22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0454 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0454  CBS  100 
 
 		 218 aa  437  9.999999999999999e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0061  CBS domain containing protein  52.44 
 
 		 201 aa  161  7e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0342  CBS domain containing protein  50.61 
 
 		 200 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.292321  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0664  hypothetical protein  44.64 
 
 		 216 aa  140  9.999999999999999e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.358372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2064  hypothetical protein  40.8 
 
 		 195 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0577346  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2957  CBS domain-containing protein  45.4 
 
 		 196 aa  139  3e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0102  CBS domain-containing protein  40.53 
 
 		 209 aa  128  8.000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.653521  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1893  CBS  47.37 
 
 		 199 aa  125  5e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2062  CBS domain protein  36.73 
 
 		 197 aa  115  3e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.628455  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1720  putative signal-transduction protein with CBS domains  36.73 
 
 		 197 aa  115  3e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.346801 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2035  hypothetical protein  35.4 
 
 		 203 aa  84.3  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03825  CBS domain protein  30 
 
 		 187 aa  73.2  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1518  CBS domain-containing protein  30.06 
 
 		 186 aa  72  0.000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000300284  hitchhiker  0.000492354 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1349  CBS domain-containing protein  29.63 
 
 		 186 aa  70.5  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.735809  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1857  CBS domain-containing protein  28.38 
 
 		 197 aa  69.3  0.00000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0333  CBS domain-containing protein  27.7 
 
 		 197 aa  68.9  0.00000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2693  CBS domain-containing protein  30.3 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2459  CBS domain-containing protein  29.45 
 
 		 185 aa  68.2  0.00000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3704  signal transduction protein  29.38 
 
 		 195 aa  66.6  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000122502  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1244  CBS domain-containing protein  30.41 
 
 		 186 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3813  hypothetical protein  27.44 
 
 		 187 aa  53.9  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00350231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2237  CBS domain-containing protein  29.02 
 
 		 197 aa  48.5  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.303434  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>