More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0328 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_0328  SSU ribosomal protein S17P  100 
 
 
88 aa  174  3e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.11157e-25  unclonable  0.0000000432201 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0258  30S ribosomal protein S17  71.43 
 
 
90 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000603244  hitchhiker  0.00894491 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3010  30S ribosomal protein S17  67.42 
 
 
89 aa  124  4.0000000000000003e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000000740755  normal  0.0471511 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2623  30S ribosomal protein S17  69.05 
 
 
90 aa  123  6e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.699398  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3737  30S ribosomal protein S17  69.05 
 
 
90 aa  123  6e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000331818  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3767  30S ribosomal protein S17  69.05 
 
 
90 aa  123  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000138754  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3487  30S ribosomal protein S17  69.05 
 
 
90 aa  123  6e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00115602  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3160  30S ribosomal protein S17  69.05 
 
 
90 aa  123  6e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000677141  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1933  30S ribosomal protein S17  69.05 
 
 
90 aa  123  6e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000633723  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0276  30S ribosomal protein S17  67.86 
 
 
90 aa  124  6e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000137406  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0285  30S ribosomal protein S17  67.86 
 
 
90 aa  124  6e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000000405514  normal  0.0233018 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3795  30S ribosomal protein S17  69.05 
 
 
90 aa  123  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3308  30S ribosomal protein S17  66.67 
 
 
92 aa  123  8.000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000182432  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3456  30S ribosomal protein S17  67.86 
 
 
90 aa  122  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000380443  decreased coverage  0.00396929 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3288  30S ribosomal protein S17  65.17 
 
 
89 aa  123  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000278806  hitchhiker  0.00000199578 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0336  30S ribosomal protein S17  67.86 
 
 
90 aa  122  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000156672  normal  0.0197388 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2750  30S ribosomal protein S17  67.86 
 
 
90 aa  122  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000100032  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2941  30S ribosomal protein S17  65.17 
 
 
89 aa  123  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00001015  hitchhiker  0.00000362348 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0357  30S ribosomal protein S17  67.86 
 
 
90 aa  122  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000267511  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3170  30S ribosomal protein S17  66.67 
 
 
92 aa  121  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000175324  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3059  30S ribosomal protein S17  67.86 
 
 
90 aa  121  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000184164  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3329  30S ribosomal protein S17  66.29 
 
 
89 aa  121  3e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000398832  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2831  30S ribosomal protein S17  65.48 
 
 
90 aa  120  5e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000151537  normal  0.471664 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3635  30S ribosomal protein S17  64.37 
 
 
90 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000372531  decreased coverage  0.00000000000123606 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0323  30S ribosomal protein S17  64.37 
 
 
90 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000666609  decreased coverage  0.00233353 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0288  30S ribosomal protein S17  66.67 
 
 
90 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125562  hitchhiker  0.00000171329 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0463  30S ribosomal protein S17  61.36 
 
 
88 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.903355  hitchhiker  0.00000264542 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0493  30S ribosomal protein S17  61.36 
 
 
88 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221769  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4740  30S ribosomal protein S17  61.36 
 
 
88 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0349479  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0496  30S ribosomal protein S17  61.36 
 
 
88 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000477154  normal  0.104043 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0776  ribosomal protein S17  63.53 
 
 
88 aa  114  3e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000000337654  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3434  30S ribosomal protein S17  61.11 
 
 
90 aa  115  3e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0295981  normal  0.193423 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0846  30S ribosomal protein S17  59.09 
 
 
88 aa  113  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.349116  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08940  30S ribosomal protein S17  59.09 
 
 
88 aa  113  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.299482  normal  0.0340675 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0635  ribosomal protein S17  60.23 
 
 
88 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00000269745  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4539  30S ribosomal protein S17  60.23 
 
 
88 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5070  30S ribosomal protein S17  60.23 
 
 
88 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000035859  normal  0.128482 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0400  30S ribosomal protein S17  59.55 
 
 
89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4904  30S ribosomal protein S17  59.55 
 
 
89 aa  111  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.049648  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2315  30S ribosomal protein S17  60 
 
 
87 aa  111  3e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0524873  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0347  30S ribosomal protein S17  57.3 
 
 
89 aa  111  4.0000000000000004e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.451528  decreased coverage  0.000267992 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1273  30S ribosomal protein S17  59.3 
 
 
89 aa  110  7.000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0468178  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0728  30S ribosomal protein S17  60 
 
 
88 aa  110  7.000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00313213  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0287  30S ribosomal protein S17  59.3 
 
 
89 aa  110  9e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000277089 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0282  30S ribosomal protein S17  59.3 
 
 
89 aa  110  9e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000313457  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0059  30S ribosomal protein S17  63.1 
 
 
89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000129273  hitchhiker  1.52646e-17 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0062  30S ribosomal protein S17  63.1 
 
 
89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000414135  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0414  30S ribosomal protein S17  62.07 
 
 
87 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000036421  normal  0.356143 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3786  30S ribosomal protein S17  57.3 
 
 
89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.164158  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0212  30S ribosomal protein S17  59.55 
 
 
89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.149422 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0265  30S ribosomal protein S17  59.55 
 
