More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0065 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_0065  flavin reductase-like, FMN-binding  100 
 
 
166 aa  340  4e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.99238e-16  normal  0.847147 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3468  flavin reductase-like, FMN-binding  49.38 
 
 
174 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.235276  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3504  flavin reductase domain-containing protein  48.12 
 
 
309 aa  156  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0504926  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3697  hypothetical protein  49.35 
 
 
168 aa  155  2e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.416114  normal  0.561141 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4106  flavin reductase domain-containing protein  47.4 
 
 
170 aa  149  2e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000156501 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0442  flavin reductase domain protein FMN-binding  44.51 
 
 
166 aa  147  7e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2888  flavin reductase domain-containing protein  47.74 
 
 
172 aa  146  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000413066 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0068  flavin reductase domain-containing protein  47.4 
 
 
186 aa  145  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0087  flavin reductase domain protein FMN-binding  47.4 
 
 
186 aa  145  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2119  flavin reductase domain-containing protein  45.57 
 
 
322 aa  145  3e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0096  flavin reductase domain-containing protein  46.75 
 
 
167 aa  144  6e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0938  flavin reductase-like, FMN-binding  47.13 
 
 
180 aa  144  8.000000000000001e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.940093  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4057  flavin reductase-like, FMN-binding  48.05 
 
 
172 aa  142  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0127  flavin reductase domain-containing protein  44.87 
 
 
173 aa  141  4e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0713  flavin reductase domain-containing protein  46.88 
 
 
171 aa  141  4e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.497373  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0355  flavin reductase domain-containing protein  47.5 
 
 
171 aa  140  5e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0401487  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2488  flavin reductase domain-containing protein  47.5 
 
 
171 aa  140  5e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.276719  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0895  flavin reductase family protein  47.5 
 
 
171 aa  140  5e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0770098  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0898  flavin reductase family protein  47.5 
 
 
171 aa  140  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0264693  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1057  flavin reductase domain-containing protein  47.5 
 
 
171 aa  140  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.667997  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0101  flavin reductase domain-containing protein  47.5 
 
 
171 aa  140  5e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0532908  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0092  flavin reductase domain-containing protein  46.15 
 
 
172 aa  141  5e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.817561  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0653  flavin reductase domain-containing protein  47.5 
 
 
171 aa  140  5e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0962723  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5585  flavin reductase domain protein FMN-binding  49.65 
 
 
311 aa  140  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.144422  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3017  nitrilotriacetate monooxygenase  50 
 
 
172 aa  140  8e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3743  flavin reductase domain-containing protein  50 
 
 
172 aa  140  8e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0126  flavin reductase-like, FMN-binding  46.15 
 
 
186 aa  140  8e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.765055 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6548  flavin reductase domain protein FMN-binding  50.35 
 
 
311 aa  140  9e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.43019  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32170  Flavin reductase domain protein  43.75 
 
 
313 aa  139  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0140  flavin reductase domain protein FMN-binding  46.1 
 
 
169 aa  138  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.829164  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1964  flavin reductase-like, FMN-binding  46.91 
 
 
169 aa  137  6e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277567  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2599  flavin reductase domain-containing protein  46.91 
 
 
169 aa  137  6e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2575  flavin reductase domain-containing protein  46.91 
 
 
169 aa  137  6e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3405  flavin reductase-like, FMN-binding  45.96 
 
 
180 aa  137  7e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6086  flavoprotein oxidoreductase  45.22 
 
 
306 aa  137  7e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.414273  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5501  flavin reductase domain protein FMN-binding  47.5 
 
 
311 aa  137  7e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2494  flavin reductase domain-containing protein  46.88 
 
 
169 aa  136  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.116898  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2623  flavin reductase domain-containing protein  46.88 
 
 
169 aa  136  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.906028  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5906  flavin reductase-like, FMN-binding  46.3 
 
 
169 aa  135  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.812224 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6253  flavin reductase domain-containing protein  47.77 
 
 
311 aa  135  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.103541  normal  0.25638 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3185  flavin reductase domain-containing protein  45.62 
 
 
182 aa  135  4e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0722  flavin reductase domain-containing protein  45 
 
 
169 aa  134  5e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.1645 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1792  flavin reductase domain-containing protein  47.02 
 
 
175 aa  133  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.688973 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0890  flavin reductase-like, FMN-binding  44.81 
 
 
408 aa  133  9.999999999999999e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0510  flavin reductase domain-containing protein  45 
 
 
174 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.094349  normal  0.146674 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4448  flavin reductase domain protein FMN-binding  44.65 
 
 
165 aa  132  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2957  flavin reductase-like, FMN-binding  43.75 
 
 
171 aa  132  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0220717 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4835  flavin reductase-like, FMN-binding  43.48 
 
 
186 aa  132  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7180  flavin reductase-like, FMN-binding  44.51 
 
 
175 aa  131  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.050322 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0763  putative monooxygenase oxidoreductase protein  46.15 
 
