More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0097 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_0097  hypothetical protein  100 
 
 
304 aa  589  1e-167  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.112407  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  42.07 
 
 
315 aa  207  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  38.01 
 
 
305 aa  200  3e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.6 
 
 
325 aa  194  2e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.86 
 
 
292 aa  193  3e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0530  hypothetical protein  42.71 
 
 
341 aa  191  2e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.584657  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  41.67 
 
 
289 aa  186  4e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1865  hypothetical protein  42.31 
 
 
328 aa  181  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1695  hypothetical protein  42.71 
 
 
311 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1542  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.2 
 
 
292 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4316  hypothetical protein  41.44 
 
 
310 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4050  hypothetical protein  41.1 
 
 
310 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0672  hypothetical protein  40.34 
 
 
325 aa  152  7e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.176077  normal  0.524236 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3184  hypothetical protein  41.12 
 
 
315 aa  147  3e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.546579  normal  0.703778 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1024  hypothetical protein  39.69 
 
 
330 aa  143  3e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02670  predicted permease, DMT superfamily  32.11 
 
 
319 aa  117  1.9999999999999998e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0129  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.24 
 
 
283 aa  109  5e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1702  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.32 
 
 
302 aa  107  2e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.352845  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3425  hypothetical protein  28.36 
 
 
310 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4508  integral membrane protein  26.07 
 
 
309 aa  104  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563212  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0937  hypothetical protein  28.04 
 
 
310 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1524  hypothetical protein  28.14 
 
 
312 aa  104  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.499904  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3353  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.73 
 
 
310 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0953  hypothetical protein  28.41 
 
 
310 aa  102  6e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.100703  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3550  hypothetical protein  27.64 
 
 
310 aa  102  8e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4503  hypothetical protein  27.27 
 
 
309 aa  101  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00148993 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4157  DMT family permease  26.35 
 
 
309 aa  99.4  7e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000489633  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  28.04 
 
 
299 aa  98.2  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4168  permeases of the drug/metabolite transporter (DMT)  27.08 
 
 
311 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.221065  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  29 
 
 
293 aa  95.1  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0739  hypothetical protein  24.91 
 
 
303 aa  94.4  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159061  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0439  YyaM  29.63 
 
 
301 aa  93.2  5e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.48 
 
 
300 aa  92.8  6e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124016  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2645  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.01 
 
 
309 aa  92.4  8e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1277  hypothetical protein  31.96 
 
 
310 aa  92.4  9e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.507228  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0993  transporter, EamA family  24.46 
 
 
303 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00144449  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0919  EamA family protein  24.46 
 
 
303 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.23491  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0924  transporter, EamA family  24.46 
 
 
303 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64365e-45 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0725  DMT family permease  24.46 
 
 
303 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.123032  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0789  EamA family protein  24.46 
 
 
303 aa  90.5  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000376936  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0738  DMT family permease  24.46 
 
 
303 aa  90.9  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000110425  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0829  eama family protein  24.46 
 
 
303 aa  90.5  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000248571  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1853  transporter, EamA family  27.72 
 
 
294 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4453  transporter, EamA family  23.74 
 
 
303 aa  89.4  7e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0045987  normal  0.86451 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3405  transporter, EamA family  26.24 
 
 
294 aa  89.4  8e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0882  transporter, EamA family  23.74 
 
 
303 aa  89.4  8e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0755337  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0679  hypothetical protein  24.82 
 
 
302 aa  88.6  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0987  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.04 
 
 
310 aa  87.8  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3379  transporter, EamA family  27.48 
 
 
294 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2576  hypothetical protein  26.52 
 
 
329 aa  87  4e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.398851 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3174  EamA family protein  26.24 
 
 
294 aa  86.7  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3424  eama family protein  26.24 
 
 
294 aa  86.7  5e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2723  hypothetical protein  26.64 
 
 
309 aa  86.7  5e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.297419  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3401  integral membrane protein  25.18 
 
 
294 aa  85.9  8e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.531981  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2630  hypothetical protein  29.69 
 
 
309 aa  85.9  8e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.815333 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1447  hypothetical protein  32.72 
 
 
301 aa  85.9  9e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23861  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3158  EamA family protein  26.24 
 
 
294 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0391  hypothetical protein  25.75 
 
 
330 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0667129  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4826  hypothetical protein  30.46 
 
 
300 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0072  hypothetical protein  23.78 
 
 
295 aa  84.3  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0334  hypothetical protein  28.85 
 
 
313 aa  84.7  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3393  transporter, EamA family  26.49 
 
 
294 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0743  hypothetical protein  25.09 
 
 
299 aa  82.8  0.000000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1212  hypothetical protein  24.01 
 
 
299 aa  82.8  0.000000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6147  hypothetical protein  33.33 
 
 
299 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.609004 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3867  hypothetical protein  31.73 
 
 
310 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.45917  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5782  hypothetical protein  33.33 
 
 
299 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1828  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.95 
 
 
310 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000133968  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2185  hypothetical protein  31.32 
 
 
291 aa  81.3  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1696  hypothetical protein  27.66 
 
 
296 aa  80.5  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4364  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.93 
 
 
299 aa  80.1  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00133348  normal  0.499303 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4318  hypothetical protein  29.64 
 
 
301 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3809  integral membrane protein  26.71 
 
 
298 aa  79.7  0.00000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.770617  normal  0.329241 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2828  hypothetical protein  27.51 
 
 
294 aa  79.7  0.00000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.474129  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50670  hypothetical protein  28.72 
 
 
301 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0191207 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3085  hypothetical protein  29.43 
 
 
319 aa  78.6  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.229103  normal  0.567857 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6627  hypothetical protein  33.19 
 
 
299 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.725322 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2849  hypothetical protein  31.1 
 
 
286 aa  78.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3057  transporter, EamA family  25.25 
 
 
303 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2848  EamA family protein  24.42 
 
 
303 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3137  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.81 
 
 
331 aa  77.8  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1029  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.11 
 
 
304 aa  78.2  0.0000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3075  EamA family protein  26.24 
 
 
294 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6116  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.7 
 
 
330 aa  78.2  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.51682  normal  0.0433001 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3061  eama family protein  24.42 
 
 
303 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2900  hypothetical protein  29.11 
 
 
308 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.149951  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3097  hypothetical protein  25.35 
 
 
295 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.27047  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1938  hypothetical protein  25.25 
 
 
309 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.94685  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2111  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.24 
 
 
292 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3092  EamA family protein  24.34 
 
 
303 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00288744  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3033  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.74 
 
 
286 aa  77.4  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0835297  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0739  hypothetical protein  27.86 
 
 
294 aa  77  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.354242  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3740  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.14 
 
 
305 aa  77  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.184677 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4078  hypothetical protein  31.4 
 
 
317 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.958621  normal  0.522177 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1323  hypothetical protein  31.4 
 
 
291 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1258  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.56 
 
 
305 aa  76.6  0.0000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0398  EamA family protein  27.57 
 
 
316 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7691  hypothetical protein  35.38 
 
 
299 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.327195 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0456  transporter, EamA family  27.76 
 
 
316 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0411  eama family protein  27.57 
 
 
316 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>