51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0047 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0047  hypothetical protein  100 
 
 		 164 aa  347  5e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.3876 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0604  lipoprotein  43.9 
 
 		 163 aa  147  4e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1840  putative lipoprotein  36.97 
 
 		 165 aa  110  6e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0582073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1794  putative lipoprotein  39.44 
 
 		 193 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.568461 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3490  putative lipoprotein  36.99 
 
 		 166 aa  108  3e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.212629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2813  putative lipoprotein  36.3 
 
 		 166 aa  107  7.000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.205261  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2929  putative lipoprotein  40.8 
 
 		 183 aa  105  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.251431 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1552  putative lipoprotein  38.03 
 
 		 183 aa  102  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2382  lipoprotein  38.69 
 
 		 180 aa  99.8  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.335276  normal  0.0101048 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4089  putative lipoprotein  37.58 
 
 		 157 aa  99  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2191  lipoprotein  40.15 
 
 		 180 aa  97.8  5e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.768986  normal  0.0760523 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2595  putative lipoprotein  40.15 
 
 		 180 aa  97.4  7e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.154959 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1770  putative lipoprotein  37.33 
 
 		 184 aa  95.5  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2770  hypothetical protein  38.69 
 
 		 200 aa  94.4  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.172738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2854  putative lipoprotein  36.67 
 
 		 269 aa  93.2  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0673  lipoprotein  36.92 
 
 		 182 aa  93.2  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2793  putative lipoprotein  36.67 
 
 		 196 aa  92.8  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.571762  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2734  putative lipoprotein  36.67 
 
 		 196 aa  92.8  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3837  hypothetical protein  41.54 
 
 		 189 aa  90.9  6e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.139182  normal  0.877225 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0605  hypothetical protein  40 
 
 		 207 aa  90.1  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0959  putative lipoprotein  37.24 
 
 		 170 aa  89.7  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.62728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1056  hypothetical protein  36 
 
 		 185 aa  86.3  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1053  hypothetical protein  36.96 
 
 		 174 aa  84.7  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521655  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2130  hypothetical protein  34.67 
 
 		 185 aa  84  9e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.188656  normal  0.657299 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1174  hypothetical protein  34.67 
 
 		 202 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.496107  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0695  hypothetical protein  34.67 
 
 		 202 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.127782  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0908  putative lipoprotein  35.17 
 
 		 173 aa  82.4  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1150  hypothetical protein  34.67 
 
 		 184 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.35893 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4286  hypothetical protein  34.67 
 
 		 185 aa  81.3  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1356  hypothetical protein  30.88 
 
 		 172 aa  68.6  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3111  hypothetical protein  30.09 
 
 		 168 aa  58.2  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0919  hypothetical protein  28.46 
 
 		 177 aa  55.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.600843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5584  hypothetical protein  27.74 
 
 		 170 aa  55.5  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2071  hypothetical protein  26.23 
 
 		 173 aa  55.1  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0832  putative lipoprotein transmembrane  30.39 
 
 		 179 aa  54.3  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1899  hypothetical protein  25.81 
 
 		 201 aa  52.4  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.288907  normal  0.292321 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2222  putative transmembrane protein  27.52 
 
 		 150 aa  51.6  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.605647 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3397  putative lipoprotein transmembrane  27.55 
 
 		 171 aa  49.7  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.504524  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4052  putative lipoprotein transmembrane  27.27 
 
 		 171 aa  49.7  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6448  putative lipoprotein  23.87 
 
 		 168 aa  49.7  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.961477  normal  0.265781 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1438  lipoprotein transmembrane  24.79 
 
 		 172 aa  48.9  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.44922  normal  0.565531 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4200  transmembrane protein  26 
 
 		 171 aa  48.5  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1374  putative lipoprotein transmembrane  24.19 
 
 		 172 aa  48.1  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.399659  normal  0.101597 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1480  lipoprotein transmembrane  26.02 
 
 		 177 aa  47  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.028098  normal  0.441465 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4746  lipoprotein transmembrane  26.96 
 
 		 171 aa  47  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.398301  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4689  putative lipoprotein transmembrane  26.47 
 
 		 167 aa  46.2  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0954  lipoprotein transmembrane  26.77 
 
 		 175 aa  45.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0792012  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4572  putative transmembrane protein  25.22 
 
 		 173 aa  43.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.686255  normal  0.728328 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3500  hypothetical protein  25.22 
 
 		 173 aa  43.1  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0357475  normal  0.416536 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5112  putative lipoprotein transmembrane  27.78 
 
 		 166 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0220791  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4094  hypothetical protein  28.1 
 
 		 178 aa  40.4  0.01  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>