174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0613 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0613  preprotein translocase subunit SecB  100 
 
 		 152 aa  299  8.000000000000001e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1541  preprotein translocase subunit SecB  67.53 
 
 		 154 aa  201  3e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1124  preprotein translocase subunit SecB  59.86 
 
 		 159 aa  193  8.000000000000001e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2402  preprotein translocase subunit SecB  60.29 
 
 		 152 aa  179  1e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2185  protein translocase subunit secB  61.87 
 
 		 157 aa  174  4e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.893597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0269  preprotein translocase subunit SecB  50 
 
 		 156 aa  166  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0537  preprotein translocase subunit SecB  49.65 
 
 		 156 aa  166  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0419  preprotein translocase subunit SecB  53.1 
 
 		 157 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4178  preprotein translocase subunit SecB  48.95 
 
 		 156 aa  163  5.9999999999999996e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3205  preprotein translocase subunit SecB  51.7 
 
 		 159 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0665  preprotein translocase subunit SecB  51.7 
 
 		 159 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0178  preprotein translocase subunit SecB  51.7 
 
 		 159 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1414  preprotein translocase subunit SecB  51.7 
 
 		 159 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0481  preprotein translocase subunit SecB  51.7 
 
 		 159 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0500  preprotein translocase subunit SecB  51.7 
 
 		 159 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2841  preprotein translocase subunit SecB  51.7 
 
 		 159 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0231  preprotein translocase subunit SecB  51.7 
 
 		 172 aa  160  6e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00543911 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0449  preprotein translocase subunit SecB  51.13 
 
 		 160 aa  158  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.513958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0212  preprotein translocase subunit SecB  51.75 
 
 		 172 aa  158  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.162983 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3855  preprotein translocase subunit SecB  50.68 
 
 		 152 aa  158  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.138411  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0356  preprotein translocase subunit SecB  53.44 
 
 		 173 aa  157  5e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0685148 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0716  preprotein translocase subunit SecB  51.49 
 
 		 166 aa  156  7e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.946363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1953  protein-export protein SecB  51.41 
 
 		 149 aa  155  1e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000705897  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2771  preprotein translocase subunit SecB  50.77 
 
 		 163 aa  155  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2865  preprotein translocase subunit SecB  50.77 
 
 		 164 aa  155  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.794301 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2240  preprotein translocase subunit SecB  50.77 
 
 		 164 aa  155  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.274715  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1650  protein-export protein SecB  49.28 
 
 		 174 aa  155  2e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.833903  normal  0.583875 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2909  preprotein translocase subunit SecB  50.77 
 
 		 159 aa  155  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2854  preprotein translocase subunit SecB  50.77 
 
 		 164 aa  155  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6183  preprotein translocase subunit SecB  50.77 
 
 		 160 aa  155  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1816  protein-export protein SecB  53.33 
 
 		 167 aa  153  9e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0364683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2127  preprotein translocase, SecB subunit  56.39 
 
 		 149 aa  152  1e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1786  protein-export protein SecB  56.39 
 
 		 149 aa  152  1e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2537  preprotein translocase subunit SecB  51.47 
 
 		 155 aa  152  2e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.849005  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0930  preprotein translocase subunit SecB  47.65 
 
 		 155 aa  152  2e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.603252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3813  preprotein translocase subunit SecB  48.94 
 
 		 153 aa  150  5e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0940  protein-export protein SecB  44.44 
 
 		 181 aa  149  1e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.743949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3900  preprotein translocase subunit SecB  47.62 
 
 		 155 aa  149  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.192717 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4087  preprotein translocase subunit SecB  47.62 
 
 		 155 aa  149  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0889  preprotein translocase subunit SecB  48.28 
 
 		 150 aa  149  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.098397  normal  0.554562 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3919  preprotein translocase subunit SecB  47.62 
 
 		 155 aa  149  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3981  preprotein translocase subunit SecB  47.62 
 
 		 155 aa  149  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.572141 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4026  preprotein translocase subunit SecB  47.62 
 
 		 155 aa  149  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1945  protein-export protein SecB  46.9 
 
 		 173 aa  148  3e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0307  preprotein translocase subunit SecB  53.62 
 
 		 172 aa  147  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03467  export protein SecB  46.94 
 
 		 155 aa  147  5e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0096  protein-export protein SecB  46.94 
 
 		 155 aa  147  5e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4982  preprotein translocase subunit SecB  46.94 
 
 		 155 aa  147  5e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4037  preprotein translocase subunit SecB  46.94 
 
 		 155 aa  147  5e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4113  preprotein translocase subunit SecB  46.94 
 
 		 155 aa  147  5e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3821  preprotein translocase subunit SecB  46.94 
 
 		 155 aa  147  5e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3946  preprotein translocase subunit SecB  46.94 
 
