54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0386 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0386  phenylacetic acid degradation operon negative regulatory protein PaaX  100 
 
 		 352 aa  704    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000187716  normal  0.0170462 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1514  transcriptional regulator, PaaX family  63.9 
 
 		 316 aa  362  4e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.139923  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3103  PaaX family transcriptional regulator  39.87 
 
 		 307 aa  239  6.999999999999999e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000000661945  decreased coverage  0.0000397547 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2610  PaaX family transcriptional regulator  42.24 
 
 		 334 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.218497  normal  0.0704814 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2473  PaaX family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 334 aa  232  6e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.303711  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3286  PaaX family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 307 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.17765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2623  PaaX family transcriptional regulator  41.21 
 
 		 334 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.312733  normal  0.0873289 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1521  phenylacetic acid degradation operon negative regulatory protein PaaX  41.02 
 
 		 312 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3734  phenylacetic acid degradation operon negative regulatory protein PaaX  38.49 
 
 		 307 aa  215  9e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0196  transcriptional regulator, PaaX family  36.57 
 
 		 319 aa  202  7e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3083  PaaX family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 312 aa  187  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.415086 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1585  phenylacetic acid degradation operon negative regulatory protein PaaX  37.66 
 
 		 316 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2256  PaaX family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 316 aa  182  7e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.203735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1486  phenylacetic acid degradation operon negative regulatory protein PaaX  37.66 
 
 		 316 aa  182  7e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2246  transcriptional regulator, PaaX family  37.66 
 
 		 316 aa  182  8.000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.218129  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2864  phenylacetic acid degradation operon negative regulatory protein paaX  40.44 
 
 		 293 aa  179  4.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00499823  normal  0.0484276 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0216  PaaX family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 311 aa  177  2e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0165647 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2859  transcriptional regulator, PaaX family  33.71 
 
 		 285 aa  170  4e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0895  PaaX family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 305 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.947925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0692  phenylacetic acid degradation operon negative regulatory protein PaaX  35.5 
 
 		 287 aa  162  7e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.717402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7200  transcriptional regulator, PaaX family  35.18 
 
 		 292 aa  159  6e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.803046  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3357  transcriptional regulator, PaaX family  33.66 
 
 		 301 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0661  PaaX domain-containing protein, C- domain  29.24 
 
 		 285 aa  144  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0655  PaaX family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 272 aa  134  3e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0748596  hitchhiker  0.00291671 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0708  PaaX family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 272 aa  133  3.9999999999999996e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.719013  normal  0.640912 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2835  transcriptional regulator, PaaX family  28.68 
 
 		 285 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4812  PaaX domain-containing protein  32.98 
 
 		 284 aa  129  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.33483 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4146  PaaX family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 305 aa  125  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.85173 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0787  transcriptional regulator, PaaX family  31.69 
 
 		 268 aa  121  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0094  PaaX family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 289 aa  116  6e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.339453  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2629  PaaX family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 259 aa  114  3e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.495501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1206  PaaX domain-containing protein, C- domain  31.34 
 
 		 258 aa  112  7.000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2009  transcriptional regulator, PaaX family  31.52 
 
 		 281 aa  110  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.429433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0703  transcriptional regulator, PaaX family  28.36 
 
 		 259 aa  107  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8420  putative transcriptional regulator, PaaX family  28.46 
 
 		 260 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.289328  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0980  transcriptional regulator, PaaX family  29.24 
 
 		 259 aa  98.6  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.148761 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2150  transcriptional regulator, PaaX family  28.94 
 
 		 289 aa  93.2  6e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.933136  normal  0.276366 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0294  transcriptional regulator, PaaX family  28.68 
 
 		 318 aa  92.4  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0429653  hitchhiker  0.0000864342 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6455  transcriptional regulator, PaaX family  28.97 
 
 		 260 aa  87.8  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1609  PaaX family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 258 aa  85.5  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1685  PaaX family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 333 aa  81.3  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0710641  normal  0.260669 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0309  transcriptional regulator, PaaX family  27.17 
 
 		 302 aa  80.9  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4899  transcriptional regulator, PaaX family  28.41 
 
 		 276 aa  75.9  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.425131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19070  phenylacetic acid-responsive transcriptional repressor  26.42 
 
 		 292 aa  75.1  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0202563  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2025  transcriptional regulator, PaaX family  28.06 
 
 		 306 aa  71.6  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3828  PaaX family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 264 aa  70.9  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.648927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0436  PaaX-like  26.34 
 
 		 301 aa  65.1  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.581976 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0588  transcriptional regulator, PaaX family  25 
 
 		 276 aa  62  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5523  transcriptional regulator, PaaX family  29.18 
 
 		 267 aa  61.6  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.543092 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0289  transcriptional regulator, PaaX family  27.09 
 
 		 280 aa  52.8  0.000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.010887  hitchhiker  0.0000784974 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0977  PaaX-like protein  26.29 
 
 		 243 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0995  PaaX domain-containing protein, C- domain  26.29 
 
 		 243 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1005  PaaX domain-containing protein, C- domain  26.29 
 
 		 243 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.457167 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10688  hypothetical protein  25.66 
 
 		 240 aa  43.5  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>