47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0584 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_0584  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
551 aa  1134    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0719  glycoside hydrolase family protein  52.75 
 
 
566 aa  599  1e-170  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1369  glycoside hydrolase family protein  48.06 
 
 
582 aa  523  1e-147  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2460  glycoside hydrolase family 57  46.32 
 
 
568 aa  489  1e-137  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2839  glycosyl hydrolase, family 57  46.32 
 
 
568 aa  489  1e-137  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1432  glycoside hydrolase family protein  45.54 
 
 
570 aa  488  1e-136  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2060  glycosy hydrolase family protein  44.46 
 
 
574 aa  463  1e-129  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.725097  normal  0.224311 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0777  glycoside hydrolase family 57  43.54 
 
 
566 aa  462  1e-129  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2072  glycoside hydrolase, family 57  44.07 
 
 
577 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1107  glycoside hydrolase family protein  43.52 
 
 
580 aa  441  9.999999999999999e-123  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.185203  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0509  glycoside hydrolase family protein  41.55 
 
 
575 aa  438  1e-121  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1528  glycoside hydrolase family 57  42.68 
 
 
580 aa  433  1e-120  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000278955 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0960  glycoside hydrolase family protein  42.26 
 
 
584 aa  419  1e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.285068 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3464  glycoside hydrolase family 57  38.95 
 
 
728 aa  344  2e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3401  glycoside hydrolase family 57  39.13 
 
 
728 aa  341  2e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0999  glycoside hydrolase family 57  34.14 
 
 
674 aa  339  5.9999999999999996e-92  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0138  glycoside hydrolase family 57  38.16 
 
 
726 aa  332  9e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.806114  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0149  glycoside hydrolase family 57  37.97 
 
 
726 aa  331  2e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00221085  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0856  glycoside hydrolase family protein  36.62 
 
 
732 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0131  glycoside hydrolase family protein  37.59 
 
 
726 aa  327  3e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0840945  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3255  hypothetical protein  36.62 
 
 
729 aa  325  1e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.36573  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2957  alpha-mannosidase  37.08 
 
 
695 aa  325  1e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0408  glycoside hydrolase family 57  35.73 
 
 
729 aa  323  7e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3177  glycoside hydrolase family protein  36.53 
 
 
734 aa  319  7.999999999999999e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.392002 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0135  glycoside hydrolase family protein  38.31 
 
 
722 aa  309  8e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000920685  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0027  glycoside hydrolase family protein  35.56 
 
 
731 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0675  glycoside hydrolase family 57  32.75 
 
 
1042 aa  301  2e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3035  glycoside hydrolase family protein  35.05 
 
 
744 aa  297  3e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2965  glycoside hydrolase family 57  33.16 
 
 
749 aa  296  6e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.993077  normal  0.662325 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3153  glycoside hydrolase family 57  32.98 
 
 
749 aa  295  1e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4047  glycoside hydrolase family 57  34.57 
 
 
747 aa  294  2e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.422577 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3440  family 57 glycoside hydrolase  33.45 
 
 
744 aa  293  5e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1516  glycoside hydrolase family protein  34.11 
 
 
759 aa  288  2e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.757577  normal  0.533903 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4927  glycoside hydrolase family 57  35.23 
 
 
743 aa  280  4e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.269999  normal  0.543005 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0770  glycoside hydrolase family 57  30.9 
 
 
829 aa  266  5e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0803  glycoside hydrolase family protein  30.97 
 
 
1162 aa  238  2e-61  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0734  glycoside hydrolase family protein  29.55 
 
 
1022 aa  194  2e-48  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.983175  normal  0.257164 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0985  glycoside hydrolase family protein  27 
 
 
994 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.369995  normal  0.376092 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1616  glycoside hydrolase family protein  26.33 
 
 
1006 aa  159  2e-37  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1866  glycoside hydrolase family protein  25.49 
 
 
1000 aa  155  1e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2138  glycoside hydrolase family 57  25.45 
 
 
902 aa  73.2  0.00000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.205932  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0210  glycoside hydrolase family protein  23.66 
 
 
609 aa  62.8  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.044129  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1371  glycoside hydrolase family protein  24.16 
 
 
606 aa  57.8  0.0000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0932  glycoside hydrolase family protein  22.26 
 
 
1187 aa  51.2  0.00005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.26895  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4460  glycoside hydrolase family protein  27.74 
 
 
811 aa  47.4  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0202939 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0021  glycoside hydrolase family protein  27.61 
 
 
786 aa  45.1  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1401  AAA ATPase  26.45 
 
 
360 aa  43.5  0.01  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>