More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0575 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0575  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 227 aa  458  9.999999999999999e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00284025  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1073  two-component system response regulator transcription regulator protein  43.91 
 
 		 237 aa  198  6e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0139958  normal  0.232974 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0939  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.48 
 
 		 237 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.155156 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1004  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.04 
 
 		 237 aa  194  8.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4943  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  44.69 
 
 		 236 aa  194  9e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4162  OmpR-family response regulator  44.3 
 
 		 232 aa  192  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.789041  normal  0.397671 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1661  two component transcriptional regulator  42.17 
 
 		 245 aa  190  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0475888 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4991  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.17 
 
 		 245 aa  190  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0655006 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2530  two component transcriptional regulator  40.09 
 
 		 242 aa  190  1e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.279936  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0922  DNA-binding response regulator  42.17 
 
 		 234 aa  182  3e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1686  DNA-binding response regulator  42.17 
 
 		 242 aa  182  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0151733  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1841  DNA-binding response regulator  42.17 
 
 		 242 aa  182  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2638  DNA-binding response regulator  42.17 
 
 		 242 aa  182  3e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.55029  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0736  DNA-binding response regulator  42.17 
 
 		 242 aa  182  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.632099  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1664  DNA-binding response regulator  42.17 
 
 		 242 aa  182  3e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.922311  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1455  DNA-binding response regulator  42.17 
 
 		 242 aa  182  3e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0427  DNA-binding response regulator  42.17 
 
 		 234 aa  182  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0835186  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4276  two component transcriptional regulator  41.52 
 
 		 236 aa  181  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.886118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1879  two component transcriptional regulator  42.31 
 
 		 234 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0517303 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1355  two component transcriptional regulator  41.45 
 
 		 234 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.454645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1316  two component transcriptional regulator  41.45 
 
 		 234 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4580  two component transcriptional regulator  42.31 
 
 		 234 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1436  two component transcriptional regulator  42.31 
 
 		 234 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1414  two component transcriptional regulator  42.31 
 
 		 234 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0954  two component transcriptional regulator  42.17 
 
 		 296 aa  177  9e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.605306  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5235  two component transcriptional regulator  39.91 
 
 		 228 aa  175  6e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0432  two component transcriptional regulator  38.05 
 
 		 237 aa  175  7e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000322009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0028  two component transcriptional regulator  39.65 
 
 		 268 aa  174  7e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0390  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.94 
 
 		 237 aa  172  5e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.708283  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4704  two component transcriptional regulator  39.47 
 
 		 228 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0100205  normal  0.152582 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0583  response regulator receiver domain-containing protein  40.43 
 
 		 231 aa  170  2e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000029507  normal  0.0148942 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6247  two component transcriptional regulator  41.23 
 
 		 245 aa  170  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3159  two component transcriptional regulator  40.17 
 
 		 228 aa  167  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0060  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  35.81 
 
 		 235 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.475352  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5416  two component transcriptional regulator  37.99 
 
 		 237 aa  165  5e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1060  two component transcriptional regulator  38.94 
 
 		 230 aa  160  1e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0438  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.83 
 
 		 246 aa  160  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.173423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0424  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.39 
 
 		 246 aa  159  4e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.116445  hitchhiker  0.0000956185 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4742  two component transcriptional regulator  37.28 
 
 		 271 aa  157  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.683328  normal  0.766945 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3520  two component transcriptional regulator  38.26 
 
 		 259 aa  154  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.235883  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0543  response regulator transcription regulator protein  37.39 
 
 		 246 aa  153  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0623013  normal  0.919777 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11680  two-component regulator  37.18 
 
 		 238 aa  153  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1073  DNA-binding response regulator  36.75 
 
 		 238 aa  152  5e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0640  two component transcriptional regulator  40.27 
 
 		 233 aa  149  4e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.772339  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0511  phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB  41.18 
 
 		 234 aa  148  6e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.473137 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2474  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.04 
 
 		 227 aa  148  8e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0950849  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  39.19 
 
