82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0261 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_0261  hypothetical protein  100 
 
 
146 aa  284  2.9999999999999996e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0138  protein of unknown function DUF107  66.67 
 
 
151 aa  198  1.9999999999999998e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4711  hypothetical protein  51.7 
 
 
145 aa  149  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.396133 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4833  SURF1 domain-containing protein  52.08 
 
 
143 aa  148  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.474537  normal  0.511856 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3436  hypothetical protein  47.26 
 
 
152 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0488184  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4625  hypothetical protein  48.3 
 
 
145 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.165584 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4889  hypothetical protein  48.98 
 
 
145 aa  144  6e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0908212  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0648  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity, NfeD-like  47.22 
 
 
150 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.24585  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1621  hypothetical protein  42.18 
 
 
147 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000165212  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0609  protein of unknown function DUF107  43.84 
 
 
154 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0320  protein of unknown function DUF107  43.15 
 
 
152 aa  107  5e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0296  protein of unknown function DUF107  42.96 
 
 
152 aa  107  7.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0323  protein of unknown function DUF107  42.47 
 
 
152 aa  107  7.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2365  hypothetical protein  36.96 
 
 
157 aa  94.7  3e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3109  protein of unknown function DUF107  39.46 
 
 
148 aa  92.4  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00574825  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2128  hypothetical protein  33.33 
 
 
165 aa  87.4  5e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.639111 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2452  hypothetical protein  34.72 
 
 
165 aa  84  6e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0087  hypothetical protein  28.77 
 
 
150 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0461  protein of unknown function DUF107  30.34 
 
 
145 aa  63.9  0.0000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3149  hypothetical protein  39.76 
 
 
121 aa  57.8  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.722841  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0062  hypothetical protein  30.28 
 
 
140 aa  56.2  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0560345  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1923  hypothetical protein  28.87 
 
 
142 aa  55.5  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.126265  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2216  hypothetical protein  28.86 
 
 
148 aa  56.2  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00884783  normal  0.106638 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0062  hypothetical protein  29.58 
 
 
140 aa  55.1  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.351134  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0572  regulator of membrane protease activity  28.47 
 
 
147 aa  54.7  0.0000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01316  hypothetical protein  29.5 
 
 
153 aa  54.7  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4844  hypothetical protein  28.86 
 
 
147 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2063  hypothetical protein  27.46 
 
 
142 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00757659  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3244  hypothetical protein  27.46 
 
 
142 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00265616  normal  0.45038 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1879  hypothetical protein  28.17 
 
 
142 aa  52.8  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2173  hypothetical protein  28.17 
 
 
142 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004151  putative activity regulator of membrane protease YbbK  26.87 
 
 
153 aa  52  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2145  hypothetical protein  28.17 
 
 
142 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3306  protein of unknown function DUF107  28.77 
 
 
153 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.471898  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6549  protein of unknown function DUF107  30.94 
 
 
144 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1559  hypothetical protein  26.76 
 
 
142 aa  50.8  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.151405  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4268  hypothetical protein  29.08 
 
 
153 aa  50.4  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3217  protein of unknown function DUF107  28.26 
 
 
151 aa  50.1  0.000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2105  hypothetical protein  26.76 
 
 
142 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2074  hypothetical protein  26.76 
 
 
142 aa  50.4  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1889  hypothetical protein  26.76 
 
 
142 aa  50.4  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1927  hypothetical protein  26.76 
 
 
142 aa  50.4  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3608  protein of unknown function DUF107  30.41 
 
 
151 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1099  hypothetical protein  27.54 
 
 
151 aa  49.7  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3072  hypothetical protein  31.88 
 
 
159 aa  50.1  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0660116  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1187  protein of unknown function DUF107  29.5 
 
 
151 aa  49.3  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2736  hypothetical protein  27.7 
 
 
153 aa  49.3  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.355478  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3850  hypothetical protein  32.61 
 
 
156 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0149984  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1881  hypothetical protein  31.51 
 
 
150 aa  47.4  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0471447  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0462  hypothetical protein  30.08 
 
 
159 aa  47.4  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3025  protein of unknown function DUF107  26.09 
 
 
151 aa  47.4  0.00007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4507  hypothetical protein  31.16 
 
 
153 aa  47  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0857402  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0490  hypothetical protein  31.88 
 
 
156 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0414  hypothetical protein  31.58 
 
 
155 aa  46.2  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0427482  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0496  hypothetical protein  31.11 
 
 
149 aa  46.6  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.41983  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0469  hypothetical protein  31.88 
 
 
156 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000206621  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0505  protein of unknown function DUF107  31.43 
 
 
147 aa  45.4  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0418  protein of unknown function DUF107  27.27 
 
 
150 aa  45.8  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0728  hypothetical protein  27.27 
 
 
152 aa  45.4  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3388  hypothetical protein  28.26 
 
 
153 aa  45.4  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000297052  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0493  protein of unknown function DUF107  31.16 
 
 
156 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000358021  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5110  hypothetical protein  30.56 
 
 
151 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.000397496  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3005  protein of unknown function DUF107  25.35 
 
 
144 aa  44.3  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4130  hypothetical protein  29.71 
 
 
154 aa  44.3  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0281  membrane protein  29.2 
 
 
150 aa  43.9  0.0007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1033  protein of unknown function DUF107  25.18 
 
 
149 aa  43.9  0.0007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0545  hypothetical protein  28.26 
 
 
156 aa  43.5  0.0009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000254909  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3678  hypothetical protein  29.71 
 
 
156 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000205665  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0403  hypothetical protein  30.66 
 
 
143 aa  43.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0449  hypothetical protein  29.71 
 
 
156 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00108597  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3503  hypothetical protein  29.71 
 
 
156 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000560855  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0463  hypothetical protein  31.34 
 
 
157 aa  42.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000652394  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2220  hypothetical protein  30.14 
 
 
153 aa  42.7  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0134246 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1360  hypothetical protein  30.41 
 
 
148 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0257829 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14650  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  29.86 
 
 
144 aa  42  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000389934  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0069  hypothetical protein  29.08 
 
 
155 aa  42  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.473003  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0964  hypothetical protein  24.62 
 
 
150 aa  41.6  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.634862  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0074  hypothetical protein  29.08 
 
 
155 aa  40.8  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2129  hypothetical protein  30.15 
 
 
496 aa  40.8  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3721  hypothetical protein  24.66 
 
 
152 aa  40.8  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0930  hypothetical protein  29.45 
 
 
148 aa  40.4  0.008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2913  hypothetical protein  36.84 
 
 
423 aa  40.4  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>