More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0056 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_0056  formyltetrahydrofolate deformylase  100 
 
 
289 aa  601  1.0000000000000001e-171  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.333172  normal  0.573023 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0584  formyltetrahydrofolate deformylase  81.51 
 
 
291 aa  498  1e-140  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0174  formyltetrahydrofolate deformylase  71.13 
 
 
287 aa  435  1e-121  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4033  formyltetrahydrofolate deformylase  71.38 
 
 
287 aa  427  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.971472  hitchhiker  0.00329385 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5913  formyltetrahydrofolate deformylase  70.82 
 
 
296 aa  429  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.779943  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1367  formyltetrahydrofolate deformylase  66.31 
 
 
283 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0129513  normal  0.181813 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1007  formyltetrahydrofolate deformylase  65.96 
 
 
283 aa  391  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000029138  hitchhiker  0.000000000000593821 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4356  formyltetrahydrofolate deformylase  66.31 
 
 
283 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000805788  normal  0.0308915 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2073  formyltetrahydrofolate deformylase  63.21 
 
 
288 aa  389  1e-107  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0345334  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1693  formyltetrahydrofolate deformylase  64.64 
 
 
290 aa  390  1e-107  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4447  formyltetrahydrofolate deformylase  65.96 
 
 
283 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000794151  decreased coverage  0.00000544491 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4436  formyltetrahydrofolate deformylase  63.83 
 
 
282 aa  383  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00849533  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38280  formyltetrahydrofolate deformylase  63.12 
 
 
283 aa  377  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3312  formyltetrahydrofolate deformylase  63.48 
 
 
283 aa  377  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.929874  normal  0.815852 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4314  formyltetrahydrofolate deformylase  63.12 
 
 
283 aa  374  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000262425  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4018  formyltetrahydrofolate deformylase  63.12 
 
 
283 aa  374  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0329939  normal  0.0297352 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1020  formyltetrahydrofolate deformylase  63.93 
 
 
284 aa  376  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4882  formyltetrahydrofolate deformylase  64.18 
 
 
283 aa  375  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.784471  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56060  formyltetrahydrofolate deformylase  64.18 
 
 
283 aa  375  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2051  formyltetrahydrofolate deformylase  60.64 
 
 
285 aa  357  9.999999999999999e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000424508  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1352  formyltetrahydrofolate deformylase  57.14 
 
 
282 aa  350  1e-95  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000782528  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0786  formyltetrahydrofolate deformylase  58.1 
 
 
316 aa  343  1e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6765  formyltetrahydrofolate deformylase  55.9 
 
 
291 aa  343  2e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3654  formyltetrahydrofolate deformylase  58.62 
 
 
290 aa  341  9e-93  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1789  formyltetrahydrofolate deformylase  56.89 
 
 
283 aa  340  2e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02600  formyltetrahydrofolate deformylase  56.84 
 
 
292 aa  338  7e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.304695  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0486  formyltetrahydrofolate deformylase  57.19 
 
 
284 aa  335  5.999999999999999e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4965  formyltetrahydrofolate deformylase  54.86 
 
 
289 aa  332  5e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1740  formyltetrahydrofolate deformylase  55.63 
 
 
286 aa  325  4.0000000000000003e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2552  formyltetrahydrofolate deformylase  53.5 
 
 
284 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00445829 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0556  formyltetrahydrofolate deformylase  53.74 
 
 
297 aa  311  4.999999999999999e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00467  formyltetrahydrofolate deformylase  55.81 
 
 
267 aa  303  2.0000000000000002e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1110  formyltetrahydrofolate deformylase  51.79 
 
 
303 aa  301  8.000000000000001e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.344472  normal  0.241232 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5709  formyltetrahydrofolate deformylase  51.93 
 
 
287 aa  298  6e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.506805  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0154  formyltetrahydrofolate deformylase  52.33 
 
 
283 aa  293  2e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00603763  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4164  formyltetrahydrofolate deformylase  52.48 
 
 
287 aa  293  3e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.500211  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1577  formyltetrahydrofolate deformylase  51.06 
 
 
287 aa  291  6e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.621505 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0606  formyltetrahydrofolate deformylase  50.34 
 
 
289 aa  291  9e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00930988 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2012  formyltetrahydrofolate deformylase  49.48 
 
 
287 aa  290  2e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0750038 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2613  formyltetrahydrofolate deformylase  52.5 
 
 
294 aa  290  2e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.705504  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4904  formyltetrahydrofolate deformylase  52.5 
 
 
294 aa  290  2e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4704  formyltetrahydrofolate deformylase  52.58 
 
 
289 aa  290  2e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.452468  normal  0.348836 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1591  formyltetrahydrofolate deformylase  50.89 
 
 
284 aa  288  6e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0375  formyltetrahydrofolate deformylase  51.97 
 
 
283 aa  287  1e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1583  formyltetrahydrofolate deformylase  50.71 
 
 
287 aa  287  1e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.746954 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0336  formyltetrahydrofolate deformylase  49.31 
 
 
287 aa  287  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4112  formyltetrahydrofolate deformylase  49.66 
 
 
289 aa  286  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2543  formyltetrahydrofolate deformylase  52.54 
 
 
300 aa  285  5.999999999999999e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1873  formyltetrahydrofolate deformylase  51.41 
 
 
288 aa  285  7e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00824927  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0213  formyltetrahydrofolate deformylase  50.71 
 
