28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0068 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0068  heptaprenyl diphosphate synthase component I  100 
 
 		 176 aa  334  2.9999999999999997e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0773  Heptaprenyl diphosphate synthase component I  72.73 
 
 		 183 aa  221  3e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0124947  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0527  hypothetical protein  66.87 
 
 		 182 aa  197  6e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.222006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0351  heptaprenyl diphosphate synthase component I  49.69 
 
 		 181 aa  125  3e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2908  Heptaprenyl diphosphate synthase component I  50.6 
 
 		 170 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.634002  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0235  heptaprenyl diphosphate synthase component I  38.92 
 
 		 169 aa  90.5  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2404  Heptaprenyl diphosphate synthase component I  50 
 
 		 190 aa  87  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.604994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0037  hypothetical protein  40.24 
 
 		 196 aa  87  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1955  heptaprenyl diphosphate synthase component I  37.8 
 
 		 184 aa  78.6  0.00000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0511  Heptaprenyl diphosphate synthase component I  40.54 
 
 		 177 aa  76.3  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00260185  decreased coverage  0.0000000000443177 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14270  heptaprenyl diphosphate synthase component I  39.34 
 
 		 175 aa  72.8  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  6.02688e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2361  hypothetical protein  30.18 
 
 		 171 aa  65.5  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0671  heptaprenyl diphosphate synthase component I  30.11 
 
 		 184 aa  59.3  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00676924  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1501  Heptaprenyl diphosphate synthase component I  28.4 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000102642  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21280  predicted membrane protein  36.94 
 
 		 408 aa  57  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0213  heptaprenyl diphosphate synthase component I  26.09 
 
 		 161 aa  57  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1525  Heptaprenyl diphosphate synthase component I  28.93 
 
 		 176 aa  56.2  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1320  Heptaprenyl diphosphate synthase component I  33.33 
 
 		 177 aa  55.8  0.0000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000587453  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1237  heptaprenyl diphosphate synthase component I  30.32 
 
 		 181 aa  55.1  0.0000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1098  Heptaprenyl diphosphate synthase component I  30.53 
 
 		 177 aa  54.7  0.0000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00124747  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1463  heptaprenyl diphosphate synthase component I  26.38 
 
 		 173 aa  54.3  0.0000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1464  hypothetical protein  30.54 
 
 		 176 aa  53.9  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0347661  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1218  heptaprenyl diphosphate synthase component I  29.68 
 
 		 181 aa  53.9  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0348  Heptaprenyl diphosphate synthase component I  33.33 
 
 		 177 aa  49.7  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1926  hypothetical protein  25.69 
 
 		 362 aa  49.7  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.777208  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1529  heptaprenyl diphosphate synthase component I  27.7 
 
 		 157 aa  47.4  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000681929  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0563  heptaprenyl diphosphate synthase component I  33.88 
 
 		 170 aa  46.2  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.752463  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2488  hypothetical protein  28.33 
 
 		 176 aa  45.1  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.133684  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>