More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0928 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0928  thioredoxin  100 
 
 		 147 aa  306  8e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0651  thioredoxin  67.36 
 
 		 145 aa  212  9.999999999999999e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0618  thioredoxin  66.19 
 
 		 146 aa  206  1e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2304  thioredoxin  62.5 
 
 		 145 aa  202  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.258464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1161  thioredoxin  63.19 
 
 		 146 aa  202  1e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.403386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3416  thioredoxin  61.11 
 
 		 146 aa  199  7e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0102  thioredoxin  62.96 
 
 		 140 aa  199  9.999999999999999e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0053  thioredoxin  59.71 
 
 		 146 aa  199  9.999999999999999e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000803765  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0520  thioredoxin  63.31 
 
 		 145 aa  194  3e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.609436  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0504  thioredoxin  63.31 
 
 		 145 aa  194  3e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0235096 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1582  thioredoxin  61.81 
 
 		 145 aa  193  8.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.137556  normal  0.0376163 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3369  thioredoxin  59.03 
 
 		 145 aa  192  1e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1332  thioredoxin  59.72 
 
 		 159 aa  192  2e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.636016  normal  0.90337 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4857  thioredoxin  58.74 
 
 		 149 aa  185  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0651815  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1254  thioredoxin  60.99 
 
 		 144 aa  185  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1123  thioredoxin  58.27 
 
 		 145 aa  182  1.0000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3742  thioredoxin  59.03 
 
 		 147 aa  179  9.000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3451  thioredoxin  57.14 
 
 		 147 aa  175  2e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.560369  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0867  thioredoxin  55.56 
 
 		 140 aa  171  1.9999999999999998e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2977  thioredoxin  56.03 
 
 		 146 aa  168  2e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000101834  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0738  thioredoxin 2  54.07 
 
 		 140 aa  167  3e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3573  thioredoxin  54.01 
 
 		 140 aa  167  6e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4209  thioredoxin  56.85 
 
 		 151 aa  166  8e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558513 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7798  thioredoxin  51.37 
 
 		 146 aa  164  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.449565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0456  thioredoxin  53.28 
 
 		 140 aa  164  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0452  thioredoxin 2  53.28 
 
 		 140 aa  164  5e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3283  thioredoxin  53.96 
 
 		 147 aa  163  6.9999999999999995e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0428  thioredoxin  51.09 
 
 		 170 aa  163  9e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3906  thioredoxin  51.09 
 
 		 170 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4029  thioredoxin  51.09 
 
 		 170 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0405  thioredoxin  47.55 
 
 		 146 aa  162  2.0000000000000002e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2362  thioredoxin  51.49 
 
 		 144 aa  161  3e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1995  thioredoxin  51.49 
 
 		 144 aa  161  3e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0377  thioredoxin  50 
 
 		 145 aa  161  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.655114  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3833  thioredoxin  50.36 
 
 		 170 aa  160  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0452  thioredoxin  52.55 
 
 		 140 aa  160  5.0000000000000005e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.531645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2347  thioredoxin  53.85 
 
 		 147 aa  160  6e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0135047  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2401  thioredoxin  52.21 
 
 		 142 aa  160  7e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.85345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4481  thioredoxin  51.45 
 
 		 140 aa  159  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2099  thioredoxin  51.47 
 
 		 140 aa  158  2e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3392  thioredoxin  49.64 
 
 		 178 aa  159  2e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0397  thioredoxin  49.65 
 
 		 144 aa  156  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45140  thioredoxin 2, TxrC  52.48 
 
 		 144 aa  156  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4942  thioredoxin  49.65 
 
 		 144 aa  155  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5119  thioredoxin  48.95 
 
 		 144 aa  154  3e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.402757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3723  thioredoxin  48.2 
 
 		 146 aa  154  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.122043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1789  thioredoxin  52.11 
 
 		 144 aa  154  4e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2066  thioredoxin  51.41 
 
 		 144 aa  154  5.0000000000000005e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0918718  normal  0.219337 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2259  thioredoxin  49.64 
 
 		 148 aa  154  6e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5069  thioredoxin  48.95 
 
 		 144 aa  153  8e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1389  thioredoxin domain-containing protein  46.53 
 
