More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0551 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0551  PAS  100 
 
 		 1026 aa  2104    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.425664 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2811  PAS  48.65 
 
 		 1023 aa  476  1e-133  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0211559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1896  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.86 
 
 		 865 aa  446  1e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2934  PAS  36.31 
 
 		 955 aa  412  1e-113  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000914767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4037  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  52.02 
 
 		 659 aa  412  1e-113  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3006  PAS  41.3 
 
 		 1560 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.755684 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1441  PAS  43.01 
 
 		 794 aa  404  1e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.876573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1614  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.35 
 
 		 873 aa  404  1e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.499982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0244  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.5 
 
 		 1066 aa  387  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3549  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.69 
 
 		 982 aa  389  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.288363 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3846  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.07 
 
 		 860 aa  389  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0484  multi-sensor histidine kinase  32.2 
 
 		 1255 aa  389  1e-106  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.908962 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3714  PAS  39.5 
 
 		 1028 aa  382  1e-104  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.101634 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3872  PAS  36.23 
 
 		 853 aa  375  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0973  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.02 
 
 		 1064 aa  373  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1449  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.67 
 
 		 945 aa  370  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1009  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  48.54 
 
 		 655 aa  369  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3366  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.86 
 
 		 762 aa  363  8e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2314  sensory box histidine kinase/response regulator  39.34 
 
 		 982 aa  361  3e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581555  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0420  PAS  46.46 
 
 		 787 aa  359  1.9999999999999998e-97  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0516903 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2831  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.77 
 
 		 1407 aa  357  3.9999999999999996e-97  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.160519  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4210  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.2 
 
 		 1110 aa  356  1e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000219546 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1464  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.29 
 
 		 1135 aa  346  1e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.396763 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3821  Cache sensor hybrid histidine kinase  46.94 
 
 		 759 aa  343  1e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0769557 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2946  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  46.56 
 
 		 777 aa  342  2e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3648  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.45 
 
 		 1237 aa  342  2e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.289797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1622  PAS  37.73 
 
 		 802 aa  341  2.9999999999999998e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.2135  normal  0.458803 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2954  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.24 
 
 		 1127 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0960  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.07 
 
 		 1245 aa  337  7.999999999999999e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2847  PAS  40.12 
 
 		 764 aa  335  4e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.445085  normal  0.0351705 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3965  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.6 
 
 		 1158 aa  333  1e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.342093 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1722  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.64 
 
 		 1007 aa  329  2.0000000000000001e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.608863  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0599  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.21 
 
 		 957 aa  326  1e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1268  Hpt sensor hybrid histidine kinase  43.57 
 
 		 781 aa  325  2e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2480  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.42 
 
 		 846 aa  325  2e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000921222 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.81 
 
 		 882 aa  323  9.999999999999999e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1227  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.12 
 
 		 1229 aa  322  3e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3367  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.79 
 
 		 1059 aa  319  2e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.049018 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3211  bacteriophytochrome-like protein  29.4 
 
 		 842 aa  318  3e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.880007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1351  histidine kinase  44.6 
 
 		 596 aa  318  5e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.57626  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1989  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.2 
 
 		 1195 aa  316  9.999999999999999e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1437  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.34 
 
 		 785 aa  313  7.999999999999999e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2468  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.15 
 
 		 1049 aa  313  1e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.858637  normal  0.0946099 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2061  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.61 
 
 		 738 aa  310  5.9999999999999995e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4541  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.53 
 
 		 896 aa  309  1.0000000000000001e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3522  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.2 
 
 		 1287 aa  308  3e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2393  histidine kinase  42.22 
 
 		 735 aa  306  9.000000000000001e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.774182  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3329  hybrid sensor and regulator fused  41.46 
 
 		 968 aa  306  1.0000000000000001e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0560  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.79 
 
 		 940 aa  306  2.0000000000000002e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2929  histidine kinase  44.22 
 
 		 606 aa  304  6.000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2525  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.78 
 
 		 785 aa  304  6.000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.985854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.99 
 
 		 1433 aa  303  1e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1346  PAS sensor protein  39.18 
 
 		 803 aa  302  2e-80  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3445  Hpt sensor hybrid histidine kinase  39.96 
 
 		 717 aa  303  2e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.43 
 
 		 1075 aa  301  4e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1987  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.61 
 
 		 767 aa  301  6e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4086  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  46.92 
 
 		 631 aa  300  1e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.63 
 
 		 1326 aa  300  1e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0800  histidine kinase  36.21 
 
 		 882 aa  299  2e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2451  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.09 
 
 		 846 aa  299  2e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00414748 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1760  histidine kinase  40.19 
 
 		 671 aa  299  2e-79  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.83 
 
 		 939 aa  299  2e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.660448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0806  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.88 
 
 		 902 aa  297  7e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0077  histidine kinase  43.36 
 
 		 661 aa  296  1e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1644  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.76 
 
 		 789 aa  296  1e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.841521  normal  0.594738 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4715  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.17 
 
 		 1350 aa  295  2e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.726459  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1221  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.88 
 
 		 1044 aa  295  2e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.227424  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00475  two-component system sensor histidine kinase-response regulator hybridprotein  27.41 
 
 		 1364 aa  295  2e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.679058  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1096  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.35 
 
 		 1548 aa  295  3e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.363033 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5346  PAS  39.46 
 
 		 1060 aa  295  3e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1353  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.3 
 
 		 1029 aa  295  3e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.283316  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0987  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.1 
 
 		 846 aa  294  4e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.594505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0562  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  42.79 
 
 		 743 aa  295  4e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.1893  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0065  histidine kinase  39.6 
 
 		 578 aa  294  5e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3181  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.28 
 
 		 817 aa  294  5e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.182241  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1688  PAS sensor protein  34.94 
 
 		 823 aa  294  7e-78  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1342  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.25 
 
 		 944 aa  293  1e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1328  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.71 
 
 		 763 aa  293  1e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0219  multi-sensor hybrid histidine kinase  29 
 
 		 1452 aa  292  2e-77  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.32 
 
 		 1363 aa  292  3e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1985  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  47.09 
 
 		 639 aa  291  4e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.267533  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2940  PAS  30.08 
 
 		 1353 aa  291  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3129  sensory box histidine kinase/response regulator  31.78 
 
 		 1236 aa  289  1e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.4 
 
 		 765 aa  290  1e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2955  Hpt sensor hybrid histidine kinase  41.38 
 
 		 764 aa  290  1e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3402  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.2 
 
 		 874 aa  289  2e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.57 
 
 		 1771 aa  289  2e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0191  histidine kinase  36.12 
 
 		 666 aa  289  2e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3496  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.43 
 
 		 643 aa  289  2e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4585  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.4 
 
 		 1350 aa  288  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20208  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0240  Hpt sensor hybrid histidine kinase  42.86 
 
 		 1005 aa  288  5e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0057  histidine kinase  40.56 
 
 		 588 aa  288  5e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000185994 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3312  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.84 
 
 		 1226 aa  287  5.999999999999999e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1695  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.95 
 
 		 643 aa  287  5.999999999999999e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.695799 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1929  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.23 
 
 		 791 aa  287  8e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.108732  normal  0.835393 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0357  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.95 
 
 		 1310 aa  286  1.0000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.464939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1379  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.7 
 
 		 1611 aa  286  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1087  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.23 
 
 		 1121 aa  286  1.0000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.740067  hitchhiker  0.00000751372 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1550  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.13 
 
 		 995 aa  286  1.0000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2021  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  40.93 
 
 		 645 aa  285  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.798842  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>