128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5847 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_5847  precorrin-6x reductase  100 
 
 
249 aa  487  1e-137  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.760322  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2825  cobalt-precorrin-6x reductase  65.94 
 
 
247 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1472  cobalt-precorrin-6x reductase  65.94 
 
 
247 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.212621  normal  0.776259 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1522  cobalt-precorrin-6x reductase  65.94 
 
 
247 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.642834  normal  0.196786 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2215  precorrin-6A reductase  60.09 
 
 
253 aa  261  1e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2926  precorrin-6A reductase  56.77 
 
 
251 aa  257  1e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.422905  hitchhiker  0.00352486 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2377  cobalt-precorrin-6x reductase  57.59 
 
 
249 aa  251  7e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2317  cobalt-precorrin-6x reductase  55.8 
 
 
249 aa  240  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.398392  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3181  cobalt-precorrin-6x reductase  58.18 
 
 
259 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.264616  normal  0.537996 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2537  precorrin-6A reductase  55.22 
 
 
230 aa  234  1.0000000000000001e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.571905  normal  0.796536 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1885  cobalt-precorrin-6x reductase  55.32 
 
 
259 aa  232  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0337  cobalt-precorrin-6x reductase  52.32 
 
 
253 aa  230  2e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3120  precorrin-6A reductase  54.3 
 
 
265 aa  225  6e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5189  precorrin-6x reductase  48.17 
 
 
273 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2154  precorrin-6x reductase  51.87 
 
 
253 aa  198  7e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0179311  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3281  precorrin-6x reductase  56.1 
 
 
287 aa  195  6e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.954465 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4722  precorrin-6x reductase  47.25 
 
 
273 aa  194  1e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.245541  normal  0.411006 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2443  precorrin-6x reductase  53.03 
 
 
253 aa  194  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00747936  normal  0.0784333 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0021  cobalt-precorrin-6x reductase  46.48 
 
 
246 aa  192  4e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.342454 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3512  precorrin-6x reductase  48.86 
 
 
255 aa  192  6e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.42135  normal  0.748332 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2814  cobalt-precorrin-6x reductase  51.27 
 
 
266 aa  189  4e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.659993 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3149  precorrin-6A reductase  48.05 
 
 
257 aa  186  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.724633  normal  0.712178 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5261  precorrin-6x reductase  48.86 
 
 
271 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.527912  normal  0.416364 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5688  precorrin-6x reductase  49.78 
 
 
250 aa  180  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0122424  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1548  precorrin-6x reductase  40.18 
 
 
249 aa  177  1e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2739  cobalt-precorrin-6x reductase  38.91 
 
 
252 aa  175  6e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0747566  normal  0.206921 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0805  precorrin-6x reductase  46.7 
 
 
266 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.955549  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7178  cobalt-precorrin-6x reductase  45.16 
 
 
256 aa  172  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.183428  normal  0.0616428 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2628  cobalt-precorrin-6x reductase  45.18 
 
 
229 aa  170  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.246451  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6989  precorrin-6x reductase  49.03 
 
 
250 aa  165  5e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.463236  normal  0.655339 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12106  cobalt-precorrin-6x reductase  46.7 
 
 
244 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.165074  normal  0.705272 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1690  precorrin-6A reductase  44.44 
 
 
248 aa  160  2e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0972101  normal  0.0269101 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0256  cobalt-precorrin-6x reductase  44.75 
 
 
245 aa  156  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000182781  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1927  precorrin-6x reductase  47.16 
 
 
253 aa  156  3e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.338007  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1886  cobalt-precorrin-6x reductase  41.35 
 
 
248 aa  156  3e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3263  precorrin-6x reductase  48.62 
 
 
253 aa  156  3e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.101094 
 
 
-
 
NC_004310  BR1299  cobalt-precorrin-6x reductase  40.99 
 
 
248 aa  155  4e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1263  cobalt-precorrin-6x reductase  40.99 
 
 
248 aa  155  4e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6023  cobalt-precorrin-6x reductase  43.89 
 
 
256 aa  155  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00000257009  normal  0.17843 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2478  precorrin-6x reductase  44.14 
 
 
244 aa  155  7e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0390699  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2180  precorrin-6x reductase  45.79 
 
 
248 aa  154  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0136003  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1522  cobalt-precorrin-6x reductase  48.84 
 
 
268 aa  151  1e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0287326  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2522  cobalt-precorrin-6x reductase  43.42 
 
 
242 aa  146  3e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.14189 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4710  cobalt-precorrin-6x reductase  40.78 
 
 
239 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.54445 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1197  cobalt-precorrin-6x reductase  43.26 
 
 
243 aa  142  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.305612  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2485  cobalt-precorrin-6x reductase  42.54 
 
 
242 aa  142  4e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1677  cobalt-precorrin-6x reductase  43.26 
 
 
243 aa  142  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0206927  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2530  cobalt-precorrin-6x reductase  42.54 
 
