263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0484 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_0484  metal-dependent phosphohydrolase  100 
 
 
282 aa  570  1.0000000000000001e-162  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0622  putative signal transduction protein  44.13 
 
 
279 aa  247  2e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1683  HDIG  45.15 
 
 
299 aa  223  3e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1149  putative signal transduction protein  39.19 
 
 
278 aa  186  4e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.506889  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2511  putative signal transduction protein  34.09 
 
 
287 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.118204  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54490  hypothetical protein  31.53 
 
 
278 aa  122  7e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.684818 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4762  hypothetical protein  31.03 
 
 
278 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.670951  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2456  hypothetical protein  27.67 
 
 
287 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2256  putative signal transduction protein  28.57 
 
 
278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.446678  normal  0.441111 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2422  cyclic nucleotide-binding protein  31.3 
 
 
430 aa  113  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1462  putative signal transduction protein  27.59 
 
 
278 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.439921  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1356  signal transduction protein  26.84 
 
 
273 aa  105  6e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.867049  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1910  metal dependent phosphohydrolase  31.88 
 
 
283 aa  105  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1038  metal dependent phosphohydrolase  28.93 
 
 
287 aa  103  3e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.227118  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3963  hypothetical protein  25.32 
 
 
273 aa  100  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2695  metal dependent phosphohydrolase  26.06 
 
 
409 aa  97.8  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4229  hypothetical protein  28.08 
 
 
273 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1965  putative signal transduction protein  26.75 
 
 
399 aa  96.7  4e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.543809  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1422  putative signal transduction protein  26.36 
 
 
270 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4299  putative signal transduction protein  26.36 
 
 
270 aa  95.5  9e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.729715  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4389  putative signal transduction protein  25.94 
 
 
270 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.274124  normal  0.875464 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1062  putative signal transduction protein  26.03 
 
 
268 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1483  Fis family transcriptional regulator  28.78 
 
 
324 aa  90.5  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.237466  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3341  putative signal transduction protein  30.39 
 
 
280 aa  90.1  4e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2694  metal dependent phosphohydrolase  24.21 
 
 
406 aa  88.2  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2772  metal dependent phosphohydrolase  25.21 
 
 
285 aa  88.2  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.846457  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2268  putative signal transduction protein  26.41 
 
 
277 aa  86.7  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03445  putative signal transduction protein  25.09 
 
 
278 aa  85.9  7e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1005  putative signal transduction protein  29.28 
 
 
280 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2801  putative signal transduction protein  27.98 
 
 
280 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3010  putative signal transduction protein  27.69 
 
 
280 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.311361  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0294  HD domain-containing protein  25.54 
 
 
303 aa  82.4  0.000000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0824041  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1050  putative signal transduction protein  25.67 
 
 
278 aa  82.4  0.000000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00648352  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1065  putative signal transduction protein  29.03 
 
 
279 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1137  putative signal transduction protein  29.03 
 
 
279 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.779758  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1046  hypothetical protein  26.15 
 
 
280 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2064  metal dependent phosphohydrolase  28.1 
 
 
397 aa  79.7  0.00000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.482341  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1069  putative signal transduction protein  28.33 
 
 
279 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2296  HD domain-containing protein  27.16 
 
 
304 aa  79.3  0.00000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.569971  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1061  putative signal transduction protein  25.7 
 
 
271 aa  79  0.00000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.580141  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3214  metal dependent phosphohydrolase  25.55 
 
 
282 aa  79  0.00000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000585577  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2782  putative signal transduction protein  27.81 
 
 
280 aa  79  0.00000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3191  putative signal transduction protein  28.18 
 
 
280 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1254  hypothetical protein  30.18 
 
 
250 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1176  putative signal transduction protein  28.18 
 
 
280 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3335  putative signal transduction protein  28.18 
 
 
280 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3197  putative signal transduction protein  28.18 
 
 
280 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3816  metal dependent phosphohydrolase  24.06 
 
 
283 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.411166  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1023  putative signal transduction protein  28.49 
 
 
280 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1380  putative signal transduction protein  23.39 
 
 
270 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.983267  normal  0.30324 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2242  metal dependent phosphohydrolase  28.1 
 