 
283 aa  285  9e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.543031 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3853  formyltetrahydrofolate deformylase  50.86 
 
 
287 aa  284  1.0000000000000001e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.565594  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1488  formyltetrahydrofolate deformylase  51.25 
 
 
296 aa  284  1.0000000000000001e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.973322  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1837  formyltetrahydrofolate deformylase  49.14 
 
 
290 aa  284  1.0000000000000001e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.457824  normal  0.78955 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1631  formyltetrahydrofolate deformylase  51.25 
 
 
300 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043119  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4436  formyltetrahydrofolate deformylase  49.1 
 
 
284 aa  283  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.180137 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5200  formyltetrahydrofolate deformylase  50.18 
 
 
281 aa  283  2.0000000000000002e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.569737 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2382  formyltetrahydrofolate deformylase  50.35 
 
 
285 aa  283  2.0000000000000002e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0189  formyltetrahydrofolate deformylase  49.82 
 
 
284 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00979575 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2167  formyltetrahydrofolate deformylase  47.96 
 
 
294 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4374  formyltetrahydrofolate deformylase  49.1 
 
 
284 aa  283  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2781  formyltetrahydrofolate deformylase  47.96 
 
 
294 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.184484  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0428  formyltetrahydrofolate deformylase  50.35 
 
 
282 aa  283  3.0000000000000004e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0648  formyltetrahydrofolate deformylase  49.47 
 
 
282 aa  283  3.0000000000000004e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.101006  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6111  formyltetrahydrofolate deformylase  48.3 
 
 
294 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.481987  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2012  formyltetrahydrofolate deformylase  50.18 
 
 
299 aa  282  4.0000000000000003e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.436066  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2376  formyltetrahydrofolate deformylase  50 
 
 
293 aa  282  4.0000000000000003e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0552536 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2544  formyltetrahydrofolate deformylase  50.36 
 
 
282 aa  282  4.0000000000000003e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.553017  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1100  formyltetrahydrofolate deformylase  49.65 
 
 
283 aa  282  4.0000000000000003e-75  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.862849  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0419  formyltetrahydrofolate deformylase  50.35 
 
 
282 aa  282  4.0000000000000003e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0700542  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4562  formyltetrahydrofolate deformylase  49.29 
 
 
287 aa  282  5.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.307485  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2841  formyltetrahydrofolate deformylase  47.96 
 
 
294 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2699  formyltetrahydrofolate deformylase  47.96 
 
 
294 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.622702  normal  0.252245 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0127  formyltetrahydrofolate deformylase  50.9 
 
 
282 aa  281  7.000000000000001e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.236113  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0643  formyltetrahydrofolate deformylase  48.75 
 
 
284 aa  281  7.000000000000001e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0297  formyltetrahydrofolate deformylase  49.65 
 
 
282 aa  281  8.000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.338729  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0534  formyltetrahydrofolate deformylase  47.28 
 
 
294 aa  281  9e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232127  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2792  formyltetrahydrofolate deformylase  47.62 
 
 
294 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.329734 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1192  formyltetrahydrofolate deformylase  49.29 
 
 
283 aa  281  1e-74  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2971  formyltetrahydrofolate deformylase  50.36 
 
 
294 aa  280  2e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.266607 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1752  formyltetrahydrofolate deformylase  50.35 
 
 
288 aa  280  2e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1695  formyltetrahydrofolate deformylase  53.07 
 
 
295 aa  279  3e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0684131  normal  0.212705 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7341  formyltetrahydrofolate deformylase  51.43 
 
 
284 aa  280  3e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0997377  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2603  formyltetrahydrofolate deformylase  50.18 
 
 
294 aa  279  4e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.426643  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0438  formyltetrahydrofolate deformylase  49.11 
 
 
282 aa  279  4e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.275251  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00495  formyltetrahydrofolate deformylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11620)  48.44 
 
 
289 aa  278  5e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.39908  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3457  formyltetrahydrofolate deformylase  48.94 
 
 
284 aa  278  5e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0944  formyltetrahydrofolate deformylase  50.18 
 
 
294 aa  278  6e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2099  formyltetrahydrofolate deformylase  49.64 
 
 
289 aa  278  7e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.810337  normal  0.272125 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6004  formyltetrahydrofolate deformylase  48.21 
 
 
293 aa  278  9e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.91162  normal  0.0315018 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4789  formyltetrahydrofolate deformylase  49.82 
 
 
285 aa  277  1e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.284642  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1883  formyltetrahydrofolate deformylase  49.82 
 
 
291 aa  277  2e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0189555 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1866  formyltetrahydrofolate deformylase  49.1 
 
 
286 aa  277  2e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1951  formyltetrahydrofolate deformylase  49.1 
 
 
286 aa  277  2e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0609  formyltetrahydrofolate deformylase  48.24 
 
 
282 aa  276  2e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1114  formyltetrahydrofolate deformylase  49.29 
 
 
286 aa  276  2e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.851375  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1188  formyltetrahydrofolate deformylase  47.18 
 
 
286 aa  276  2e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000131662 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4206  formyltetrahydrofolate deformylase  48.77 
 
 
294 aa  276  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1153  formyltetrahydrofolate deformylase  49.47 
 
 
284 aa  275  4e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.677496  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2862  formyltetrahydrofolate deformylase  49.64 
 
 
284 aa  276  4e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.413616  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1303  formyltetrahydrofolate deformylase  48.99 
 
 
295 aa  275  7e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.154885 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>