 		 148 aa  152  1e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.276518  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0448  thioredoxin  46.53 
 
 		 145 aa  152  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.925505 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1524  thioredoxin  49.29 
 
 		 148 aa  152  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659124 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3727  Thioredoxin domain  49.62 
 
 		 156 aa  152  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0556  thioredoxin  51.77 
 
 		 144 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000127919 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2134  thioredoxin  50.36 
 
 		 139 aa  149  1e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.408487  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0054  thioredoxin, putative  48.18 
 
 		 142 aa  147  4e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2375  thioredoxin-related  48.55 
 
 		 143 aa  146  7e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.316536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0443  thioredoxin-like  48.23 
 
 		 144 aa  146  8e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.478708  normal  0.838572 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02476  thioredoxin 2  47.14 
 
 		 139 aa  145  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.953967  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1086  thioredoxin  47.14 
 
 		 139 aa  145  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0403998  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3819  thioredoxin 2  47.14 
 
 		 139 aa  145  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00147303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2739  thioredoxin 2  47.14 
 
 		 139 aa  145  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.025352  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1095  thioredoxin 2  47.14 
 
 		 139 aa  145  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0753217  normal  0.13577 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2869  thioredoxin 2  47.14 
 
 		 139 aa  145  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162737  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2735  thioredoxin 2  47.14 
 
 		 139 aa  145  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0139217  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02440  hypothetical protein  47.14 
 
 		 139 aa  145  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.934703  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2954  thioredoxin 2  47.14 
 
 		 139 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0189312  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2843  thioredoxin 2  47.86 
 
 		 139 aa  144  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2861  thioredoxin 2  47.86 
 
 		 139 aa  144  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.350907  normal  0.503198 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2865  thioredoxin 2  47.86 
 
 		 139 aa  144  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0216262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2759  thioredoxin 2  47.86 
 
 		 139 aa  144  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00143779  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2977  thioredoxin 2  47.86 
 
 		 139 aa  144  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0978039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0420  thioredoxin  47.06 
 
 		 142 aa  142  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4107  thioredoxin  45.71 
 
 		 141 aa  142  1e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000794835 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2231  thioredoxin  46.43 
 
 		 145 aa  142  1e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0118387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3067  thioredoxin 2  46.43 
 
 		 139 aa  142  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110629 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2633  thioredoxin 2  47.83 
 
 		 144 aa  141  3e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0747279  normal  0.647766 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05698  thioredoxin 2  48.55 
 
 		 162 aa  140  6e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0335  thioredoxin  45.71 
 
 		 140 aa  139  9.999999999999999e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3204  thioredoxin 2  44.76 
 
 		 145 aa  138  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0690  thioredoxin 2  47.83 
 
 		 144 aa  138  3e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.555698  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000083  thioredoxin 2  47.1 
 
 		 144 aa  137  6e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.396729  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3463  thioredoxin 2  44.06 
 
 		 145 aa  137  7e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.305081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3341  thioredoxin 2  44.06 
 
 		 145 aa  137  7e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.142551  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2236  thioredoxin  45.07 
 
 		 144 aa  135  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.773662  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3335  thioredoxin 2  45.71 
 
 		 139 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3746  thioredoxin 2  46.72 
 
 		 139 aa  134  4e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0426418  normal  0.35545 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0306  thioredoxin  43.66 
 
 		 143 aa  134  5e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00417001  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3491  thioredoxin 2  44.29 
 
 		 139 aa  133  7.000000000000001e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0854  thioredoxin 2  43.66 
 
 		 141 aa  127  6e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.615191  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0887  thioredoxin 2  45.07 
 
 		 141 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00834128  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2478  thioredoxin domain-containing protein  42.66 
 
 		 153 aa  125  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1845  thioredoxin 2  45.65 
 
 		 144 aa  121  4e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.227505  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6432  thioredoxin  43.48 
 
 		 160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.432921 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0456  thioredoxin  40.97 
 
 		 165 aa  115  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0500  thioredoxin  39.86 
 
 		 144 aa  114  3e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.874633 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5905  thioredoxin  39.31 
 
 		 144 aa  114  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3596  thioredoxin  42.14 
 
 		 150 aa  114  6e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.854397  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3665  thioredoxin  42.14 
 
 		 150 aa  112  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>