 
291 aa  76.3  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3900  metal dependent phosphohydrolase  23.79 
 
 
283 aa  76.3  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332345 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2816  metal dependent phosphohydrolase  25.31 
 
 
297 aa  76.3  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3511  putative signal transduction protein  27.07 
 
 
280 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1787  HDIG  26.67 
 
 
279 aa  74.7  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3268  metal dependent phosphohydrolase  25.85 
 
 
297 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.927802  hitchhiker  0.0000364844 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1203  hypothetical protein  24.64 
 
 
280 aa  72.8  0.000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.897132  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4028  metal dependent phosphohydrolase  23.55 
 
 
299 aa  72.8  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000178316 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0980  putative signal transduction protein  24.45 
 
 
275 aa  72.4  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.297329 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1312  metal dependent phosphohydrolase  25.63 
 
 
284 aa  72  0.000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0368639  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4190  metal dependent phosphohydrolase  23.59 
 
 
284 aa  72  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885116  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0168  metal dependent phosphohydrolase  31.34 
 
 
407 aa  71.6  0.00000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1460  metal dependent phosphohydrolase  23.4 
 
 
384 aa  71.2  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3899  metal dependent phosphohydrolase  23.85 
 
 
282 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0541019  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3944  metal dependent phosphohydrolase  24.54 
 
 
299 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3269  putative signal transduction protein  29.14 
 
 
276 aa  70.1  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.174263  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1161  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 
280 aa  70.1  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.663858  normal  0.172045 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02093  HD domain protein  26.49 
 
 
292 aa  70.1  0.00000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.394256  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4422  metal dependent phosphohydrolase  20.98 
 
 
300 aa  70.1  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2586  putative signal transduction protein  24.18 
 
 
288 aa  69.3  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0168081  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0156  metal dependent phosphohydrolase  23.59 
 
 
412 aa  69.3  0.00000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.494474  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0035  metal dependent phosphohydrolase  23.83 
 
 
298 aa  69.3  0.00000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1367  putative signal transduction protein  22.62 
 
 
288 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.276404  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0879  metal dependent phosphohydrolase  28.17 
 
 
298 aa  68.6  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0532  hypothetical protein  22.98 
 
 
274 aa  68.6  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0005  putative signal transduction protein  25.62 
 
 
348 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.373694  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2490  metal dependent phosphohydrolase  24 
 
 
288 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.115948  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0007  putative signal transduction protein  25.62 
 
 
346 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0403  metal dependent phosphohydrolase  27.87 
 
 
290 aa  67.8  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1197  putative signal transduction protein  27.27 
 
 
351 aa  68.2  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.408421  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0011  putative signal transduction protein  25.62 
 
 
346 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1403  putative signal transduction protein  29.1 
 
 
280 aa  68.2  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0351  metal dependent phosphohydrolase  26.13 
 
 
353 aa  67.8  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.889768  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0011  putative signal transduction protein  25.62 
 
 
346 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000619076 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1923  metal dependent phosphohydrolase  25.96 
 
 
395 aa  67  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1583  putative signal transduction protein  30.43 
 
 
279 aa  67  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.23287  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2112  metal dependent phosphohydrolase  25.2 
 
 
282 aa  67  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2040  hypothetical protein  29.71 
 
 
397 aa  67  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.414414  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1846  metal dependent phosphohydrolase  25 
 
 
283 aa  66.2  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0367  putative signal transduction protein  22.27 
 
 
285 aa  66.2  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1670  putative signal transduction protein  27.54 
 
 
297 aa  66.2  0.0000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1184  histidine kinase  25.71 
 
 
730 aa  66.2  0.0000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0470361  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1838  metal dependent phosphohydrolase  25.81 
 
 
395 aa  66.2  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3758  putative signal transduction protein  31.4 
 
 
274 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3831  putative signal transduction protein  31.4 
 
 
274 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3956  putative signal transduction protein  31.4 
 
 
274 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0011  putative signal transduction protein  25 
 
 
346 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0123691 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1669  putative signal transduction protein  25.12 
 
 
292 aa  64.7  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2652  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  28.44 
 
 
412 aa  65.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.5401  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0339  putative signal transduction protein  23.78 
 
 
290 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>