More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0246 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_0246  peptidase M48, Ste24p  100 
 
 
442 aa  910    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2222  peptidase M48 Ste24p  62.7 
 
 
445 aa  546  1e-154  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3171  peptidase M48 Ste24p  43.51 
 
 
445 aa  383  1e-105  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2972  peptidase M48 Ste24p  46.42 
 
 
447 aa  380  1e-104  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.297503  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2967  peptidase M48, Ste24p  45.92 
 
 
453 aa  376  1e-103  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.913599 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3335  peptidase M48 Ste24p  47.18 
 
 
474 aa  334  2e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1779  peptidase M48 Ste24p  43.81 
 
 
443 aa  331  2e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00812626  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0867  peptidase M48, Ste24p  34.28 
 
 
427 aa  175  9.999999999999999e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1050  peptidase M48, Ste24p  31.47 
 
 
424 aa  167  2.9999999999999998e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1212  Zn-dependent protease, putative  31.26 
 
 
436 aa  158  2e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000776404  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0821  peptidase M48, Ste24p  34.04 
 
 
432 aa  154  2.9999999999999998e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.371859  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2749  peptidase M48 Ste24p  39.46 
 
 
494 aa  152  8e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.114888  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1307  hypothetical protein  35.36 
 
 
490 aa  149  7e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.31128  normal  0.470451 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3748  regulatory protein, ArsR  29.88 
 
 
423 aa  148  2.0000000000000003e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.857978 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0581  peptidase M48 Ste24p  27.41 
 
 
424 aa  147  3e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0013814  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4160  peptidase M48 Ste24p  33.33 
 
 
489 aa  146  8.000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0504491  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4877  peptidase M48 Ste24p  34.26 
 
 
492 aa  144  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5784  putative lipoprotein  33.91 
 
 
479 aa  144  4e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0040  hypothetical protein  33.1 
 
 
513 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.257159 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0539  peptidase M48, Ste24p  32.86 
 
 
478 aa  139  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1042  peptidase M48 Ste24p  35.9 
 
 
489 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66690  putative protease  33.83 
 
 
479 aa  133  7.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1692  peptidase M48 Ste24p  34.07 
 
 
504 aa  132  1.0000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.147911 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1046  peptidase M48 Ste24p  36.95 
 
 
489 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.615139  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0402  peptidase M48, Ste24p  32.74 
 
 
529 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0617  peptidase M48, Ste24p  38.43 
 
 
479 aa  127  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0368474  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0985  peptidase M48, Ste24p  36.45 
 
 
489 aa  126  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.932429  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1755  peptidase M48 Ste24p  29.05 
 
 
493 aa  123  7e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.593402 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2567  peptidase M48, Ste24p  27.78 
 
 
392 aa  120  7e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2092  peptidase M48 Ste24p  32.07 
 
 
280 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1437  M48 family peptidase  34.02 
 
 
264 aa  116  7.999999999999999e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142211  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1555  peptidase M48, Ste24p  26.95 
 
 
481 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4358  peptidase M48 Ste24p  34.68 
 
 
282 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3390  peptidase M48 Ste24p  31.49 
 
 
268 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000240796  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0856  peptidase M48 Ste24p  33.33 
 
 
268 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0123  putative exported peptidase  29.75 
 
 
479 aa  114  3e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1238  peptidase M48, Ste24p  31.97 
 
 
278 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0665176  normal  0.164191 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2122  TPR repeat-containing protein  27.39 
 
 
483 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.318434  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3305  peptidase M48, Ste24p  30.85 
 
 
278 aa  113  6e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.137005  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1099  peptidase M48, Ste24p  29.69 
 
 
365 aa  113  6e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00000343868  hitchhiker  0.000201004 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1904  peptidase M48, Ste24p  34.57 
 
 
493 aa  113  8.000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.429469  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4327  peptidase M48 Ste24p  33.64 
 
 
286 aa  110  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3581  peptidase M48 Ste24p  32.24 
 
 
266 aa  108  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000704965  normal  0.319279 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0404  peptidase M48 Ste24p  29.82 
 
 
604 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.527715  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1260  hypothetical protein  32.86 
 
 
275 aa  108  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.617614  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0844  peptidase M48 Ste24p  31.95 
 
 
470 aa  108  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000290245  normal  0.0785618 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0107  putative lipoprotein  31.15 
 
 
262 aa  107  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0123  peptidase M48 Ste24p  32.77 
 
 
279 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0120  peptidase M48 Ste24p  32.77 
 
 
279 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0733637 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0926  peptidase M48, Ste24p  30.05 
 
 
481 aa  106  7e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.240705 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2301  peptidase M48 Ste24p  30.74 
 
