More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5752 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5752  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 746 aa  1514    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0523831  hitchhiker  0.0000000000276247 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1321  TonB-dependent receptor  55.63 
 
 		 724 aa  766    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1266  TonB-dependent receptor  27.69 
 
 		 679 aa  234  6e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0152296  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1142  TonB-dependent receptor-related protein  30.17 
 
 		 650 aa  226  1e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.22175  normal  0.0805488 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1115  TonB-dependent receptor  33.94 
 
 		 649 aa  226  1e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.95294  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2744  TonB-dependent receptor  27.67 
 
 		 701 aa  218  2.9999999999999998e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1262  TonB-dependent receptor  29.49 
 
 		 651 aa  216  1.9999999999999998e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.612585  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1519  TonB-dependent receptor  32.39 
 
 		 657 aa  211  3e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.148558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1014  TonB-dependent receptor-related protein  27.35 
 
 		 647 aa  210  9e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1231  TonB-dependent receptor  29.13 
 
 		 678 aa  202  9.999999999999999e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1064  TonB-dependent receptor  31.26 
 
 		 661 aa  193  1e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00188221  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0028  TonB-dependent receptor  27.81 
 
 		 641 aa  178  3e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1274  TonB-dependent receptor plug  24.08 
 
 		 861 aa  129  1.0000000000000001e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1023  TonB-dependent receptor plug  23.7 
 
 		 769 aa  126  2e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.302797  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5364  TonB-dependent receptor plug  26.3 
 
 		 729 aa  124  5e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2751  TonB-dependent receptor plug  25.62 
 
 		 722 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.930878  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1518  TonB-dependent receptor plug  25.63 
 
 		 727 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  23.78 
 
 		 656 aa  114  6e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  23.95 
 
 		 659 aa  113  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0562  TonB-dependent receptor  24.22 
 
 		 634 aa  113  2.0000000000000002e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.222662 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0812  TonB-dependent receptor plug  26.51 
 
 		 659 aa  112  4.0000000000000004e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.183722  normal  0.24775 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1282  TonB-dependent receptor  25.04 
 
 		 698 aa  111  5e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1925  TonB-dependent receptor  25.04 
 
 		 642 aa  109  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.55144  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  24.03 
 
 		 663 aa  108  4e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  24.03 
 
 		 663 aa  108  4e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  24.03 
 
 		 663 aa  108  4e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  24.03 
 
 		 663 aa  108  4e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  24.03 
 
 		 663 aa  108  4e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  24.72 
 
 		 634 aa  108  5e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2845  putative TonB-dependent receptor  23.86 
 
 		 715 aa  107  6e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.328029 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  24.03 
 
 		 663 aa  107  6e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  24.03 
 
 		 641 aa  107  9e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1561  TonB-dependent receptor plug  24.92 
 
 		 681 aa  106  2e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000105774  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3845  TonB-dependent receptor, plug  25.19 
 
 		 628 aa  106  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.529618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1628  TonB-dependent receptor, plug  27.02 
 
 		 680 aa  104  7e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0448  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  33.05 
 
 		 271 aa  103  9e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0483  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  33.05 
 
 		 271 aa  103  9e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00522803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2621  TonB-dependent receptor, plug  24.45 
 
 		 695 aa  103  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  22.77 
 
 		 618 aa  102  3e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3738  TonB-dependent receptor  27.17 
 
 		 665 aa  100  7e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.430842  normal  0.0543439 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0460  TonB-dependent receptor  24.34 
 
 		 648 aa  100  9e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1552  TonB-dependent receptor HmuR  22.97 
 
 		 646 aa  100  1e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4029  TonB-dependent receptor  26.53 
 
 		 719 aa  99.4  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  25.14 
 
 		 650 aa  99.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47800  putative tonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 616 aa  99.4  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.173562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0558  TonB-dependent receptor  24.13 
 
 		 657 aa  98.2  5e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  24.67 
 
 		 650 aa  96.7  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3535  TonB-dependent receptor  26.92 
 
 		 681 aa  96.7  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0570  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system protein  24.64 
 
 		 675 aa  97.1  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.168599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1930  TonB-dependent receptor  24.57 
 
 		 702 aa  96.7  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1957  TonB-dependent receptor, putative  26.81 
 
 		 638 aa  96.3  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0488183  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0969  outer membrane receptor for transport of vitamin B  24.56 
 
