76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5807 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5807  hypothetical protein  100 
 
 		 271 aa  525  1e-148  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.330732 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2071  hypothetical protein  82.71 
 
 		 267 aa  412  1e-114  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.151381  normal  0.644656 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1067  hypothetical protein  79.32 
 
 		 267 aa  404  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4687  protein of unknown function DUF990  84.21 
 
 		 267 aa  376  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1830  hypothetical protein  35.61 
 
 		 265 aa  184  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6486  protein of unknown function DUF990  38.93 
 
 		 265 aa  167  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117974  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0485  hypothetical protein  34.72 
 
 		 261 aa  162  6e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0184092  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0442  protein of unknown function DUF990  32.58 
 
 		 258 aa  160  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0572285 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3778  hypothetical protein  32.8 
 
 		 258 aa  153  2.9999999999999998e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000127963  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3152  protein of unknown function DUF990  36.92 
 
 		 267 aa  149  3e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.129071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2675  hypothetical protein  32.55 
 
 		 249 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.187559  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4780  protein of unknown function DUF990  33.82 
 
 		 278 aa  145  9e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.723474 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3437  hypothetical protein  37.55 
 
 		 262 aa  142  6e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.434658  normal  0.500437 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09760  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  35.43 
 
 		 261 aa  136  3.0000000000000003e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4152  hypothetical protein  34.32 
 
 		 269 aa  132  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4136  protein of unknown function DUF990  40.17 
 
 		 272 aa  129  3e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.41121  normal  0.683781 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1921  hypothetical protein  32.58 
 
 		 315 aa  128  9.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12830  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  36.96 
 
 		 266 aa  125  9e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.75127  normal  0.652933 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3918  protein of unknown function DUF990  31.85 
 
 		 281 aa  122  9e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.373392  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2386  protein of unknown function DUF990  33.87 
 
 		 288 aa  120  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0436  hypothetical protein  28.03 
 
 		 262 aa  119  7e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2492  protein of unknown function DUF990  34.21 
 
 		 267 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000365618  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0980  hypothetical protein  25.46 
 
 		 270 aa  105  8e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0524  hypothetical protein  30.3 
 
 		 267 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2520  protein of unknown function DUF990  24.44 
 
 		 279 aa  96.7  4e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0173  hypothetical protein  25.93 
 
 		 263 aa  94.7  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.109206  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0170  hypothetical protein  26.3 
 
 		 263 aa  90.9  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0538  protein of unknown function DUF990  30.4 
 
 		 265 aa  89  7e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0552  hypothetical protein  30.4 
 
 		 265 aa  89  7e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.268475 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0589  ABC transporter, permease protein, putative  24.81 
 
 		 261 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0590  putative ABC transporter, permease protein  24.81 
 
 		 261 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.70299  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0456  hypothetical protein  25.19 
 
 		 261 aa  87.8  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.274401  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1964  protein of unknown function DUF990  26.59 
 
 		 262 aa  86.7  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000269589  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0445  ABC transporter permease  24.81 
 
 		 261 aa  87  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0441  ABC transporter permease  24.81 
 
 		 261 aa  87  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0534  ABC transporter permease  24.81 
 
 		 261 aa  86.3  5e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.184437  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0517  putative ABC transporter, permease protein  24.81 
 
 		 261 aa  86.3  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000033063 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0502  ABC transporter permease  24.81 
 
 		 261 aa  86.3  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0661  hypothetical protein  25.81 
 
 		 261 aa  86.3  5e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.788347  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0539  putative ABC transporter, permease protein  24.06 
 
 		 261 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4787  putative ABC transporter, permease protein  24.06 
 
 		 261 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.14133  hitchhiker  0.000205366 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1285  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  26.34 
 
 		 263 aa  84  0.000000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0450  hypothetical protein  24.06 
 
 		 261 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0488  protein of unknown function DUF990  22.56 
 
 		 261 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1360  protein of unknown function DUF990  22.56 
 
 		 261 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3098  protein of unknown function DUF990  25 
 
 		 262 aa  66.6  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.817104  normal  0.988604 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2222  protein of unknown function DUF990  26.88 
 
 		 267 aa  65.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0803  hypothetical protein  29.46 
 
 		 260 aa  65.5  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.386631  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2521  protein of unknown function DUF990  24.9 
 
 		 267 aa  62  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.808685  normal  0.519052 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2348  protein of unknown function DUF990  22.88 
 
 		 270 aa  60.5  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.671406  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0545  protein of unknown function DUF990  28.12 
 
 		 265 aa  60.5  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.931228  normal  0.935473 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2321  protein of unknown function DUF990  24.07 
 
 		 262 aa  57.4  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1443  protein of unknown function DUF990  29.55 
 
 		 261 aa  56.6  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1498  hypothetical protein  23.66 
 
 		 260 aa  55.8  0.0000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0636384  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4243  protein of unknown function DUF990  25.09 
 
 		 260 aa  55.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000148209  hitchhiker  0.000000472555 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0658  protein of unknown function DUF990  26.02 
 
 		 261 aa  55.1  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000260667 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0058  protein of unknown function DUF990  24.35 
 
 		 262 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0285838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0060  protein of unknown function DUF990  24.35 
 
 		 262 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0859  hypothetical protein  27.62 
 
 		 260 aa  53.5  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.487071  normal  0.1891 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09031  membrane protein, multidrug efflux associated  23.9 
 
 		 262 aa  53.1  0.000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000238459 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0236  membrane protein, multidrug efflux associated  23.9 
 
 		 262 aa  53.1  0.000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0945293  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3864  hypothetical protein  22.94 
 
 		 260 aa  51.6  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1188  hypothetical protein  24.03 
 
 		 260 aa  50.8  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0429  protein of unknown function DUF990  24.63 
 
 		 262 aa  50.4  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0428  protein of unknown function DUF990  26.1 
 
 		 262 aa  50.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.502451  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2550  ABC-type uncharacterized transport system permease component-like  35 
 
 		 165 aa  49.7  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.256481  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0892  ABC transporter, permease protein  20.33 
 
 		 262 aa  49.3  0.00006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2209  membrane protein, multidrug efflux associated  29.05 
 
 		 262 aa  48.1  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2816  protein of unknown function DUF990  35.64 
 
 		 259 aa  47  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0376428 
 
 
-
 
NC_013516  Smon_1505  protein of unknown function DUF990  20 
 
 		 262 aa  45.8  0.0008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  hitchhiker  0.00000124255  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1946  hypothetical protein  24.32 
 
 		 260 aa  45.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0246863 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0400  hypothetical protein  24.72 
 
 		 262 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3771  protein of unknown function DUF990  22.41 
 
 		 260 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.616684 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3537  hypothetical protein  25.1 
 
 		 262 aa  43.9  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0865051  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2653  hypothetical protein  20 
 
 		 257 aa  43.1  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0886  hypothetical protein  27.43 
 
 		 259 aa  42.4  0.008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0866325  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>