More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0367 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0367  inner-membrane translocator  100 
 
 		 291 aa  556  1e-157  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000622442  unclonable  0.0000000514338 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1516  inner-membrane translocator  75.6 
 
 		 291 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.713706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0892  inner-membrane translocator  62.07 
 
 		 290 aa  361  9e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4796  inner-membrane translocator  62.41 
 
 		 290 aa  354  7.999999999999999e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212285  normal  0.40666 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4550  inner-membrane translocator  61.03 
 
 		 290 aa  321  8e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0679  inner-membrane translocator  61.38 
 
 		 290 aa  319  3e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.796058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1862  inner-membrane translocator  53.98 
 
 		 294 aa  319  3e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.513545  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0996  inner-membrane translocator  54.48 
 
 		 293 aa  312  3.9999999999999997e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2188  inner-membrane translocator  53.08 
 
 		 294 aa  310  2e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2039  inner-membrane translocator  54.11 
 
 		 294 aa  301  7.000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000380808 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2129  inner-membrane translocator  52.94 
 
 		 294 aa  294  1e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1822  inner-membrane translocator  52.94 
 
 		 294 aa  292  4e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1672  inner-membrane translocator  51.21 
 
 		 299 aa  278  5e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1733  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  53.63 
 
 		 294 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.293981  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0834  inner-membrane translocator  50.17 
 
 		 300 aa  272  6e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000998369  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1680  inner-membrane translocator  49.83 
 
 		 291 aa  250  2e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0385  inner-membrane translocator  50.7 
 
 		 293 aa  246  4e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1046  inner-membrane translocator  49.47 
 
 		 289 aa  244  9.999999999999999e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.316666 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4070  inner-membrane translocator  46.23 
 
 		 295 aa  243  1.9999999999999999e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1483  inner-membrane translocator  46.95 
 
 		 295 aa  242  5e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3104  inner-membrane translocator  44.29 
 
 		 293 aa  232  5e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1408  inner-membrane translocator  45.42 
 
 		 317 aa  227  2e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.616079  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3821  inner-membrane translocator  46.53 
 
 		 293 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0669  inner-membrane translocator  45.33 
 
 		 294 aa  213  2.9999999999999995e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3768  inner-membrane translocator  37.63 
 
 		 291 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.179629 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1651  inner-membrane translocator  37.8 
 
 		 291 aa  188  1e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1865  inner-membrane translocator  36.73 
 
 		 294 aa  185  7e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2362  inner-membrane translocator  37.24 
 
 		 291 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.016238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6490  inner-membrane translocator  39.02 
 
 		 291 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0479005  normal  0.485877 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6586  inner-membrane translocator  39.24 
 
 		 291 aa  182  7e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.788549  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1849  inner-membrane translocator  36.08 
 
 		 291 aa  179  4.999999999999999e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.425483  normal  0.118432 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0478  inner-membrane translocator  38.54 
 
 		 290 aa  178  1e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.164888  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2112  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  37.2 
 
 		 291 aa  178  1e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3367  inner-membrane translocator  37.98 
 
 		 291 aa  177  3e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0110  inner-membrane translocator  39.79 
 
 		 295 aa  176  4e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.185553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4925  inner-membrane translocator  35.74 
 
 		 293 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0402653  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3687  inner-membrane translocator  36.77 
 
 		 291 aa  174  1.9999999999999998e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0271  inner-membrane translocator  36.3 
 
 		 319 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.297409  normal  0.531451 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0461  inner-membrane translocator  36.12 
 
 		 298 aa  172  6.999999999999999e-42  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1423  inner-membrane translocator  37.41 
 
 		 290 aa  172  9e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.36442  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3056  inner-membrane translocator  38.44 
 
 		 292 aa  171  1e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3001  inner-membrane translocator  36.39 
 
 		 338 aa  171  1e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.893544 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2728  inner-membrane translocator  35.83 
 
 		 311 aa  171  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.613747  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2239  inner-membrane translocator  38.18 
 
 		 293 aa  171  2e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1696  inner-membrane translocator  39.02 
 
 		 291 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.699777 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6015  inner-membrane translocator  38.33 
 
 		 291 aa  171  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00174131 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2739  inner-membrane translocator  35.15 
 
 		 290 aa  171  2e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2429  inner-membrane translocator  35.22 
 
 		 300 aa  167  2e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.614779  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3208  inner-membrane translocator  35.74 
 
