177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_6045 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_6045  hypothetical protein  100 
 
 		 204 aa  402  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.696957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4779  hypothetical protein  80.21 
 
 		 192 aa  313  9.999999999999999e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3484  protein of unknown function UPF0016  81.52 
 
 		 192 aa  306  2.0000000000000002e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4126  hypothetical protein  80.98 
 
 		 192 aa  304  5.0000000000000004e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0148  hypothetical protein  72.58 
 
 		 188 aa  280  1e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4103  hypothetical protein  71.12 
 
 		 188 aa  279  2e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.217068 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5289  protein of unknown function UPF0016  79.12 
 
 		 187 aa  273  2.0000000000000002e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0520  hypothetical protein  73.14 
 
 		 187 aa  271  4.0000000000000004e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4890  hypothetical protein  69.59 
 
 		 196 aa  262  2e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.716617  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2100  hypothetical protein  68.45 
 
 		 204 aa  254  7e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.636196 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3536  protein of unknown function UPF0016  66.32 
 
 		 191 aa  253  1.0000000000000001e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.57198  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2251  protein of unknown function UPF0016  68.93 
 
 		 190 aa  249  2e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.305842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0880  hypothetical protein  64.1 
 
 		 218 aa  248  3e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4128  hypothetical protein  62.87 
 
 		 218 aa  248  4e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.37766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1017  hypothetical protein  62.87 
 
 		 218 aa  248  4e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0094  hypothetical protein  65.76 
 
 		 190 aa  248  4e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00169792 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0892  hypothetical protein  63.59 
 
 		 218 aa  246  1e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209746  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1927  protein of unknown function UPF0016  68.36 
 
 		 190 aa  246  1e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.14267  normal  0.0417322 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0464  hypothetical protein  66.31 
 
 		 190 aa  245  4e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00884521  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3026  hypothetical protein  66.31 
 
 		 190 aa  245  4e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.754775  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2611  hypothetical protein  66.31 
 
 		 190 aa  245  4e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0983  hypothetical protein  66.31 
 
 		 190 aa  245  4e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.674293  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2920  hypothetical protein  66.31 
 
 		 190 aa  245  4e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.465994  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2980  hypothetical protein  66.31 
 
 		 190 aa  245  4e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0164  hypothetical protein  66.31 
 
 		 190 aa  245  4e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.549532  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2431  transmembrane protein  67.55 
 
 		 206 aa  244  6e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447861  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2248  hypothetical protein  63.3 
 
 		 203 aa  244  9e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.35774  normal  0.686727 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0976  hypothetical protein  65.26 
 
 		 190 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0349597 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0538  hypothetical protein  65.26 
 
 		 190 aa  242  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2378  hypothetical protein  62.3 
 
 		 234 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.674197 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1609  hypothetical protein  64.17 
 
 		 190 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0925  hypothetical protein  63.59 
 
 		 190 aa  234  5.0000000000000005e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.21119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0366  putative transmembrane protein  67.03 
 
 		 191 aa  230  1e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0688  hypothetical protein  61.58 
 
 		 190 aa  229  1e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.155693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2039  protein of unknown function UPF0016  61.96 
 
 		 196 aa  228  4e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.589069  hitchhiker  0.00000000898807 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0887  hypothetical protein  65.61 
 
 		 241 aa  226  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.159087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0577  hypothetical protein  60.33 
 
 		 193 aa  225  4e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.188553  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1610  hypothetical protein  53.01 
 
 		 185 aa  216  2e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1386  hypothetical protein  53.01 
 
 		 185 aa  215  4e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0985  hypothetical protein  60 
 
 		 194 aa  210  1e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.172763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0447  hypothetical protein  57.61 
 
 		 191 aa  206  2e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.243135  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1145  hypothetical protein  58.38 
 
 		 194 aa  205  4e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0802  hypothetical protein  57.07 
 
 		 194 aa  201  8e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.901329 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4713  hypothetical protein  55.98 
 
 		 194 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.133421  normal  0.150702 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3666  hypothetical protein  61.31 
 
 		 194 aa  198  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2778  hypothetical protein  55.98 
 
 		 188 aa  198  5e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.130489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0667  hypothetical protein  54.59 
 
 		 191 aa  196  2.0000000000000003e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1438  protein of unknown function UPF0016  55.14 
 
 		 195 aa  192  2e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4428  hypothetical protein  56.52 
 
