More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_6040 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_6040  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 128 aa  248  2e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3871  MerR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 117 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1808  transcriptional regulator, MerR family  40.16 
 
 		 131 aa  76.6  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.306071  normal  0.126025 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2526  MerR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 115 aa  72.4  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.120952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0713  MerR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 125 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.979534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9141  putative transcriptional regulator, MerR family  40.74 
 
 		 124 aa  66.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1798  regulatory protein, MerR  34.55 
 
 		 118 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0455207  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2788  MerR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 127 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.291885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2967  MerR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 127 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0117  transcriptional regulator, MerR family  40.37 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.809023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2733  MerR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 135 aa  62.4  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4226  MerR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.795335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2538  transcriptional regulator, MerR family  33.59 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.329159  normal  0.129188 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0085  MerR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 117 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0082  MerR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 117 aa  61.2  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0086  MerR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 117 aa  61.2  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0905  MerR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 117 aa  60.5  0.000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.131454  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2399  transcriptional regulator, MerR family  53.97 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000424023  normal  0.796089 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0162  MerR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 119 aa  59.7  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2262  MerR family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.142473  normal  0.0766241 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4286  transcriptional regulator, MerR family  36.97 
 
 		 133 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4396  transcriptional regulator, MerR family  36.97 
 
 		 133 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.742321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4304  MerR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 164 aa  58.9  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.614703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1697  MerR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.115653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2509  MerR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 151 aa  58.5  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.591979 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0226  MerR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 154 aa  57.4  0.00000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0442  transcriptional regulator, MerR family  34.38 
 
 		 132 aa  57  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.856657  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0094  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  35.51 
 
 		 136 aa  57  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3477  MerR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 120 aa  57  0.00000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.137212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0947  transcriptional regulator, MerR family  41.51 
 
 		 137 aa  57  0.00000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3608  zinc-responsive transcriptional regulator  34.33 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.260442 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0660  MerR family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0129  MerR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 127 aa  56.6  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.684226 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3778  zinc-responsive transcriptional regulator  34.33 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.508161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2572  MerR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.957862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2129  putative transcriptional regulator MerR  33.96 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2024  MerR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2588  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0158199 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3715  zinc-responsive transcriptional regulator  34.33 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.325937 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1785  MerR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.370686  normal  0.0498641 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63170  putative transcriptional regulator  47.62 
 
 		 132 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2149  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 132 aa  56.2  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.705718  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0325  MerR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.634832 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2104  transcriptional regulator, MerR family  34.85 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3209  MerR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3563  transcriptional regulator, MerR family  34.68 
 
 		 157 aa  55.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0749  transcriptional regulator, heavy metal-dependent  43.53 
 
 		 133 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0831  MerR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2256  MerR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2633  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  38.89 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.673518 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1913  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  31.25 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0400556  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3444  transcriptional regulator, MerR family  38.1 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0545873  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0083  putative transcriptional regulator MerR  33.96 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.68539 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3389  MerR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.462896  normal  0.11439 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1407  MerR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1217  putative transcriptional regulator MerR  31.82 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0596  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  31.25 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5193  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2302  MerR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000169784  hitchhiker  0.000117286 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2391  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  34.85 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0284263  normal  0.3053 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0122  MerR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2655  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 129 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5500  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  46.03 
 
 		 132 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0208  MerR family regulatory protein  37.04 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.7803  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2331  MerR family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3237  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3563  transcriptional regulator, MerR family  36.19 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001159  transcriptional regulator  29.84 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5140  MerR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0137  MerR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2041  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  44.44 
 
 		 134 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00900822  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0034  MerR family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4873  MerR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 141 aa  54.7  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3161  MerR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.309754 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6344  Hg(II) resistance regulatory protein MerR  33.96 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000851109  unclonable  0.0000000537327 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3523  MerR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5013  MerR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4341  putative transcriptional regulator MerR  33.96 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1387  transcriptional regulator, MerR family  46.03 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.124433  hitchhiker  0.00107932 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0548  DNA-binding transcriptional regulator CueR  33.03 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3373  MerR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 136 aa  54.3  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0297855  normal  0.469131 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6498  putative transcriptional regulator MerR  33.96 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0239269  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3299  MerR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3303  MerR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1407  MerR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1402  MerR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 133 aa  54.3  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87391  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6171  putative transcriptional regulator MerR  33.96 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000597544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2341  putative transcriptional regulator MerR  33.96 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5683  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0101  putative transcriptional regulator MerR  33.96 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.656805  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3461  transcriptional regulator, MerR family protein  31.09 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4536  transcriptional regulator, MerR family  32.28 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.228678  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15480  putative transcriptional regulator MerR  33.96 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000744936  unclonable  4.377399999999999e-22 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0963  DNA-binding transcriptional regulator CueR  34.86 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.55262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6047  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.790418 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4323  MerR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3828  MerR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 122 aa  54.3  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3607  zinc-responsive transcriptional regulator  33.58 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0303153  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0608  zinc-responsive transcriptional regulator  31.58 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000357731  normal  0.723537 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4091  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.903901  normal  0.433272 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>