 		 309 aa  167  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.805935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3707  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  36.99 
 
 		 291 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.229916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0914  inner-membrane translocator  36.99 
 
 		 291 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3172  inner-membrane translocator  34.42 
 
 		 309 aa  166  4e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.538875  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2708  inner-membrane translocator  37.46 
 
 		 311 aa  166  5e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.489693  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2318  inner-membrane translocator  37.46 
 
 		 311 aa  165  6.9999999999999995e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.249302  hitchhiker  0.00247249 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2555  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  37.54 
 
 		 293 aa  165  9e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.1036  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2105  inner-membrane translocator  34.43 
 
 		 309 aa  164  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1479  inner-membrane translocator  36.79 
 
 		 302 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3394  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  39.53 
 
 		 291 aa  163  3e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2866  inner-membrane translocator  36.16 
 
 		 311 aa  163  3e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.631221  normal  0.623408 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2440  putative amino-acid transmembrane ABC transporter protein  36.48 
 
 		 311 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1875  inner-membrane translocator  34.75 
 
 		 309 aa  162  4.0000000000000004e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.152214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0589  inner-membrane translocator  33.76 
 
 		 316 aa  162  7e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5354  inner-membrane translocator  34.75 
 
 		 309 aa  162  8.000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.764467 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2082  inner-membrane translocator  35.76 
 
 		 289 aa  162  9e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.936766  normal  0.326487 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2396  inner-membrane translocator  36.18 
 
 		 302 aa  162  9e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.228148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1837  inner-membrane translocator  38.38 
 
 		 296 aa  161  9e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000968352  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01744  amino-acid transmembrane ABC transporter protein  44.75 
 
 		 350 aa  161  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.698868  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3328  inner-membrane translocator  34.55 
 
 		 300 aa  161  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.166964  normal  0.584188 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0822  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  33.55 
 
 		 316 aa  161  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.221033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1892  branched-chain amino acid AbC-type transport system permease  36.75 
 
 		 308 aa  161  2e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.339228  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0940  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  33.65 
 
 		 316 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0796319  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3072  inner-membrane translocator  35.43 
 
 		 300 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.117603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0481  branched chain amino acid ABC transporter permease  36.39 
 
 		 292 aa  160  2e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3207  inner-membrane translocator  33.11 
 
 		 301 aa  159  4e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1288  inner-membrane translocator  34.75 
 
 		 309 aa  159  4e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2366  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.79 
 
 		 299 aa  159  5e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00045769  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0356  inner-membrane translocator  37.76 
 
 		 292 aa  159  5e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2472  inner-membrane translocator  34.95 
 
 		 310 aa  159  6e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3515  ABC transporter membrane spanning protein  33.89 
 
 		 300 aa  159  7e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2608  inner-membrane translocator  34.67 
 
 		 302 aa  159  7e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1143  putative amino-acid transport permease protein  33.33 
 
 		 316 aa  158  8e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0034863  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0989  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  33.33 
 
 		 316 aa  158  8e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.341358  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2501  inner-membrane translocator  37.5 
 
 		 302 aa  158  9e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.123023 
 
 
-
 
NC_004310  BR1791  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.65 
 
 		 302 aa  157  1e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2139  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  35.31 
 
 		 308 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.270395  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0863  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.31 
 
 		 308 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.21729  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3500  inner-membrane translocator  35.86 
 
 		 291 aa  157  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.334303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0785  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33.01 
 
 		 316 aa  158  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2500  inner-membrane translocator  35.69 
 
 		 287 aa  158  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3499  inner-membrane translocator  38.01 
 
 		 291 aa  158  1e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0773  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.31 
 
 		 308 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1123  putative amino-acid transmembrane ABC transporter protein  34.98 
 
 		 335 aa  158  1e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.121709  normal  0.109582 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1725  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.65 
 
 		 302 aa  157  2e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0983  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  33.01 
 
 		 316 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.156629  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1838  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  34.98 
 
 		 308 aa  157  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6412  inner-membrane translocator  34.19 
 
 		 316 aa  156  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1391  inner-membrane translocator  35.47 
 
 		 294 aa  156  3e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3837  inner-membrane translocator  37.37 
 
 		 287 aa  157  3e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.622329  normal  0.114435 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3973  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  32.57 
 
 		 308 aa  156  4e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.883814  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0245  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  32.57 
 
 		 308 aa  156  4e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>