 
89 aa  107  6e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.696196  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0849  30S ribosomal protein S17  61.18 
 
 
86 aa  107  6e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3990  30S ribosomal protein S17  62.5 
 
 
98 aa  106  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000165652 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4267  ribosomal protein S17  57.95 
 
 
86 aa  106  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000045276  unclonable  0.00000000000278938 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3900  30S ribosomal protein S17  64.1 
 
 
88 aa  105  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00230536  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001733  SSU ribosomal protein S17p (S11e)  60.49 
 
 
84 aa  105  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000075143  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06340  30S ribosomal protein S17  60.26 
 
 
88 aa  103  6e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.543967  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00739  30S ribosomal protein S17  59.26 
 
 
84 aa  103  6e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0467  SSU ribosomal protein S17P  52.94 
 
 
87 aa  103  8e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0193  30S ribosomal protein S17  59.74 
 
 
82 aa  103  8e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000114051  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2315  ribosomal protein S17  55.29 
 
 
86 aa  102  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000099877  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4681  30S ribosomal protein S17  58.44 
 
 
82 aa  101  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000864007  unclonable  0.0000000112365 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0498  SSU ribosomal protein S17P  55.42 
 
 
91 aa  101  4e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000348408  hitchhiker  0.00374452 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4308  30S ribosomal protein S17  58.44 
 
 
82 aa  101  4e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000115651  unclonable  0.0000000000430661 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0120  30S ribosomal protein S17  56.82 
 
 
87 aa  101  4e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.326224  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0167  30S ribosomal protein S17  58.44 
 
 
82 aa  101  4e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000350413  hitchhiker  0.000281031 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0067  30S ribosomal protein S17  59.26 
 
 
86 aa  100  5e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.1837  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0493  ribosomal protein S17  60.81 
 
 
91 aa  100  6e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000394007  normal  0.0259366 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1898  30S ribosomal protein S17  58.02 
 
 
86 aa  100  6e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0030957  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4535  30S ribosomal protein S17  54.22 
 
 
84 aa  100  8e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000011061  hitchhiker  0.0016313 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0332  30S ribosomal protein S17  53.16 
 
 
89 aa  99.4  1e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000351608  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1937  30S ribosomal protein S17  65.75 
 
 
90 aa  99.8  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3992  30S ribosomal protein S17  56.96 
 
 
84 aa  99.4  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000847939  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0240  30S ribosomal protein S17  57.14 
 
 
82 aa  98.6  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0968  30S ribosomal protein S17  51.76 
 
 
88 aa  99  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000132893  hitchhiker  0.000000938527 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0636  ribosomal protein S17  58.33 
 
 
98 aa  98.6  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.757439  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1858  30S ribosomal protein S17  58.97 
 
 
94 aa  99  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.147715  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3813  30S ribosomal protein S17  56.96 
 
 
84 aa  98.6  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000352623  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0208  30S ribosomal protein S17  57.14 
 
 
82 aa  98.6  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000014726  unclonable  0.0000000000149425 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0203  30S ribosomal protein S17  57.14 
 
 
82 aa  98.6  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000279278  hitchhiker  0.00162508 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0208  30S ribosomal protein S17  57.14 
 
 
82 aa  98.6  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000159917  hitchhiker  0.0000000011379 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03162  30S ribosomal protein S17  55.7 
 
 
84 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0016617  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0402  ribosomal protein S17  55.7 
 
 
84 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000755989  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2165  30S ribosomal protein S17  57.14 
 
 
84 aa  98.6  3e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000168  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3606  30S ribosomal protein S17  55.7 
 
 
84 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000146035  normal  0.0220451 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3696  30S ribosomal protein S17  55.7 
 
 
84 aa  98.2  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000629724  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0402  30S ribosomal protein S17  55.7 
 
 
84 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000858813  hitchhiker  0.0000630078 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03113  hypothetical protein  55.7 
 
 
84 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00156817  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0235  30S ribosomal protein S17  60 
 
 
84 aa  98.6  3e-20  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3505  30S ribosomal protein S17  55.7 
 
 
84 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141629  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0329  30S ribosomal protein S17  55.84 
 
 
84 aa  98.6  3e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00017601  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3750  30S ribosomal protein S17  57.14 
 
 
82 aa  98.2  3e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000077178  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0337  ribosomal protein S17  54.67 
 
 
89 aa  98.6  3e-20  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.177398  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4161  30S ribosomal protein S17  57.14 
 
 
82 aa  98.2  3e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000038185  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00454  30S ribosomal protein S17  58.44 
 
 
85 aa  98.6  3e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.301377  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4047  30S ribosomal protein S17  57.14 
 
 
82 aa  98.2  3e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000100461  unclonable  0.00000000000380928 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0209  30S ribosomal protein S17  57.14 
 
 
82 aa  98.2  3e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000139872  unclonable  0.00000794162 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0116  30S ribosomal protein S17  55.68 
 
 
87 aa  98.2  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3794  30S ribosomal protein S17  55.7 
 
 
84 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000413516  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0205  30S ribosomal protein S17  57.14 
 
 
82 aa  98.2  3e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000179685  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>