126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0020 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0020  peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 		 343 aa  696    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.732804  normal  0.419154 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0096  Peptidoglycan-binding LysM  46.29 
 
 		 349 aa  330  3e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0188  peptidoglycan-binding LysM  42.57 
 
 		 350 aa  290  2e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000749903 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3409  peptidoglycan-binding LysM  44.48 
 
 		 388 aa  265  7e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.392654  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0069  signal peptide protein  43.08 
 
 		 390 aa  263  4.999999999999999e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0834  peptidoglycan-binding LysM  38.71 
 
 		 401 aa  258  9e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0013  peptidoglycan-binding LysM-like protein  37.69 
 
 		 403 aa  258  1e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.154454 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0349  peptidoglycan-binding LysM  40.23 
 
 		 394 aa  258  1e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0885534 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4640  peptidoglycan-binding LysM  40.16 
 
 		 408 aa  256  3e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.132875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3680  Peptidoglycan-binding LysM  41.69 
 
 		 395 aa  255  7e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3357  Peptidoglycan-binding LysM  41.39 
 
 		 364 aa  251  9.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.695863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3879  peptidoglycan-binding LysM  41.11 
 
 		 430 aa  251  1e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4050  peptidoglycan-binding LysM  37.99 
 
 		 426 aa  251  1e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.021914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3861  peptidoglycan-binding LysM  38.34 
 
 		 409 aa  251  2e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3566  peptidoglycan-binding LysM  41.34 
 
 		 358 aa  250  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3395  Peptidoglycan-binding LysM  37.99 
 
 		 419 aa  248  1e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5114  Peptidoglycan-binding LysM  37.74 
 
 		 405 aa  246  4e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0439251  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4083  peptidoglycan-binding LysM  38.24 
 
 		 420 aa  242  6e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.164352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0282  putative signal peptide protein  37.71 
 
 		 387 aa  236  4e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0184346 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0056  peptidoglycan-binding LysM  38.22 
 
 		 345 aa  235  8e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4687  peptidoglycan-binding LysM  36.76 
 
 		 417 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2629  peptidoglycan-binding LysM  36.42 
 
 		 338 aa  222  9e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.829323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0194  peptidoglycan-binding LysM  36.76 
 
 		 383 aa  219  7e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00210  lysin domain-containing protein  37.42 
 
 		 341 aa  218  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0120002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3013  peptidoglycan-binding LysM  34.78 
 
 		 345 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0021  hypothetical protein  37.04 
 
 		 341 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.156222  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0022  hypothetical protein  33.43 
 
 		 352 aa  206  3e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.124597  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0176  LysM domain protein  36.11 
 
 		 341 aa  206  4e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0020  peptidoglycan-binding LysM  36.11 
 
 		 341 aa  206  6e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0018  peptidoglycan-binding LysM  35.28 
 
 		 341 aa  204  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000019767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0044  peptidoglycan-binding LysM  35.67 
 
 		 338 aa  202  6e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00180  peptidoglycan-binding LysM protein  35.19 
 
 		 341 aa  199  5e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0309659  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2519  hypothetical protein  34.29 
 
 		 345 aa  197  3e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2842  LysM domain-containing protein  33.33 
 
 		 341 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2649  hypothetical protein  34.01 
 
 		 345 aa  194  1e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2274  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  31.18 
 
 		 389 aa  181  2e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00514615 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3735  peptidoglycan-binding LysM  30.39 
 
 		 365 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.315042  hitchhiker  0.00230648 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2087  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  31.95 
 
 		 393 aa  162  7e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0025  peptidoglycan-binding LysM  28.99 
 
 		 368 aa  159  9e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2464  peptidoglycan-binding LysM  31.74 
 
 		 377 aa  155  1e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.175579 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0077  peptidoglycan-binding LysM  29.49 
 
 		 360 aa  155  1e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.820269 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2136  hypothetical protein  30 
 
 		 377 aa  151  2e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.116452 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0025  peptidoglycan-binding LysM  28.11 
 
 		 374 aa  151  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0025  peptidoglycan-binding LysM  29.71 
 
 		 369 aa  147  3e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3586  Peptidoglycan-binding LysM  30.13 
 
 		 377 aa  146  4.0000000000000006e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0036  peptidoglycan-binding LysM  28.72 
 
 		 374 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000243599 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0036  peptidoglycan-binding LysM  28.02 
 
 		 367 aa  145  9e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.971795  normal  0.107314 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0028  peptidoglycan-binding LysM  28.46 
 
 		 374 aa  145  1e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.198583 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0032  Peptidoglycan-binding LysM  27.96 
 
 		 376 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000235775 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0033  LysM domain-containing protein  28.91 
 
