More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0926 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0926  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 539 aa  1089    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0106  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.5 
 
 		 540 aa  514  1e-144  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.33 
 
 		 541 aa  333  5e-90  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158854  normal  0.960341 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0443  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.57 
 
 		 541 aa  320  3.9999999999999996e-86  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2789  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.05 
 
 		 529 aa  297  3e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.017789  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1030  methyl-accepting chemotaxis protein  34.15 
 
 		 549 aa  211  4e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0916  methyl-accepting chemotaxis protein  27.59 
 
 		 543 aa  192  9e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000029497  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3709  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  35.42 
 
 		 546 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003151  methyl-accepting chemotaxis protein  26.79 
 
 		 541 aa  190  5.999999999999999e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00103096  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1662  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.47 
 
 		 550 aa  190  5.999999999999999e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3600  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.12 
 
 		 546 aa  190  5.999999999999999e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3311  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.43 
 
 		 547 aa  188  3e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.691655  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3063  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.37 
 
 		 533 aa  187  4e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.378908  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2825  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.64 
 
 		 570 aa  187  6e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000443347 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0461  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.24 
 
 		 569 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1902  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  37.22 
 
 		 547 aa  185  2.0000000000000003e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0619  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.36 
 
 		 634 aa  184  3e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1023  methyl-accepting chemotaxis protein  32.25 
 
 		 578 aa  184  3e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2845  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.62 
 
 		 549 aa  184  3e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000597879  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0339  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.51 
 
 		 558 aa  183  5.0000000000000004e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0400  methyl-accepting chemotaxis protein  30.95 
 
 		 549 aa  182  1e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.431065  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3811  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  37.94 
 
 		 532 aa  181  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0164007 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1033  methyl-accepting chemotaxis protein  29.91 
 
 		 533 aa  178  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4715  chemotaxis sensory transducer  33.05 
 
 		 713 aa  178  3e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233277  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2525  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.63 
 
 		 538 aa  177  3e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0167  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.39 
 
 		 540 aa  176  9.999999999999999e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0750  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  32.7 
 
 		 539 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0385  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.72 
 
 		 698 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0817491  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5279  putative chemotaxis transducer  32.14 
 
 		 712 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0493383  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61300  putative chemotaxis transducer  32.13 
 
 		 712 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.862971 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.66 
 
 		 634 aa  174  5e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0311  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.16 
 
 		 553 aa  173  5.999999999999999e-42  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000172296  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3345  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.81 
 
 		 542 aa  171  3e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0226154 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02418  hypothetical protein  30.05 
 
 		 578 aa  171  3e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0582  methyl-accepting chemotaxis protein  27.95 
 
 		 696 aa  171  4e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0935  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  28.9 
 
 		 528 aa  171  4e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.220244  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3379  methyl-accepting chemotaxis protein  32.39 
 
 		 559 aa  171  4e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4580  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.95 
 
 		 648 aa  171  4e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0108713 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3312  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.08 
 
 		 533 aa  170  6e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2000  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.79 
 
 		 560 aa  170  6e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0144557  normal  0.0324669 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26280  putative chemotaxis transducer  36.5 
 
 		 545 aa  170  6e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.917899 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2548  putative chemotaxis transducer  31.06 
 
 		 561 aa  170  8e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.271227  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1041  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.55 
 
 		 661 aa  169  9e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3300  methyl-accepting chemotaxis protein  28.42 
 
 		 535 aa  169  1e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.102754  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0962  methyl-accepting chemotaxis protein  32.68 
 
 		 643 aa  169  1e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000917898  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1963  chemotaxis sensory transducer  28.91 
 
 		 535 aa  169  1e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1714  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.4 
 
 		 673 aa  169  1e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.712235  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4053  methyl-accepting chemotaxis protein  30.61 
 
 		 634 aa  168  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0484  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.54 
 
 		 693 aa  168  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000150879 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2601  chemotaxis sensory transducer  33.02 
 
 		 569 aa  168  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.441915  normal  0.36116 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0821  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.04 
 
 		 545 aa  169  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000877148  hitchhiker  0.00000558474 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.77 
 
 		 533 aa  168  2e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3759  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.23 
 
 		 554 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0990388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.67 
 
 		 538 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2955  chemotaxis sensory transducer  34 
 
 		 497 aa  167  4e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0767  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.86 
 
 		 546 aa  167  5e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0467  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.2 
 
 		 693 aa  166  6.9999999999999995e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.285916  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0584  methyl-accepting chemotaxis transducer  32.29 
 
 		 647 aa  166  8e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.77697  normal  0.644217 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0809  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.79 
 
 		 532 aa  166  8e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.826751  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29800  putative chemotaxis transducer  30.84 
 
 		 561 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00431462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0837  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.94 
 
 		 554 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3299  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.4 
 
 		 554 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0173  methyl-accepting chemotaxis protein  32.13 
 
 		 639 aa  165  2.0000000000000002e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.01 
 
 		 637 aa  165  2.0000000000000002e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0167241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0623  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32 
 
 		 647 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.494937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2749  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.34 
 
 		 578 aa  164  3e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.274613  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3200  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.43 
 
 		 554 aa  164  3e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3964  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.73 
 
 		 535 aa  164  3e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000408371 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3856  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.79 
 
 		 640 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.825575 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0987  methyl-accepting chemotaxis protein  30.65 
 
 		 554 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3453  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.59 
 
 		 532 aa  164  5.0000000000000005e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0235494 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4401  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.6 
 
 		 695 aa  163  6e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.896591  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0612  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.05 
 
 		 543 aa  163  6e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0824  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.89 
 
 		 554 aa  163  7e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00067966 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1693  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.55 
 
 		 598 aa  163  7e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0850375  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2234  putative chemotaxis transducer  36.23 
 
 		 545 aa  163  9e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2326  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.93 
 
 		 547 aa  162  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1963  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 		 637 aa  162  1e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.870205  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3876  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.12 
 
 		 535 aa  162  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.74566  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0629  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  32.73 
 
 		 647 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.624074  hitchhiker  0.000681907 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1884  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.38 
 
 		 547 aa  162  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.114501  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2861  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.17 
 
 		 544 aa  162  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.445183 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1434  chemotaxis sensory transducer  29.75 
 
 		 530 aa  161  2e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2828  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.73 
 
 		 550 aa  162  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014913 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3199  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.89 
 
 		 554 aa  161  2e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.927661 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0525  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  31.11 
 
 		 632 aa  161  3e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2650  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 		 568 aa  161  3e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0476  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.88 
 
 		 830 aa  161  3e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03718  putative chemotaxis sensory protein  29.67 
 
 		 540 aa  160  4e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0343  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.65 
 
 		 547 aa  160  5e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0441023  normal  0.46066 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0237  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.49 
 
 		 632 aa  160  5e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.997473 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0354  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  33.77 
 
 		 630 aa  160  6e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3097  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.12 
 
 		 602 aa  160  7e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3768  chemotaxis sensory transducer  31.82 
 
 		 560 aa  160  8e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1091  chemotaxis sensory transducer  32.29 
 
 		 620 aa  159  9e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0174472  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3169  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.42 
 
 		 620 aa  159  1e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.225635  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4541  methyl-accepting chemotaxis protein  34.01 
 
 		 541 aa  159  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.726322  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2220  histidine kinase, HAMP region:Cache: chemotaxis sensory transducer  30.42 
 
 		 646 aa  159  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.071358  normal  0.520396 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0680  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.61 
 
 		 679 aa  159  1e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1221  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.41 
 
 		 564 aa  159  1e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000139892  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>