18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0245 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0245  Outer membrane autotransporter barrel  100 
 
 		 2175 aa  4166    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.203155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1670  outer membrane autotransporter  34.74 
 
 		 3046 aa  288  8e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.999552 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0933  outer membrane autotransporter  33.88 
 
 		 4248 aa  173  4e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0250  outer membrane autotransporter  33.66 
 
 		 4368 aa  151  1.0000000000000001e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3958  putative outer membrane autotransporter barrel precursor  44.79 
 
 		 907 aa  109  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0263  hypothetical protein  36.43 
 
 		 3497 aa  99  8e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2539  Outer membrane autotransporter barrel  27.54 
 
 		 1778 aa  96.7  5e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0779  hypothetical protein  25.07 
 
 		 1881 aa  72  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1203  outer membrane autotransporter  23.84 
 
 		 1769 aa  65.1  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1329  outer membrane autotransporter  27.53 
 
 		 1058 aa  53.1  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0892684  normal  0.563685 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3756  Outer membrane autotransporter barrel  22.86 
 
 		 3506 aa  51.2  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1566  Outer membrane autotransporter barrel  25.11 
 
 		 1119 aa  50.1  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6533  Outer membrane autotransporter barrel  22.87 
 
 		 3822 aa  50.1  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6767  outer membrane autotransporter  22.87 
 
 		 4238 aa  49.7  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6355  outer membrane autotransporter  22.67 
 
 		 4238 aa  48.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.51084 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1511  outer membrane autotransporter  29.83 
 
 		 1886 aa  48.5  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.188015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0132  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.83 
 
 		 972 aa  47.4  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0728  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30.23 
 
 		 1256 aa  47  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.23429  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>