 		 645 aa  96.3  2e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.01117 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1271  TonB-dependent receptor plug  24.41 
 
 		 634 aa  96.3  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.732381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  24.49 
 
 		 650 aa  95.1  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  24.49 
 
 		 650 aa  95.1  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4341  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  26.03 
 
 		 614 aa  95.1  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.139999  normal  0.582372 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  24.49 
 
 		 650 aa  94.7  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0934  putative outer membrane receptor  22.44 
 
 		 655 aa  94.7  5e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4459  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.83 
 
 		 614 aa  94.7  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0519388  hitchhiker  0.0000109547 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4372  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.89 
 
 		 614 aa  94.4  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0258695  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6080  putative TonB-dependent receptor  24.21 
 
 		 690 aa  94.4  7e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.341343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0123  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25 
 
 		 631 aa  94.4  7e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000105264  normal  0.11479 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  24.09 
 
 		 646 aa  93.2  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4462  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.83 
 
 		 614 aa  92.8  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0180001  hitchhiker  0.0000000000824718 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4119  TonB-dependent vitamin B12 receptor  26.09 
 
 		 616 aa  92.8  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4536  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.75 
 
 		 614 aa  92.8  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.329693  hitchhiker  0.0000000267555 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6079  putative TonB-dependent receptor  25.03 
 
 		 680 aa  92.4  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0972806  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4020  TonB-dependent vitamin B12 receptor  25.38 
 
 		 614 aa  92  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00348064  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4050  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.38 
 
 		 614 aa  92  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00780594  decreased coverage  0.000540594 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4507  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.14 
 
 		 614 aa  92.4  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000315572  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4200  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.14 
 
 		 614 aa  92.4  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000101627  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0509  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  28.18 
 
 		 614 aa  91.7  4e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.194967  normal  0.193806 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1012  TonB-dependent receptor  24.13 
 
 		 626 aa  91.7  4e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4413  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  26.05 
 
 		 614 aa  91.7  4e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000903793  hitchhiker  0.00898611 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5430  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.14 
 
 		 614 aa  91.7  4e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0043717  normal  0.0207602 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1096  TonB-dependent receptor  24.13 
 
 		 626 aa  91.7  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0279  TonB-dependent receptor  23.63 
 
 		 730 aa  91.3  5e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.874959  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1859  TonB-dependent receptor plug  36.84 
 
 		 686 aa  90.9  8e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000014407  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0159  TonB-dependent receptor  21.74 
 
 		 709 aa  89.4  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0790  TonB-dependent receptor  32.21 
 
 		 614 aa  87.4  9e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.270148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4561  TonB-dependent receptor  23.74 
 
 		 824 aa  87.4  9e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0251417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  23.23 
 
 		 639 aa  87  0.000000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52230  outer membrane receptor FepA  24.12 
 
 		 742 aa  86.7  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.267722 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4579  outer membrane receptor FepA  24.15 
 
 		 742 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2030  TonB-dependent receptor, plug  33.66 
 
 		 668 aa  85.9  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0778  TonB-dependent receptor  31.82 
 
 		 742 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2046  TonB-dependent receptor  25.44 
 
 		 713 aa  86.3  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183904 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2092  TonB-dependent receptor  30.98 
 
 		 670 aa  85.9  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1368  TonB-dependent receptor  23.73 
 
 		 627 aa  85.5  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.249969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0654  TonB-dependent receptor  33.96 
 
 		 638 aa  85.1  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.561107  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05789  hypothetical protein  23.94 
 
 		 712 aa  84.7  0.000000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2219  TonB-dependent receptor  23.2 
 
 		 692 aa  84.7  0.000000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1162  tonB-dependent vitamin B12 receptor  23.18 
 
 		 622 aa  84.3  0.000000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002470  TonB-dependent receptor  24.3 
 
 		 652 aa  84.3  0.000000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.337593  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0461  TonB-dependent vitamin B12 receptor  25.25 
 
 		 613 aa  84  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00224002  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2547  TonB-dependent receptor plug  29.17 
 
 		 615 aa  83.6  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.792273  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1110  TonB-dependent receptor  22.66 
 
 		 625 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000459108  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01404  hypothetical protein  23.43 
 
 		 640 aa  83.2  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1716  outer membrane receptor FepA  24.96 
 
 		 746 aa  82.4  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5290  TonB-dependent receptor plug  30.39 
 
 		 673 aa  82.4  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>