 		 378 aa  144  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0032  peptidoglycan-binding LysM  28.8 
 
 		 376 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105156 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0044  LysM domain-containing protein  29.62 
 
 		 346 aa  144  3e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.764087  normal  0.149636 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0033  peptidoglycan-binding LysM  28.8 
 
 		 376 aa  144  3e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0028  peptidoglycan-binding LysM  28.8 
 
 		 376 aa  144  3e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0030  peptidoglycan-binding LysM  28.19 
 
 		 374 aa  143  5e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.772252  hitchhiker  0.00540943 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0018  LysM domain protein  27.06 
 
 		 349 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0019  Peptidoglycan-binding LysM  27.06 
 
 		 349 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.154254 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2472  hypothetical protein  30.17 
 
 		 391 aa  141  1.9999999999999998e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0032  peptidoglycan-binding LysM  26.98 
 
 		 362 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0039  peptidoglycan-binding LysM  28.14 
 
 		 369 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.357546 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0076  putative cell wall degradation enzyme  29.33 
 
 		 353 aa  139  1e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00390  hypothetical protein  27.11 
 
 		 364 aa  137  4e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002058  LysM domain-containing protein  27.67 
 
 		 364 aa  132  6e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.778363  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04054  LysM domain protein  32.35 
 
 		 366 aa  131  2.0000000000000002e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0021  LysM domain-containing protein  26.02 
 
 		 361 aa  128  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00023  Peptidoglycan-binding LysM  27.97 
 
 		 367 aa  124  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.574097  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1866  peptidoglycan-binding LysM  30.89 
 
 		 384 aa  118  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1930  hypothetical protein  31.39 
 
 		 384 aa  116  6e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0024  peptidoglycan-binding LysM  28.93 
 
 		 359 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2695  peptidoglycan-binding LysM  27.87 
 
 		 435 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0516695  normal  0.123815 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0501  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  27.54 
 
 		 429 aa  103  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2866  hypothetical protein  30.59 
 
 		 329 aa  100  5e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3268  Peptidoglycan-binding LysM  27.11 
 
 		 339 aa  99  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000361142  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0530  peptidoglycan-binding LysM  24.15 
 
 		 331 aa  98.2  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2701  peptidoglycan-binding LysM  24.05 
 
 		 440 aa  96.3  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2887  Peptidoglycan-binding LysM  23.39 
 
 		 440 aa  95.5  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.94359  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0409  LysM domain-containing protein  27.58 
 
 		 333 aa  94.4  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000322112  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2794  Peptidoglycan-binding LysM  23.39 
 
 		 440 aa  93.6  4e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0244523  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3691  peptidoglycan-binding LysM  25.43 
 
 		 340 aa  90.1  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000027016  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1527  Peptidoglycan-binding LysM  27.34 
 
 		 338 aa  87.8  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.27524e-30 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2551  LysM domain-containing protein  28.53 
 
 		 335 aa  86.7  6e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.551976  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0889  peptidoglycan-binding LysM  25.43 
 
 		 333 aa  82  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000030411  hitchhiker  0.00000000000323717 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2713  Peptidoglycan-binding LysM  25.85 
 
 		 335 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.292431  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0537  peptidoglycan-binding LysM  26.35 
 
 		 394 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201658  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2489  peptidoglycan-binding LysM  46 
 
 		 219 aa  55.5  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3954  hypothetical protein  45.65 
 
 		 405 aa  53.5  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.10149  normal  0.332371 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0553  peptidoglycan-binding LysM  40 
 
 		 428 aa  53.1  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1636  Peptidoglycan-binding LysM  45.65 
 
 		 451 aa  49.3  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0326  LysM domain protein  39.58 
 
 		 377 aa  48.5  0.0001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0219877  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2004  LysM domain/BON superfamily protein  41.18 
 
 		 161 aa  48.1  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0461  peptidoglycan-binding LysM  45.65 
 
 		 439 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.520913  normal  0.0203741 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5209  Peptidoglycan-binding LysM  33.9 
 
 		 511 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.263437 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4742  peptidoglycan-binding LysM  33.9 
 
 		 511 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1910  peptidoglycan-binding LysM  42 
 
 		 382 aa  47.4  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02210  hypothetical protein  30.67 
 
 		 166 aa  47.8  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0721  peptidoglycan-binding LysM  44.44 
 
 		 572 aa  47  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.467953 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1297  transport-associated protein  34.29 
 
 		 156 aa  47  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.451371  normal  0.073309 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5282  Peptidoglycan-binding LysM  33.96 
 
 		 552 aa  46.6  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.772795 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0662  putative cell wall turnover protein  41.67 
 
 		 185 aa  46.6  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0441  LysM domain-containing protein  37.93 
 
 		 404 aa  45.8  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.21565  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>