 
191 aa  131  5e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.205709 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6306  flavin reductase domain-containing protein  44.79 
 
 
175 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.836569  normal  0.357776 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0737  putative flavin reductase-like protein  43.75 
 
 
169 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6010  flavin reductase domain-containing protein  44.51 
 
 
175 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3225  flavin reductase domain protein FMN-binding  43.12 
 
 
169 aa  128  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6362  flavin reductase domain-containing protein  45 
 
 
175 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5488  flavin reductase-like, FMN-binding  45 
 
 
175 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.968149  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6774  flavin reductase domain-containing protein  45 
 
 
175 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3189  flavin reductase domain-containing protein  42.76 
 
 
304 aa  127  5.0000000000000004e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0378  flavin reductase domain-containing protein  45.57 
 
 
168 aa  127  7.000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.557848  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5008  flavin reductase domain-containing protein  46.1 
 
 
173 aa  127  9.000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.442904  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3603  putative oxygenase  43.31 
 
 
172 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000000048428  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2646  flavin reductase-like, FMN-binding  42.01 
 
 
204 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1345  flavin reductase-like, FMN-binding  43.59 
 
 
174 aa  125  3e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000569792  hitchhiker  0.00000938161 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6044  flavin reductase domain-containing protein  43.95 
 
 
226 aa  125  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.347531  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5938  flavin reductase domain-containing protein  43.95 
 
 
226 aa  125  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0245052 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6241  flavin reductase domain-containing protein  43.51 
 
 
170 aa  124  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1408  flavin reductase domain-containing protein  44.03 
 
 
173 aa  124  5e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.913162  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1836  hypothetical protein  44.52 
 
 
183 aa  124  6e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0567658  normal  0.110727 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5305  flavin reductase domain protein FMN-binding  42.95 
 
 
184 aa  124  6e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3429  flavin reductase domain-containing protein  50.34 
 
 
172 aa  124  8.000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.316172 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5977  flavin reductase domain-containing protein  43.31 
 
 
226 aa  123  9e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  0.320583 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0779  flavin reductase domain protein FMN-binding  42.94 
 
 
192 aa  122  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0273259  normal  0.15291 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4664  flavin reductase-like, FMN-binding  44.59 
 
 
191 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3699  flavin reductase domain-containing protein  44.59 
 
 
191 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.927223  normal  0.318352 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3822  flavin reductase domain-containing protein  44.59 
 
 
175 aa  122  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.57201 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4324  flavin reductase domain-containing protein  44.08 
 
 
327 aa  121  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.160185 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0713  flavin reductase domain protein FMN-binding  42.35 
 
 
192 aa  121  5e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0114519  normal  0.0515265 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6121  flavin reductase domain-containing protein  41.88 
 
 
311 aa  120  9e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.272267  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2092  Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family  39.87 
 
 
207 aa  119  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.934907  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6310  flavin reductase-like, FMN-binding  43.31 
 
 
161 aa  118  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1628  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  38.31 
 
 
191 aa  117  7e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.96202  normal  0.763872 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5504  flavin reductase domain protein FMN-binding  41.56 
 
 
330 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.414218  decreased coverage  0.000482944 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3318  flavin reductase-like, FMN-binding  42.04 
 
 
170 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000349305  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0811  flavin reductase-like, FMN-binding  38.41 
 
 
186 aa  115  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5305  flavin reductase domain-containing protein  34.73 
 
 
188 aa  115  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.843488  normal  0.297216 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1841  flavin reductase-like, FMN-binding  40.4 
 
 
161 aa  115  3e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2689  flavin reductase domain-containing protein  44.74 
 
 
181 aa  115  3e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2411  flavin reductase-like, FMN-binding  42.21 
 
 
182 aa  114  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13600  oxidoreductase  35.8 
 
 
187 aa  114  6e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.295254  normal  0.297766 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0922  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  37.91 
 
 
190 aa  114  6.9999999999999995e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5091  flavin reductase domain-containing protein  35.33 
 
 
188 aa  114  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.504417 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4792  flavin reductase domain-containing protein  35.33 
 
 
188 aa  114  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.971177  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4706  flavin reductase-like, FMN-binding protein  34.73 
 
 
204 aa  112  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4187  flavin reductase domain-containing protein  40.51 
 
 
156 aa  111  5e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.344162  hitchhiker  0.00000247222 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26130  conserved protein of DIM6/NTAB family  38.56 
 
 
179 aa  110  6e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.861848  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0221  flavin reductase domain-containing protein  37.75 
 
 
393 aa  110  9e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4322  flavin reductase domain-containing protein  39.61 
 
 
156 aa  110  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.495347 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2478  flavin reductase domain-containing protein  36.31 
 
 
302 aa  109  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.375829  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2722  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  40.37 
 
 
171 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0043012  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2215  nitrilotriacetate monooxygenase  39.39 
 
 
318 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.130283  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>