28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0015 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_0015  hypothetical protein  100 
 
 
156 aa  322  2e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.153918 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0136  hypothetical protein  55.77 
 
 
155 aa  179  1e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.596605  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1402  hypothetical protein  53.95 
 
 
160 aa  166  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0526966  normal  0.116866 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3146  hypothetical protein  55.1 
 
 
160 aa  161  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.183641 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1951  hypothetical protein  51.59 
 
 
163 aa  157  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.308356  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1510  hypothetical protein  53.59 
 
 
161 aa  152  1e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.177108  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1073  hypothetical protein  53.59 
 
 
160 aa  152  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.380832  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0779  hypothetical protein  53.59 
 
 
161 aa  152  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0515  hypothetical protein  53.59 
 
 
161 aa  152  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2095  hypothetical protein  53.59 
 
 
161 aa  152  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0613  hypothetical protein  53.59 
 
 
161 aa  152  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1927  hypothetical protein  52.94 
 
 
181 aa  150  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2203  hypothetical protein  54.9 
 
 
160 aa  150  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.868335  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5874  hypothetical protein  54.9 
 
 
160 aa  150  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2228  hypothetical protein  54.9 
 
 
160 aa  150  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.527999  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2242  hypothetical protein  54.55 
 
 
161 aa  149  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2121  hypothetical protein  53.59 
 
 
160 aa  149  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.77747  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5532  hypothetical protein  53.59 
 
 
160 aa  147  5e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2029  hypothetical protein  50.98 
 
 
181 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.258509  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1392  hypothetical protein  49.01 
 
 
192 aa  144  4.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.360993  normal  0.536019 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1303  hypothetical protein  46.36 
 
 
156 aa  141  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.629035  normal  0.112284 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1237  hypothetical protein  46.36 
 
 
156 aa  141  3e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.202411  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1364  hypothetical protein  46.36 
 
 
156 aa  139  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1942  hypothetical protein  46.36 
 
 
156 aa  138  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48710  hypothetical protein  41.5 
 
 
157 aa  99  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000390277 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4172  hypothetical protein  40.14 
 
 
157 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0452  hypothetical protein  39.07 
 
 
155 aa  95.1  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.756521 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2206  hypothetical protein  38.3 
 
 
148 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>