26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0201 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0201  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems permease components-like protein  100 
 
 		 254 aa  473  1e-132  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00810326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0970  ABC-3 protein  42.98 
 
 		 265 aa  144  1e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0669688  normal  0.103555 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3050  ABC-3 protein  40.51 
 
 		 271 aa  142  5e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0492  ABC-3 protein  42.92 
 
 		 266 aa  136  3.0000000000000003e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2437  ABC-3 protein  31.75 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.336172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2130  ABC-3 protein  26.88 
 
 		 286 aa  55.8  0.0000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0882717 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3229  ABC-3 protein  29.75 
 
 		 289 aa  54.7  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0676629  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0518  ABC-3 protein  21.43 
 
 		 269 aa  53.9  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2208  ABC-3 protein  27.39 
 
 		 285 aa  53.9  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.033424  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0044  ABC-3 protein  21.7 
 
 		 277 aa  52.4  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000363337  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0549  hypothetical protein  21.72 
 
 		 284 aa  51.6  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0152073  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1916  ABC-3 protein  26.09 
 
 		 285 aa  51.6  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0155805  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0221  hypothetical protein  27.27 
 
 		 300 aa  50.4  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.860948  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1702  chelated iron ABC transporter, permease protein YfeD  25.1 
 
 		 297 aa  48.5  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2633  chelated iron transport system membrane protein  25.1 
 
 		 297 aa  48.5  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal  0.711765 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1812  ABC-3 protein  25.1 
 
 		 297 aa  48.5  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0136745  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1256  ABC-3 protein  33.01 
 
 		 276 aa  47  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.829859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2647  ABC-3 protein  23.26 
 
 		 276 aa  47  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0502  ABC-3 protein  20.68 
 
 		 266 aa  46.6  0.0004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.24311  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0156  zinc ABC transporter, permease protein  20.08 
 
 		 270 aa  45.4  0.0008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.202162  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1143  ABC-3 protein  28.51 
 
 		 294 aa  44.7  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0463  ABC-3 protein  23.22 
 
 		 264 aa  43.5  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.826396  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0280  ABC-3 protein  25.24 
 
 		 278 aa  43.5  0.004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0347715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2892  ABC-3 transporter component  28.57 
 
 		 285 aa  42.7  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2144  high-affinity zinc transporter membrane component  27.2 
 
 		 261 aa  42.4  0.008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0252479  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2775  high-affinity zinc transporter membrane component  27.2 
 
 		 261 aa  42  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000664264  hitchhiker  0.0068137 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>