 
242 aa  142  4e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.639819  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4880  precorrin-6x reductase, putative  38.14 
 
 
246 aa  142  6e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2988  precorrin-6A reductase  46.6 
 
 
251 aa  141  8e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.432734  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0601  cobalt-precorrin-6x reductase  40.49 
 
 
242 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.156008  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0566  precorrin-6x reductase  47.42 
 
 
253 aa  141  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.853215  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5596  Precorrin-6A reductase  49.13 
 
 
250 aa  137  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0340084  normal  0.622554 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2500  precorrin-6x reductase  44.3 
 
 
244 aa  137  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.21321 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4420  cobalt-precorrin-6x reductase  38.68 
 
 
246 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0536098 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1780  precorrin-6x reductase  43.06 
 
 
241 aa  136  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.171878  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17710  precorrin-6A reductase  42.92 
 
 
250 aa  135  8e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.262033  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26460  cobalt-precorrin-6x reductase  38.77 
 
 
242 aa  133  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00807093  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2245  cobalt-precorrin-6x reductase  37.89 
 
 
242 aa  133  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.99555  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1158  cobalt-precorrin-6x reductase  44.39 
 
 
244 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.358764  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2116  cobalt-precorrin-6x reductase  44.13 
 
 
244 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.253146  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1599  cobalt-precorrin-6x reductase  44.39 
 
 
244 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00760442  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0260  cobalt-precorrin-6x reductase  44.39 
 
 
244 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1971  cobalt-precorrin-6x reductase  44.13 
 
 
244 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0900  cobalt-precorrin-6x reductase  44.39 
 
 
244 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.12855  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4888  cobalt-precorrin-6x reductase  41.51 
 
 
239 aa  132  6e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.179164  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4622  cobalt-precorrin-6x reductase  41.09 
 
 
239 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44815  normal  0.12698 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5478  cobalt-precorrin-6x reductase  40.66 
 
 
269 aa  131  7.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.737923 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2395  cobalt-precorrin-6x reductase  44.39 
 
 
256 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1954  cobalt-precorrin-6x reductase  43.66 
 
 
244 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.216473  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1650  cobalt-precorrin-6x reductase  43.26 
 
 
243 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.459955 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4832  cobalt-precorrin-6x reductase  40 
 
 
239 aa  129  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0805988  normal  0.545776 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4569  cobalt-precorrin-6x reductase  38.28 
 
 
239 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3140  cobalt-precorrin-6x reductase  38.6 
 
 
245 aa  126  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.167362  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1248  cobalt-precorrin-6x reductase  39.23 
 
 
242 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0495203  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5366  cobalt-precorrin-6x reductase  38.97 
 
 
242 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.791925 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0310  precorrin-6A reductase  45.28 
 
 
248 aa  125  5e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0359  precorrin-6x reductase  40.1 
 
 
244 aa  120  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.218038 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3377  precorrin-6A reductase  36.07 
 
 
262 aa  116  3.9999999999999997e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.223591 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1565  cobalt-precorrin-6x reductase  43.2 
 
 
243 aa  112  5e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108176  normal  0.15041 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4828  cobalt-precorrin-6x reductase  43.66 
 
 
243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0932291 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2881  precorrin-6A reductase  42.49 
 
 
243 aa  110  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1577  cobalt-precorrin-6x reductase  44.39 
 
 
246 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0167988  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1595  cobalt-precorrin-6x reductase  42.2 
 
 
246 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.635785  normal  0.303988 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0176  precorrin-6x reductase  44.33 
 
 
248 aa  100  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1614  precorrin-6x reductase  39.39 
 
 
239 aa  100  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0378  precorrin-6x reductase  38.58 
 
 
245 aa  92.8  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.656441  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1552  precorrin-6x reductase  29.35 
 
 
259 aa  81.6  0.000000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0296992  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0937  precorrin-6x reductase  33.16 
 
 
255 aa  80.9  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1276  precorrin-6x reductase  31.36 
 
 
407 aa  77  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00118855  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0618  bifunctional: precorrin-3 methyltransferase/precorrin-6X reductase oxidoreductase protein  36.32 
 
 
519 aa  77  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.157389  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2614  precorrin-6x reductase  27.6 
 
 
258 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0936  precorrin-6x reductase  25.33 
 
 
261 aa  74.7  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0236244 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0316  precorrin-6x reductase  28.65 
 
 
249 aa  73.2  0.000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1379  precorrin-6x reductase  28.82 
 
 
655 aa  71.2  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2708  precorrin-6x reductase  30.89 
 
 
253 aa  69.7  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.154197  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1670  precorrin-6X reductase  33.85 
 
 
264 aa  65.9  0.0000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1297  precorrin-6x reductase  29.38 
 
 
256 aa  65.9  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00514043 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5134  cobalt-precorrin-6x reductase  30.09 
 
 
254 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0705  precorrin-6x reductase  19.19 
 
 
246 aa  63.9  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>