106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5885 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_5885  hypothetical protein  100 
 
 
250 aa  506  9.999999999999999e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.192815  normal  0.239276 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0235  hypothetical protein  62.88 
 
 
272 aa  327  8e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.964457 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0463  hypothetical protein  65.23 
 
 
276 aa  310  1e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1450  hypothetical protein  61.87 
 
 
261 aa  298  6e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2970  hypothetical protein  59.92 
 
 
272 aa  293  1e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.307445  normal  0.71112 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2397  protein of unknown function DUF1365  59.53 
 
 
272 aa  291  9e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1972  hypothetical protein  49.81 
 
 
261 aa  259  3e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0491  hypothetical protein  49.8 
 
 
254 aa  217  1e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.853849 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3432  hypothetical protein  46.06 
 
 
292 aa  203  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1046  protein of unknown function DUF1365  45.64 
 
 
283 aa  198  7e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.616737 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1054  protein of unknown function DUF1365  47.97 
 
 
256 aa  191  1e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6582  hypothetical protein  44.58 
 
 
284 aa  180  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5829  hypothetical protein  45.11 
 
 
284 aa  180  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1870  hypothetical protein  42 
 
 
268 aa  168  6e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.651772 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6097  hypothetical protein  40.73 
 
 
253 aa  159  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0297528  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1556  hypothetical protein  42.5 
 
 
267 aa  159  3e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2905  hypothetical protein  39.58 
 
 
283 aa  158  9e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.794826  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0326  hypothetical protein  40.16 
 
 
250 aa  155  6e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000101488  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3572  hypothetical protein  40.62 
 
 
271 aa  154  1e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.884877 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2566  hypothetical protein  40.34 
 
 
283 aa  152  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.372719 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1442  protein of unknown function DUF1365  36.25 
 
 
283 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.328576 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1389  hypothetical protein  37.25 
 
 
257 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2938  hypothetical protein  38.21 
 
 
249 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.064452  normal  0.193672 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2839  protein of unknown function DUF1365  40.09 
 
 
281 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.172989  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0368  protein of unknown function DUF1365  37.4 
 
 
252 aa  145  7.0000000000000006e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2753  hypothetical protein  38.21 
 
 
249 aa  142  6e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.948566  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0087  hypothetical protein  37.97 
 
 
267 aa  142  6e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2555  hypothetical protein  37.34 
 
 
276 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.08299  normal  0.799621 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4019  hypothetical protein  39.11 
 
 
254 aa  139  6e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1090  putative cyclopropane/cyclopropene fatty acid synthesis protein  37.8 
 
 
249 aa  138  7e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.437868  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1621  protein of unknown function DUF1365  34.41 
 
 
283 aa  138  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.591414 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3929  hypothetical protein  39.74 
 
 
280 aa  138  8.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.368469 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4843  hypothetical protein  38.36 
 
 
258 aa  138  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.49195  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0912  hypothetical protein  36.61 
 
 
254 aa  135  8e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.4727  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0349  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  35.66 
 
 
656 aa  133  3e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0724  hypothetical protein  37.18 
 
 
273 aa  129  3e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00450807  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2024  protein of unknown function DUF1365  36.87 
 
 
265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1803  protein of unknown function DUF1365  35.48 
 
 
256 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.16421  hitchhiker  0.000000430371 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0413  hypothetical protein  35.06 
 
 
259 aa  125  5e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00475452  normal  0.256697 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1891  protein of unknown function DUF1365  33.2 
 
 
264 aa  122  5e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1176  protein of unknown function DUF1365  35.42 
 
 
247 aa  121  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1617  hypothetical protein  35.2 
 
 
254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1488  hypothetical protein  36.05 
 
 
240 aa  114  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2361  hypothetical protein  31.36 
 
 
242 aa  112  5e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.292308  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2121  protein of unknown function DUF1365  31.82 
 
 
260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000114198 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2436  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  35.08 
 
 
658 aa  105  5e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3369  hypothetical protein  28.63 
 
 
274 aa  105  7e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003862  hypothetical protein  29.41 
 
 
272 aa  105  8e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.59899  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0297  protein of unknown function DUF1365  36.22 
 
