
 
445 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000185546  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3594  phosphoglucosamine mutase  60.71 
 
 
445 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000289716  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02992  hypothetical protein  60.71 
 
 
445 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0265797  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3472  phosphoglucosamine mutase  60.71 
 
 
445 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000247168  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3469  phosphoglucosamine mutase  60.63 
 
 
445 aa  514  1.0000000000000001e-145  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3368  phosphoglucosamine mutase  60.71 
 
 
445 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000272746  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0730  phosphoglucosamine mutase  60.4 
 
 
444 aa  515  1.0000000000000001e-145  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0524  phosphoglucosamine mutase  60.71 
 
 
445 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0662864  hitchhiker  0.00167255 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1973  phosphoglucosamine mutase  58.13 
 
 
451 aa  514  1e-144  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0100286 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002605  phosphoglucosamine mutase  59.51 
 
 
446 aa  510  1e-143  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000248269  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4495  phosphoglucosamine mutase  58.68 
 
 
447 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.235157  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4185  phosphoglucosamine mutase  59.15 
 
 
447 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.599163 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0568  phosphoglucosamine mutase  59.64 
 
 
445 aa  505  9.999999999999999e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.468081  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0983  phosphoglucosamine mutase  58.5 
 
 
451 aa  508  9.999999999999999e-143  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0995172  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03402  phosphoglucosamine mutase  59.51 
 
 
446 aa  505  9.999999999999999e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0594  phosphoglucosamine mutase  58.93 
 
 
445 aa  505  9.999999999999999e-143  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.781134  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4582  phosphoglucosamine mutase  58.57 
 
 
446 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.922342  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1967  phosphoglucosamine mutase  60.18 
 
 
446 aa  506  9.999999999999999e-143  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000194402  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0485  phosphoglucosamine mutase  58.84 
 
 
445 aa  501  1e-141  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00237844  normal  0.220868 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4716  phosphoglucosamine mutase  58.57 
 
 
446 aa  504  1e-141  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0105558 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1847  phosphoglucosamine mutase  59.19 
 
 
447 aa  504  1e-141  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.310353  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1022  phosphoglucosamine mutase  57.96 
 
 
448 aa  501  1e-141  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00540573  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3065  phosphoglucosamine mutase  57.68 
 
 
445 aa  503  1e-141  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000179284  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0168  phosphoglucosamine mutase  59.28 
 
 
446 aa  503  1e-141  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000649392  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0803  phosphoglucosamine mutase  59.42 
 
 
445 aa  503  1e-141  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0442046  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1398  phosphoglucosamine mutase  57.71 
 
 
450 aa  502  1e-141  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.033665 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0985  phosphoglucosamine mutase  58.57 
 
 
445 aa  504  1e-141  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000240064  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0716  phosphoglucosamine mutase  58.13 
 
 
446 aa  501  1e-141  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.149315 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3566  phosphoglucosamine mutase  57.08 
 
 
445 aa  499  1e-140  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0054919  hitchhiker  0.00000589779 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1199  phosphoglucosamine mutase  57.74 
 
 
445 aa  499  1e-140  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2840  phosphoglucosamine mutase  57.82 
 
 
455 aa  498  1e-140  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2709  phosphoglucosamine mutase  58.05 
 
 
455 aa  501  1e-140  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1123  phosphoglucosamine mutase  57.98 
 
 
445 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000138646  unclonable  0.0000000000053894 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3285  phosphoglucosamine mutase  57.98 
 
 
445 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000526752  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1487  phosphoglucosamine mutase  57.42 
 
 
450 aa  500  1e-140  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.152305  normal  0.438843 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2888  phosphoglucosamine mutase  57.49 
 
 
450 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1333  phosphoglucosamine mutase  57.71 
 
 
450 aa  499  1e-140  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.951592  hitchhiker  0.00110502 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3018  phosphoglucosamine mutase  57.49 
 
 
450 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0396425 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0209  phosphoglucosamine mutase  57.43 
 
 
460 aa  498  1e-140  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2839  phosphoglucosamine mutase  57.37 
 
 
445 aa  498  1e-139  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000184945  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3244  phosphoglucosamine mutase  57.37 
 
 
445 aa  498  1e-139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000220965  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3422  phosphoglucosamine mutase  57.37 
 
 
445 aa  498  1e-139  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000143803  decreased coverage  0.000132803 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62840  phosphoglucosamine mutase  56.7 
 
 
445 aa  491  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1025  phosphoglucosamine mutase  57.3 
 
 
445 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0055133  hitchhiker  0.0000634577 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>