 		 155 aa  147  5e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.738209 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03418  hypothetical protein  46.94 
 
 		 155 aa  147  5e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0099  preprotein translocase subunit SecB  46.94 
 
 		 155 aa  147  6e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0041  preprotein translocase subunit SecB  50.37 
 
 		 169 aa  147  7e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.815394 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0254  preprotein translocase subunit SecB  54.48 
 
 		 172 aa  146  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0126  preprotein translocase subunit SecB  46.94 
 
 		 155 aa  145  1.0000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2025  protein-export protein SecB  47.26 
 
 		 178 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2825  preprotein translocase subunit SecB  54.33 
 
 		 150 aa  145  3e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3502  preprotein translocase subunit SecB  54.33 
 
 		 150 aa  145  3e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.444299  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4100  protein-export protein SecB  49.23 
 
 		 154 aa  144  6e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.154363  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4388  preprotein translocase, SecB subunit  48.2 
 
 		 165 aa  143  7.0000000000000006e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2571  preprotein translocase subunit SecB  49.31 
 
 		 188 aa  143  7.0000000000000006e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00740585 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4816  preprotein translocase subunit SecB  46.05 
 
 		 156 aa  142  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.348641  hitchhiker  0.000175665 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4082  preprotein translocase subunit SecB  45.77 
 
 		 156 aa  142  2e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.908003  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3940  preprotein translocase subunit SecB  45.45 
 
 		 179 aa  142  2e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4363  preprotein translocase subunit SecB  44.37 
 
 		 158 aa  142  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1312  preprotein translocase subunit SecB  48.15 
 
 		 155 aa  141  3e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.655485  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0062  preprotein translocase subunit SecB  47.92 
 
 		 159 aa  141  3e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4138  preprotein translocase subunit SecB  46.48 
 
 		 158 aa  141  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0072  preprotein translocase subunit SecB  46.48 
 
 		 158 aa  141  3e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0078  preprotein translocase subunit SecB  46.48 
 
 		 158 aa  141  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0034  preprotein translocase subunit SecB  50.38 
 
 		 164 aa  140  5e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4215  preprotein translocase subunit SecB  48.23 
 
 		 161 aa  140  8e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0048  protein translocase subunit secB  46.76 
 
 		 164 aa  139  9.999999999999999e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3164  preprotein translocase subunit SecB  45.39 
 
 		 165 aa  139  9.999999999999999e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3696  preprotein translocase subunit SecB  50.37 
 
 		 164 aa  138  3e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2015  protein-export protein SecB  42.96 
 
 		 172 aa  138  3e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00389495 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0179  preprotein translocase subunit SecB  46.53 
 
 		 158 aa  138  3e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0135  preprotein translocase subunit SecB  45.14 
 
 		 172 aa  137  4.999999999999999e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3282  preprotein translocase subunit SecB  46.31 
 
 		 168 aa  137  4.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4875  preprotein translocase subunit SecB  47.52 
 
 		 163 aa  136  8.999999999999999e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1556  preprotein translocase subunit SecB  45 
 
 		 148 aa  136  1e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000144211  normal  0.156074 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3804  preprotein translocase subunit SecB  48.18 
 
 		 162 aa  135  1e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.903933  normal  0.687684 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4019  preprotein translocase subunit SecB  46.32 
 
 		 157 aa  135  2e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0412  preprotein translocase subunit SecB  42.86 
 
 		 161 aa  135  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.704473 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1213  preprotein translocase subunit SecB  44.78 
 
 		 173 aa  135  2e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3614  preprotein translocase subunit SecB  45.59 
 
 		 169 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.825013  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4468  preprotein translocase subunit SecB  45.65 
 
 		 162 aa  134  3.0000000000000003e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00890854 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2802  preprotein translocase subunit SecB  45.71 
 
 		 160 aa  134  3.0000000000000003e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.221932  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5053  preprotein translocase subunit SecB  42.86 
 
 		 161 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.112175  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2256  preprotein translocase subunit SecB  47.92 
 
 		 162 aa  134  6.0000000000000005e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2227  preprotein translocase subunit SecB  47.92 
 
 		 162 aa  134  6.0000000000000005e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4926  preprotein translocase subunit SecB  42.86 
 
 		 161 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.183537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2346  protein-export protein SecB  47.41 
 
 		 164 aa  133  7.000000000000001e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0798372  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00541  preprotein translocase subunit SecB  44.44 
 
 		 169 aa  133  8e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0042  preprotein translocase subunit SecB  47.52 
 
 		 161 aa  133  9e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1702  preprotein translocase subunit SecB  49.28 
 
 		 161 aa  133  9.999999999999999e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0465  preprotein translocase subunit SecB  49.28 
 
 		 161 aa  133  9.999999999999999e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0336  preprotein translocase subunit SecB  43.24 
 
 		 161 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.523386  normal  0.6169 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>