More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0481 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_3458  aspartate ammonia-lyase  69.1 
 
 
468 aa  637    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.882524  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0481  aspartate ammonia-lyase  100 
 
 
474 aa  969    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1791  aspartate ammonia-lyase  77.02 
 
 
475 aa  716    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6431  aspartate ammonia-lyase  75.97 
 
 
471 aa  691    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5639  aspartate ammonia-lyase  75.27 
 
 
479 aa  716    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.611375  normal  0.502562 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3758  fumarate lyase  67.6 
 
 
471 aa  639    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1746  fumarate lyase  68.82 
 
 
469 aa  647    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4302  aspartate ammonia-lyase  69.1 
 
 
468 aa  636    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2072  aspartate ammonia-lyase  75.64 
 
 
471 aa  701    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4064  aspartate ammonia-lyase  69.1 
 
 
468 aa  636    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5752  aspartate ammonia-lyase  75.76 
 
 
475 aa  702    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.555308  normal  0.129771 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0939  aspartate ammonia-lyase  71.65 
 
 
468 aa  642    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3976  fumarate lyase  68.49 
 
 
471 aa  629  1e-179  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1152  fumarate lyase  65.89 
 
 
481 aa  626  1e-178  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.265028  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3544  fumarate lyase  67.75 
 
 
471 aa  627  1e-178  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3457  aspartate ammonia-lyase  68.67 
 
 
468 aa  622  1e-177  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.73518 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1984  aspartate ammonia-lyase  68.8 
 
 
468 aa  620  1e-176  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3964  aspartate ammonia-lyase  69.31 
 
 
468 aa  619  1e-176  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.256806 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1643  aspartate ammonia-lyase  63.56 
 
 
474 aa  613  9.999999999999999e-175  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0827  fumarate lyase  64.45 
 
 
483 aa  603  1.0000000000000001e-171  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1299  fumarate lyase  67.41 
 
 
479 aa  601  1.0000000000000001e-171  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.160462  normal  0.429544 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0082  aspartate ammonia-lyase  61.61 
 
 
468 aa  594  1e-169  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2083  aspartate ammonia-lyase  64.16 
 
 
475 aa  596  1e-169  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.195347  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2177  aspartate ammonia-lyase  64.16 
 
 
475 aa  597  1e-169  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2167  aspartate ammonia-lyase  63.5 
 
 
480 aa  593  1e-168  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0122  aspartate ammonia-lyase  61.61 
 
 
468 aa  592  1e-168  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2438  aspartate ammonia-lyase  62.42 
 
 
466 aa  592  1e-168  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.268607  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3530  fumarate lyase  66.01 
 
 
540 aa  588  1e-167  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.448364 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24080  aspartate ammonia-lyase  62.37 
 
 
505 aa  591  1e-167  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.252738  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0094  aspartate ammonia-lyase  61.39 
 
 
468 aa  590  1e-167  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1757  aspartate ammonia-lyase  64.77 
 
 
482 aa  587  1e-166  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2009  aspartate ammonia-lyase  61.3 
 
 
476 aa  577  1.0000000000000001e-163  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2008  aspartate ammonia-lyase  61.09 
 
 
468 aa  573  1.0000000000000001e-162  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3455  aspartate ammonia-lyase  61.99 
 
 
470 aa  573  1.0000000000000001e-162  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.025134  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0356  fumarate lyase  65.3 
 
 
481 aa  570  1e-161  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71650  aspartate ammonia-lyase  61.51 
 
 
474 aa  568  1e-161  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6217  aspartate ammonia-lyase  61.29 
 
 
474 aa  568  1e-160  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.946627  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5051  aspartate ammonia-lyase  61.08 
 
 
474 aa  567  1e-160  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.267473 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5499  aspartate ammonia-lyase  60.86 
 
 
474 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5625  aspartate ammonia-lyase  60.21 
 
 
478 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.149238  normal  0.246318 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5247  aspartate ammonia-lyase  59.36 
 
 
478 aa  559  1e-158  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0371805  normal  0.169068 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1365  fumarate lyase  60.82 
 
 
484 aa  561  1e-158  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000000934378  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2052  aspartate ammonia-lyase  59.13 
 
 
485 aa  558  1e-158  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0909745  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0128  aspartate ammonia-lyase  60.22 
 
 
474 aa  560  1e-158  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.266622  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5338  aspartate ammonia-lyase  59.15 
 
 
478 aa  557  1e-157  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000486768 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5387  aspartate ammonia-lyase  59.15 
 
 
485 aa  557  1e-157  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0626704 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0135  aspartate ammonia-lyase  59.15 
 
 
485 aa  557  1e-157  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1905  fumarate lyase  56.87 
 
 
475 aa  548  1e-155  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.486033 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0193  aspartate ammonia-lyase  58.86 
 
 
463 aa  545  1e-154  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0565  aspartate ammonia-lyase  58.79 
 
 
521 aa  542  1e-153  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0355315 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0461  fumarate lyase  60.34 
 
