More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0249 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3434  AMP-dependent synthetase and ligase  61.4 
 
 		 648 aa  839    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00276334 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0954  AMP-dependent synthetase and ligase  55.03 
 
 		 653 aa  749    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0249  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 655 aa  1363    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.463318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0260  AMP-dependent synthetase and ligase  69.46 
 
 		 652 aa  946    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2279  long chain acyl-CoA synthetase  54.87 
 
 		 653 aa  747    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5039  AMP-dependent synthetase and ligase  53.68 
 
 		 659 aa  684    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.578261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4012  AMP-dependent synthetase and ligase  54.39 
 
 		 657 aa  715    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2725  AMP-dependent synthetase and ligase  63.28 
 
 		 654 aa  853    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.171087 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3542  AMP-dependent synthetase and ligase  61.4 
 
 		 648 aa  833    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0604  AMP-dependent synthetase and ligase  60.47 
 
 		 648 aa  821    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0571131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0214  AMP-dependent synthetase and ligase  68.01 
 
 		 654 aa  911    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0113  AMP-dependent synthetase and ligase  57.05 
 
 		 661 aa  755    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5006  AMP-dependent synthetase and ligase  69.61 
 
 		 651 aa  949    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.604122  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0461  AMP-dependent synthetase and ligase  68.8 
 
 		 644 aa  936    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.185625  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0373  acyl-CoA synthetase  55.02 
 
 		 656 aa  737    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0048  AMP-dependent synthetase and ligase  57.39 
 
 		 658 aa  770    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.760787 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3365  AMP-dependent synthetase and ligase  75.51 
 
 		 661 aa  1027    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.865924  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0787  AMP-dependent synthetase and ligase  60.47 
 
 		 648 aa  793    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.418663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2217  AMP-dependent synthetase and ligase  56.58 
 
 		 653 aa  761    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3607  AMP-dependent synthetase and ligase  59.53 
 
 		 648 aa  789    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.385801 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0470  AMP-dependent synthetase and ligase  68.8 
 
 		 682 aa  936    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.282335  normal  0.146944 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1159  AMP-dependent synthetase and ligase  68.28 
 
 		 645 aa  922    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0623  AMP-dependent synthetase and ligase  47.61 
 
 		 647 aa  617  1e-175  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.431706  normal  0.0874065 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2424  AMP-dependent synthetase and ligase  48.25 
 
 		 649 aa  614  9.999999999999999e-175  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0545  AMP-dependent synthetase and ligase  47.62 
 
 		 649 aa  612  9.999999999999999e-175  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1597  AMP-dependent synthetase and ligase  45.97 
 
 		 633 aa  583  1.0000000000000001e-165  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0136  AMP-dependent synthetase and ligase  43.01 
 
 		 646 aa  560  1e-158  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1543  AMP-dependent synthetase and ligase  43.13 
 
 		 651 aa  556  1e-157  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00460036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5287  AMP-dependent synthetase and ligase  42.2 
 
 		 648 aa  535  1e-150  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2282  AMP-dependent synthetase and ligase  40.19 
 
 		 631 aa  501  1e-140  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1861  AMP-dependent synthetase and ligase  38.75 
 
 		 650 aa  478  1e-133  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0661736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4572  AMP-dependent synthetase and ligase  39.97 
 
 		 643 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3509  AMP-dependent synthetase and ligase  40.85 
 
 		 655 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1832  AMP-dependent synthetase and ligase  37.62 
 
 		 655 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.551344  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2308  AMP-dependent synthetase and ligase  39.32 
 
 		 657 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0111013 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3136  AMP-dependent synthetase and ligase  37.75 
 
 		 654 aa  463  1e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.601879 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3416  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic branched-chain amino acid-binding  37.64 
 
 		 656 aa  456  1e-127  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1569  AMP-dependent synthetase and ligase  38.3 
 
 		 642 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.325884 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0830  AMP-dependent synthetase and ligase  37.68 
 
 		 630 aa  458  1e-127  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_817  AMP-binding protein, long-chain fatty-acid-CoA ligase  36.61 
 
 		 630 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4176  AMP-dependent synthetase and ligase  38.18 
 
 		 642 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0297  AMP-dependent synthetase and ligase  38.33 
 
 		 643 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179639  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5715  putative long-chain-fatty-acid-CoA ligase  38.18 
 
 		 642 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.159052  normal  0.670212 
 
 
-
 
NC_002936  DET0946  AMP-binding protein  36.72 
 
 		 630 aa  449  1e-125  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.418296  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000403  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.8 
 
 		 650 aa  449  1e-125  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.702328  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2610  AMP-dependent synthetase and ligase  36.25 
 
 		 655 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1560  AMP-dependent synthetase and ligase  37.68 
 
 		 643 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.610668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2375  AMP-dependent synthetase and ligase  36.61 
 
 		 634 aa  421  1e-116  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2441  AMP-dependent synthetase and ligase  35.36 
 
 		 636 aa  405  1e-111  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3006  AMP-dependent synthetase and ligase  35 
 
 		 607 aa  390  1e-107  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000854556  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4099  AMP-dependent synthetase and ligase  34.48 
 