 
263 aa  104  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1955  protein of unknown function DUF1365  40.36 
 
 
255 aa  103  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.116158 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1002  hypothetical protein  28.87 
 
 
249 aa  101  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.160897  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10454  hypothetical protein  33.2 
 
 
243 aa  101  1e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3584  protein of unknown function DUF1365  33.04 
 
 
254 aa  101  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.33232  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0272  hypothetical protein  32.1 
 
 
258 aa  100  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.944039  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2099  hypothetical protein  32.77 
 
 
241 aa  100  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.658996  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0101  protein of unknown function DUF1365  35.86 
 
 
265 aa  100  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00443517  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2735  hypothetical protein  34.44 
 
 
269 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.103828  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3018  hypothetical protein  34.02 
 
 
269 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4370  hypothetical protein  32.89 
 
 
259 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.686626  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4457  hypothetical protein  32.89 
 
 
259 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.163875  normal  0.0342696 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4751  hypothetical protein  32.89 
 
 
259 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.307651  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01817  hypothetical protein  33 
 
 
242 aa  96.7  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1486  hypothetical protein  31.76 
 
 
300 aa  95.5  6e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.735841  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0957  hypothetical protein  35.42 
 
 
266 aa  95.5  7e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3174  hypothetical protein  35.42 
 
 
270 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.186988  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0639  hypothetical protein  28.29 
 
 
269 aa  93.2  4e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000143987  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01778  hypothetical protein  30 
 
 
270 aa  93.2  4e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.145223  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1384  hypothetical protein  29.85 
 
 
272 aa  92  7e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01432  hypothetical protein  27.57 
 
 
247 aa  92  7e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1169  hypothetical protein  30.04 
 
 
263 aa  92  8e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1170  hypothetical protein  30.04 
 
 
264 aa  91.7  9e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1240  hypothetical protein  29.66 
 
 
263 aa  91.3  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1681  protein of unknown function DUF1365  52.17 
 
 
105 aa  91.3  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1117  hypothetical protein  39.1 
 
 
227 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4740  hypothetical protein  32.16 
 
 
271 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.861039  normal  0.274237 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0128  hypothetical protein  31.82 
 
 
259 aa  90.9  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4926  hypothetical protein  31.65 
 
 
269 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.184286 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1067  hypothetical protein  35.25 
 
 
266 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2773  hypothetical protein  28.22 
 
 
239 aa  90.5  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.725138  normal  0.544458 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1327  hypothetical protein  27.49 
 
 
242 aa  90.1  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1251  protein of unknown function DUF1365  34.5 
 
 
291 aa  90.1  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00207378  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2097  hypothetical protein  33.06 
 
 
270 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1819  hypothetical protein  31.49 
 
 
291 aa  89.4  6e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3064  hypothetical protein  28.52 
 
 
274 aa  89  7e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3380  hypothetical protein  29.01 
 
 
263 aa  88.2  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4071  hypothetical protein  26.94 
 
 
261 aa  87.8  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2920  hypothetical protein  34.38 
 
 
228 aa  86.7  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2710  hypothetical protein  27.27 
 
 
269 aa  86.7  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.784131  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3050  hypothetical protein  28.9 
 
 
274 aa  86.3  4e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1313  protein of unknown function DUF1365  28.52 
 
 
274 aa  85.5  7e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.91577 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1483  hypothetical protein  27.92 
 
 
267 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0873  hypothetical protein  27.92 
 
 
243 aa  84.7  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.41074  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4268  protein of unknown function DUF1365  33.33 
 
 
257 aa  85.1  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.509599  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3207  hypothetical protein  28.14 
 
 
274 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0461  hypothetical protein  29.29 
 
 
261 aa  81.6  0.000000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3032  hypothetical protein  26.54 
 
 
273 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0801667  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0815  hypothetical protein  29.73 
 
 
264 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2467  hypothetical protein  27.34 
 
 
276 aa  73.9  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48601  predicted protein  25.34 
 
 
360 aa  73.6  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4723  protein of unknown function DUF1365  31.12 
 
 
269 aa  72.8  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.48115  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>