 
270 aa  105  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.114592  normal  0.277953 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1448  peptidase M48 Ste24p  27.66 
 
 
469 aa  105  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.749654  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1841  peptidase M48, Ste24p  28.57 
 
 
485 aa  105  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.891186  normal  0.107833 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0556  peptidase M48 Ste24p  26.95 
 
 
384 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.12089  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3407  peptidase M48, Ste24p  31.66 
 
 
266 aa  104  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.029445  hitchhiker  0.000231655 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2792  peptidase M48 Ste24p  30 
 
 
479 aa  103  9e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3127  M48 family peptidase  26.98 
 
 
494 aa  102  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000135694  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0483  peptidase M48 Ste24p  25.73 
 
 
490 aa  102  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00260218 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3623  TPR repeat-containing Zn-dependent protease  30.86 
 
 
294 aa  102  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.619094  normal  0.846236 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0990  peptidase M48 Ste24p  33.98 
 
 
247 aa  102  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218091  normal  0.424626 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2619  peptidase M48, Ste24p  28.84 
 
 
484 aa  101  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2068  peptidase M48 Ste24p  32.63 
 
 
320 aa  102  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1356  peptidase M48 Ste24p  26.98 
 
 
524 aa  102  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.107911  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2169  peptidase M48 Ste24p  28.91 
 
 
486 aa  101  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.139537  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1239  M48 family peptidase  26.98 
 
 
494 aa  101  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000273921  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2483  peptidase M48, Ste24p  31.38 
 
 
500 aa  101  3e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0183  peptidase M48 Ste24p  27.86 
 
 
632 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.457604 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2828  peptidase M48 Ste24p  30.56 
 
 
284 aa  99.8  8e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1212  peptidase M48  31.47 
 
 
285 aa  99.4  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1850  peptidase M48, Ste24p  30.84 
 
 
278 aa  99.8  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1971  peptidase M48 Ste24p  32.84 
 
 
486 aa  99  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.436824  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1630  peptidase M48 Ste24p  25.67 
 
 
474 aa  98.2  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.685537  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3517  peptidase M48 Ste24p  28.21 
 
 
487 aa  97.8  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000725556  normal  0.963067 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0188  peptidase M48 Ste24p  27.48 
 
 
632 aa  97.8  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1308  peptidase M48, Ste24p  31.65 
 
 
293 aa  97.8  4e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.038834  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1695  peptidase M48, Ste24p  32 
 
 
485 aa  97.4  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2437  peptidase M48, Ste24p  29.28 
 
 
486 aa  97.8  4e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00870552 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3089  peptidase M48, Ste24p  32.54 
 
 
483 aa  97.1  6e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4269  hypothetical protein  30.43 
 
 
513 aa  96.7  8e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0130  peptidase M48, Ste24p  32.34 
 
 
528 aa  96.3  9e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2378  peptidase M48 Ste24p  29.55 
 
 
640 aa  96.3  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2250  peptidase M48, Ste24p  28.96 
 
 
284 aa  95.9  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.581419  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2347  peptidase M48, Ste24p  32.34 
 
 
489 aa  95.5  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.300143  decreased coverage  0.00000000108832 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2419  peptidase M48, Ste24p  32.34 
 
 
489 aa  95.9  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.339461  hitchhiker  0.00116652 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1649  peptidase M48, Ste24p  32.34 
 
 
489 aa  95.5  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02386  predicted peptidase  29.95 
 
 
487 aa  95.5  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0985911  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1175  peptidase M48 Ste24p  29.95 
 
 
487 aa  95.5  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.108568  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2776  M48 family peptidase  29.95 
 
 
487 aa  95.5  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00342563  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1827  peptidase M48 Ste24p  32.18 
 
 
489 aa  95.1  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.223751  normal  0.279951 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2869  hypothetical protein  32.5 
 
 
489 aa  95.1  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1182  peptidase M48 Ste24p  29.95 
 
 
487 aa  95.5  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0564416 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2628  M48 family peptidase  29.95 
 
 
487 aa  95.5  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2495  peptidase M48 Ste24p  32.18 
 
 
489 aa  95.1  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1783  peptidase M48 Ste24p  32.18 
 
 
489 aa  95.1  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.510736  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1647  peptidase M48, Ste24p  31.82 
 
 
490 aa  95.5  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1790  peptidase M48 Ste24p  32.18 
 
 
489 aa  95.1  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2220  peptidase M48 Ste24p  25.4 
 
 
474 aa  95.1  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.687721  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2641  M48 family peptidase  29.95 
 
 
487 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.938933  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02348  hypothetical protein  29.95 
 
 
487 aa  95.5  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.14863  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1755  peptidase M48, Ste24p  32 
 
 
489 aa  95.1  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>