 
507 aa  542  1e-153  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2806  aspartate ammonia-lyase  57.3 
 
 
482 aa  539  9.999999999999999e-153  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4326  fumarate lyase  60.22 
 
 
568 aa  541  9.999999999999999e-153  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.705927  normal  0.56186 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3958  fumarate lyase  59.78 
 
 
571 aa  538  9.999999999999999e-153  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3403  aspartate ammonia-lyase  56.77 
 
 
469 aa  535  1e-151  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00437169  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002214  aspartate ammonia-lyase  57.39 
 
 
483 aa  533  1e-150  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4435  fumarate lyase  59.01 
 
 
560 aa  534  1e-150  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.246293 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00154  aspartate ammonia-lyase  57.39 
 
 
483 aa  533  1e-150  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0406  aspartate ammonia-lyase  56.62 
 
 
478 aa  531  1e-150  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2270  aspartate ammonia-lyase  56.32 
 
 
483 aa  533  1e-150  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.935521  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1293  aspartate ammonia-lyase  60.3 
 
 
468 aa  532  1e-150  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0277144  normal  0.160043 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1993  aspartate ammonia-lyase  55.1 
 
 
463 aa  529  1e-149  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0725  aspartate ammonia-lyase  55.97 
 
 
478 aa  528  1e-149  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0466  aspartate ammonia-lyase  58.7 
 
 
471 aa  529  1e-149  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000107475  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3678  aspartate ammonia-lyase  55.97 
 
 
478 aa  528  1e-149  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3825  aspartate ammonia-lyase  55.97 
 
 
478 aa  528  1e-149  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1665  aspartate ammonia-lyase  54.23 
 
 
479 aa  526  1e-148  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3115  aspartate ammonia-lyase  53.75 
 
 
476 aa  525  1e-148  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04009  aspartate ammonia-lyase  57.27 
 
 
478 aa  523  1e-147  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3853  aspartate ammonia-lyase  57.27 
 
 
478 aa  523  1e-147  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1811  aspartate ammonia-lyase  54.23 
 
 
479 aa  524  1e-147  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1667  aspartate ammonia-lyase  54.01 
 
 
479 aa  523  1e-147  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0778255  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03971  hypothetical protein  57.27 
 
 
478 aa  523  1e-147  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1921  aspartate ammonia-lyase  54.01 
 
 
479 aa  523  1e-147  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4380  aspartate ammonia-lyase  57.27 
 
 
478 aa  523  1e-147  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.211815  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4668  aspartate ammonia-lyase  57.27 
 
 
478 aa  523  1e-147  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3530  aspartate ammonia-lyase  54.01 
 
 
479 aa  523  1e-147  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4608  aspartate ammonia-lyase  57.27 
 
 
478 aa  523  1e-147  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.21143  normal  0.755736 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1800  aspartate ammonia-lyase  54.01 
 
 
479 aa  523  1e-147  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3873  aspartate ammonia-lyase  57.27 
 
 
478 aa  523  1e-147  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4694  aspartate ammonia-lyase  57.05 
 
 
478 aa  522  1e-147  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2652  aspartate ammonia-lyase  58.23 
 
 
467 aa  522  1e-147  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.531608  normal  0.0454862 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5655  aspartate ammonia-lyase  57.27 
 
 
478 aa  523  1e-147  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0582808  normal  0.320226 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1395  fumarate lyase  56.89 
 
 
478 aa  519  1e-146  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4596  aspartate ammonia-lyase  56.83 
 
 
478 aa  516  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4744  aspartate ammonia-lyase  56.83 
 
 
478 aa  516  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.825089  normal  0.538431 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4722  aspartate ammonia-lyase  56.83 
 
 
478 aa  516  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4604  aspartate ammonia-lyase  56.83 
 
 
478 aa  516  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4687  aspartate ammonia-lyase  56.83 
 
 
478 aa  516  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1091  aspartate ammonia-lyase  55.53 
 
 
485 aa  512  1e-144  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.548259  normal  0.0187146 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1178  aspartate ammonia-lyase  55.53 
 
 
485 aa  512  1e-144  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000150136 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3135  aspartate ammonia-lyase  53.96 
 
 
476 aa  511  1e-144  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0593  aspartate ammonia-lyase  55.63 
 
 
472 aa  512  1e-144  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0480  aspartate ammonia-lyase  56.47 
 
 
479 aa  513  1e-144  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1872  aspartate ammonia-lyase  54.23 
 
 
479 aa  508  1e-143  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1649  aspartate ammonia-lyase  54.23 
 
 
479 aa  508  1e-143  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2883  aspartate ammonia-lyase  53.75 
 
 
476 aa  509  1e-143  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1614  aspartate ammonia-lyase  54.23 
 
 
479 aa  508  1e-143  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1884  aspartate ammonia-lyase  58.5 
 
 
483 aa  508  1e-143  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0218686  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0398  aspartate ammonia-lyase  56.47 
 
 
479 aa  511  1e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>