 		 623 aa  380  1e-104  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0406  AMP-dependent synthetase and ligase  35.42 
 
 		 609 aa  368  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4936  AMP-dependent synthetase and ligase  32.78 
 
 		 626 aa  363  5.0000000000000005e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.457065  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2355  AMP-dependent synthetase and ligase  33.67 
 
 		 610 aa  362  2e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.115359  normal  0.295722 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3503  AMP-dependent synthetase and ligase  32.52 
 
 		 618 aa  353  5e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.129901  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3837  AMP-dependent synthetase and ligase  33.77 
 
 		 601 aa  335  2e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.427679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4067  AMP-dependent synthetase and ligase  33.62 
 
 		 603 aa  334  3e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.675218  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0027  AMP-dependent synthetase and ligase  33.55 
 
 		 611 aa  329  9e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1529  AMP-dependent synthetase and ligase  32.84 
 
 		 605 aa  315  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.275012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1594  AMP-dependent synthetase and ligase  31.72 
 
 		 617 aa  304  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.129447  normal  0.216287 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0925  AMP-dependent synthetase and ligase  31.13 
 
 		 606 aa  299  9e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1619  AMP-dependent synthetase and ligase  32.73 
 
 		 604 aa  298  2e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0702243  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0968  AMP-dependent synthetase and ligase  31.57 
 
 		 607 aa  298  3e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.114084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1524  AMP-dependent synthetase and ligase  32.73 
 
 		 604 aa  297  3e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  31.24 
 
 		 633 aa  298  3e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2345  AMP-dependent synthetase and ligase  32.41 
 
 		 604 aa  296  6e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2618  AMP-dependent synthetase and ligase  31.03 
 
 		 610 aa  294  3e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0984  AMP-dependent synthetase and ligase  30.3 
 
 		 606 aa  290  7e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.423354  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2937  AMP-dependent synthetase and ligase  32.56 
 
 		 610 aa  286  8e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0981  AMP-dependent synthetase and ligase  30.13 
 
 		 606 aa  286  9e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2259  AMP-dependent synthetase and ligase  31.96 
 
 		 616 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000572274  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2886  AMP-dependent synthetase and ligase  31.06 
 
 		 633 aa  284  3.0000000000000004e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4574  AMP-dependent synthetase and ligase  31.09 
 
 		 649 aa  283  5.000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3508  AMP-dependent synthetase and ligase  30.03 
 
 		 607 aa  283  6.000000000000001e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0185945  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3196  AMP-dependent synthetase and ligase  29.8 
 
 		 622 aa  280  4e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3729  AMP-dependent synthetase and ligase  30.65 
 
 		 594 aa  280  6e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00824  hypothetical protein  30.29 
 
 		 602 aa  275  2.0000000000000002e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2093  AMP-dependent synthetase and ligase  30.51 
 
 		 603 aa  273  8.000000000000001e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000290316 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3607  AMP-dependent synthetase and ligase  31.05 
 
 		 602 aa  273  8.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.12071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3514  AMP-dependent synthetase and ligase  30.41 
 
 		 612 aa  273  9e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3602  AMP-dependent synthetase and ligase  31.05 
 
 		 602 aa  273  9e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0482312  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3675  AMP-dependent synthetase and ligase  31.05 
 
 		 602 aa  273  9e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.438737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2458  AMP-dependent synthetase and ligase  30.81 
 
 		 612 aa  271  2e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001650  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.46 
 
 		 602 aa  271  2.9999999999999997e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2750  putative AMP-binding enzyme  29.51 
 
 		 611 aa  271  2.9999999999999997e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0972  long-chain fatty-acid-CoA ligase  28.9 
 
 		 610 aa  267  5e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3330  AMP-dependent synthetase and ligase  30.86 
 
 		 616 aa  266  1e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2125  AMP-dependent synthetase and ligase  29.93 
 
 		 603 aa  266  1e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00466238  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24920  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  31.09 
 
 		 599 aa  265  2e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1391  AMP-dependent synthetase and ligase  27.7 
 
 		 610 aa  265  3e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3595  long-chain-fatty-acid--CoA ligase (acyl-CoA synthetase)  28.16 
 
 		 587 aa  264  4e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1021  AMP-dependent synthetase and ligase  28.01 
 
 		 607 aa  263  6e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.336741 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1953  AMP-dependent synthetase and ligase  30.1 
 
 		 613 aa  263  6.999999999999999e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.163962 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3794  AMP-dependent synthetase and ligase  28.99 
 
 		 601 aa  261  2e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  27.44 
 
 		 610 aa  261  3e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.924461  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3732  AMP-dependent synthetase and ligase  29.14 
 
 		 590 aa  260  5.0000000000000005e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1894  AMP-dependent synthetase and ligase  30.7 
 
 		 613 aa  260  5.0000000000000005e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.391707  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3402  AMP binding protein  29.62 
 
 		 601 aa  260  6e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3532  AMP-dependent synthetase and ligase  29.62 
 
 		 601 aa  260  6e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5953  AMP-dependent synthetase and ligase  29.22 
 
 		 612 aa  259  7e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.664785  normal  0.0418717 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>