 		 194 aa  192  4e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0241  hypothetical protein  56.67 
 
 		 191 aa  191  8e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001996  hypothetical protein  52.43 
 
 		 184 aa  189  2e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0788  hypothetical protein  57.07 
 
 		 194 aa  187  9e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.632611 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0760  hypothetical protein  57.07 
 
 		 194 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00451  hypothetical protein  52.49 
 
 		 184 aa  186  1e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2497  hypothetical protein  51.28 
 
 		 200 aa  187  1e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1080  membrane protein  54.44 
 
 		 189 aa  186  2e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2409  hypothetical protein  51.09 
 
 		 183 aa  186  3e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.936736  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0115  hypothetical protein  50.54 
 
 		 189 aa  183  1.0000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.454945  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4337  hypothetical protein  50.54 
 
 		 188 aa  182  4.0000000000000006e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0533  hypothetical protein  51.37 
 
 		 187 aa  179  2e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.559116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61260  hypothetical protein  61.9 
 
 		 192 aa  180  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5275  hypothetical protein  63.8 
 
 		 192 aa  178  5.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.932867  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41260  hypothetical protein  48.07 
 
 		 194 aa  177  8e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140731  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3467  hypothetical protein  51.91 
 
 		 184 aa  177  8e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0950509  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0895  hypothetical protein  51.91 
 
 		 184 aa  177  8e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.363973  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3391  protein of unknown function UPF0016  51.91 
 
 		 184 aa  176  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3626  hypothetical protein  55.68 
 
 		 185 aa  176  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3590  hypothetical protein  51.91 
 
 		 184 aa  176  2e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.976053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0575  hypothetical protein  50.27 
 
 		 184 aa  176  3e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3880  hypothetical protein  51.34 
 
 		 188 aa  175  3e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000226161  hitchhiker  0.000000250469 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0488  hypothetical protein  50.52 
 
 		 205 aa  175  5e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41250  hypothetical protein  61.31 
 
 		 193 aa  175  5e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.396742  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0682  hypothetical protein  51.37 
 
 		 184 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.634771  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3939  hypothetical protein  49.74 
 
 		 204 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.143914  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0640  hypothetical protein  51.37 
 
 		 184 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3189  hypothetical protein  50.82 
 
 		 184 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.372005  normal  0.740442 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0516  protein of unknown function UPF0016  50 
 
 		 187 aa  169  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.113311  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2072  hypothetical protein  44.62 
 
 		 201 aa  167  1e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0921348  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1560  membrane protein-like protein  56.67 
 
 		 190 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00722707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0946  hypothetical protein  51.37 
 
 		 198 aa  164  8e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.452942  normal  0.0960568 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1071  hypothetical protein  50.27 
 
 		 197 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0909  hypothetical protein  51.35 
 
 		 197 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0121906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3028  hypothetical protein  50.82 
 
 		 198 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.521433 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0914  hypothetical protein  51.37 
 
 		 184 aa  161  6e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2940  hypothetical protein  48.63 
 
 		 186 aa  160  1e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.835594  normal  0.0290979 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0521  protein of unknown function UPF0016  49.45 
 
 		 187 aa  154  6e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0395  hypothetical protein  38.83 
 
 		 216 aa  127  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000330292  normal  0.0708612 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1390  protein of unknown function UPF0016  36.51 
 
 		 216 aa  119  3e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.023314  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1237  protein of unknown function UPF0016  37.7 
 
 		 218 aa  117  9.999999999999999e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1084  protein of unknown function UPF0016  38.86 
 
 		 215 aa  116  1.9999999999999998e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.517367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1312  hypothetical protein  37.31 
 
 		 216 aa  115  6e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0745  hypothetical protein  38.42 
 
 		 189 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0996219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1056  hypothetical protein  38.86 
 
 		 231 aa  112  5e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.474109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1430  hypothetical protein  33.7 
 
 		 186 aa  111  6e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000236998  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3202  hypothetical protein  57.43 
 
 		 102 aa  111  6e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1345  protein of unknown function UPF0016  38.74 
 
 		 212 aa  111  9e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10240  predicted membrane protein  36.41 
 
 		 192 aa  108  8.000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0794  hypothetical protein  35.83 
 
 		 213 aa  107  9.000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.552893  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2260  hypothetical protein  39.57 
 
 		 195 aa  106  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0155  protein of unknown function UPF0016  38.2 
 
 		 238 aa  106  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.915442  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>