64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5879 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5879  hypothetical protein  100 
 
 		 134 aa  273  4e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.701907  normal  0.17996 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2390  hypothetical protein  50.74 
 
 		 162 aa  124  5e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2963  hypothetical protein  49.26 
 
 		 162 aa  121  3e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.427148 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0229  hypothetical protein  48.03 
 
 		 146 aa  120  4e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.532688 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1060  protein of unknown function DUF1486  45.45 
 
 		 159 aa  119  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.148569  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1456  hypothetical protein  44.53 
 
 		 150 aa  112  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0469  hypothetical protein  42.75 
 
 		 149 aa  110  9e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0497  hypothetical protein  44.27 
 
 		 140 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.445375 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1888  hypothetical protein  37.69 
 
 		 144 aa  95.5  2e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1399  hypothetical protein  37.59 
 
 		 148 aa  91.3  4e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6103  hypothetical protein  38.28 
 
 		 152 aa  82  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0493798  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0636  putative transcriptional regulator  28.57 
 
 		 142 aa  72  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000220026  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003865  putative transcriptional regulator  27.07 
 
 		 139 aa  70.9  0.000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00111474  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01814  hypothetical protein  27.82 
 
 		 139 aa  70.1  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1120  hypothetical protein  29.32 
 
 		 140 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1070  hypothetical protein  31.58 
 
 		 140 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0464  hypothetical protein  28.79 
 
 		 148 aa  66.6  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0728  hypothetical protein  31.09 
 
 		 153 aa  65.9  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0960  hypothetical protein  27.07 
 
 		 140 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2713  transcriptional regulator-related protein  24.62 
 
 		 145 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1179  hypothetical protein  31.85 
 
 		 144 aa  64.7  0.0000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.139901  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3053  transcriptional regulator-related protein  23.85 
 
 		 148 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1310  transcriptional regulator-related protein  23.85 
 
 		 148 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4737  hypothetical protein  32.84 
 
 		 140 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.870255  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3035  hypothetical protein  26.72 
 
 		 167 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.21304  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1166  transcriptional regulator-related protein  27.91 
 
 		 148 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3210  transcriptional regulator-related protein  24.62 
 
 		 148 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.821326 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3067  transcriptional regulator-related protein  24.62 
 
 		 148 aa  62.8  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1381  hypothetical protein  24.03 
 
 		 153 aa  62  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.202098  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2096  hypothetical protein  29.01 
 
 		 159 aa  62.4  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.364867  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1330  hypothetical protein  26.36 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.522262  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3383  transcriptional regulator-related protein  25 
 
 		 148 aa  61.2  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18511  transcription regulator  29.46 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.630467  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1237  transcriptional regulator-related protein  27.13 
 
 		 148 aa  60.8  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1167  transcriptional regulator-related protein  27.13 
 
 		 148 aa  60.8  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0812  transcriptional regulator-related protein  25.78 
 
 		 167 aa  61.2  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3372  hypothetical protein  25.58 
 
 		 143 aa  60.5  0.000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0999  transcriptional regulator  21.97 
 
 		 141 aa  60.5  0.000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.859219  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2738  hypothetical protein  28.57 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.264165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4074  hypothetical protein  25.78 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.29566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3015  hypothetical protein  28.57 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1734  transcription regulator-like  29.46 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.24686  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1480  hypothetical protein  27.91 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1491  hypothetical protein  28.1 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1483  hypothetical protein  31.25 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3171  hypothetical protein  27.61 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0218513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0784  transcription regulator  31.86 
 
 		 141 aa  57.4  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0106274  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18321  transcription regulator  27.68 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16341  hypothetical protein  30.97 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.832148  normal  0.369821 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2100  hypothetical protein  26.12 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1046  transcriptional regulator  28.7 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18301  transcription regulator  28.57 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2776  hypothetical protein  23.08 
 
 		 143 aa  53.5  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.857433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0014  hypothetical protein  30.43 
 
 		 130 aa  51.6  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.51836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0546  hypothetical protein  21.74 
 
 		 156 aa  50.1  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000563714  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2470  ketosteroid isomerase-related protein, cystatin fold  23.36 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.4042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0949  transcriptional regulator  26.09 
 
 		 147 aa  45.1  0.0003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4985  steroid delta-5-3-ketosteroid isomerase  20.39 
 
 		 127 aa  45.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3601  hypothetical protein  28.32 
 
 		 132 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2513  hypothetical protein  29.2 
 
 		 132 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.170806  normal  0.406315 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3730  hypothetical protein  27.93 
 
 		 171 aa  43.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0347674 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01435  hypothetical protein  22.58 
 
 		 146 aa  42  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4660  hypothetical protein  41.67 
 
 		 110 aa  40.8  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3596  nuclear transport factor 2  25 
 
 		 128 aa  40.4  0.008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.442215  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>