 		 226 aa  146  2.0000000000000003e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1991  two component transcriptional regulator  39.82 
 
 		 235 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.64 
 
 		 237 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0552  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.72 
 
 		 226 aa  145  4.0000000000000006e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.496663 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6791  two component transcriptional regulator  41.15 
 
 		 198 aa  145  6e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0454459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0059  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  37.33 
 
 		 242 aa  145  6e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4918  two component transcriptional regulator  39.82 
 
 		 234 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.134814 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5261  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.91 
 
 		 237 aa  144  9e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.909356  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0707  winged helix family two component transcriptional regulator  39.91 
 
 		 222 aa  144  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0603  two component transcriptional regulator  39.01 
 
 		 233 aa  142  3e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0519325  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0485  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  39.29 
 
 		 227 aa  143  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.537934  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0781  two component transcriptional regulator  38.46 
 
 		 233 aa  142  4e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.174075 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0893  winged helix family two component transcriptional regulator  38.46 
 
 		 233 aa  142  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1333  response regulator receiver protein  39.45 
 
 		 222 aa  142  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.40527  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4122  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.53 
 
 		 223 aa  142  4e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1413  DNA-binding response regulator  35.45 
 
 		 223 aa  142  5e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1453  DNA-binding response regulator  35.45 
 
 		 223 aa  142  5e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1215  two component transcriptional regulator  35.43 
 
 		 223 aa  142  6e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533573  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1351  DNA-binding response regulator  35.91 
 
 		 223 aa  141  6e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0499  winged helix family two component transcriptional regulator  37.17 
 
 		 229 aa  141  6e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3993  DNA-binding response regulator  35.91 
 
 		 223 aa  141  8e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1193  response regulator  35.45 
 
 		 223 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1389  DNA-binding response regulator  35.45 
 
 		 223 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2294  two component transcriptional regulator  39.64 
 
 		 228 aa  140  9.999999999999999e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.305192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1588  DNA-binding response regulator  35.4 
 
 		 230 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0588  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.01 
 
 		 226 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.944339  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1191  response regulator  35.45 
 
 		 223 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0202  two component transcriptional regulator  38.84 
 
 		 233 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.382528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0124  two component transcriptional regulator  38.22 
 
 		 227 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.352403 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0769  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.43 
 
 		 236 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8215  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.94 
 
 		 226 aa  139  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0772  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.67 
 
 		 233 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1442  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 227 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0208535  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0005  two component transcriptional regulator  35.04 
 
 		 238 aa  139  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000487758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1563  DNA-binding response regulator  35.59 
 
 		 231 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1213  DNA-binding response regulator  35 
 
 		 223 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203275  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0838  DNA-binding response regulator  35.59 
 
 		 231 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2216  two component transcriptional regulator  37.39 
 
 		 224 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1312  DNA-binding response regulator  35 
 
 		 223 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0641  DNA-binding response regulator  35.59 
 
 		 231 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.381849  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0515  DNA-binding response regulator  35.59 
 
 		 231 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1359  DNA-binding response regulator  35.59 
 
 		 231 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0644  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.63 
 
 		 236 aa  139  4.999999999999999e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1374  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.11 
 
 		 219 aa  138  6e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000555295  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0818  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.64 
 
 		 236 aa  138  7e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.501115  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1748  DNA-binding response regulator  35.59 
 
 		 389 aa  138  7e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1491  two component transcriptional regulator  38.33 
 
 		 236 aa  138  7e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00391258 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0700  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.39 
 
 		 226 aa  138  7.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.768939  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1155  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.37 
 
 		 230 aa  138  8.999999999999999e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.560017  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1487  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.17 
 
 		 232 aa  137  1e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.487145  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0835  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.37 
 
 		 222 aa  137  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000540746 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.68 
 
 		 230 aa  137  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000466515  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2549  response regulator receiver  37.16 
 
 		 222 aa  136  2e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2910  response regulator receiver  36.94 
 
 		 230 aa  137  2e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>