58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5731 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_5731  hypothetical protein  100 
 
 
249 aa  496  1e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195243  normal  0.543565 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0873  hypothetical protein  83.12 
 
 
247 aa  377  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0454325  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3744  protein of unknown function DUF969  75.1 
 
 
249 aa  365  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.79738  normal  0.788964 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0192  hypothetical protein  79.3 
 
 
249 aa  360  1e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2906  hypothetical protein  74.59 
 
 
254 aa  347  8e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.656807 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2168  hypothetical protein  74.45 
 
 
239 aa  346  2e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.202836  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0227  hypothetical protein  77.33 
 
 
247 aa  338  4e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2114  hypothetical protein  75.77 
 
 
352 aa  334  7.999999999999999e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0446  hypothetical protein  75.77 
 
 
338 aa  333  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3371  hypothetical protein  75.77 
 
 
250 aa  332  2e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0263  hypothetical protein  75.77 
 
 
250 aa  332  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.387363  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0250  hypothetical protein  75.77 
 
 
250 aa  332  2e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.278057  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2977  hypothetical protein  75.77 
 
 
250 aa  332  2e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.226934  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1971  protein of unknown function DUF969  74.45 
 
 
241 aa  327  1.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.988199  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1217  hypothetical protein  67.5 
 
 
239 aa  324  7e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.414254  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2371  protein of unknown function DUF969  72.29 
 
 
245 aa  323  2e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.1601  normal  0.836703 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0065  hypothetical protein  72.41 
 
 
244 aa  319  3e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0090  hypothetical protein  74.01 
 
 
243 aa  319  3e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.154207  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3291  protein of unknown function DUF969  70.26 
 
 
239 aa  318  7e-86  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0005  hypothetical protein  69.91 
 
 
261 aa  315  5e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.670577 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1258  hypothetical protein  67.47 
 
 
243 aa  312  3.9999999999999997e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0785505  normal  0.799705 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1118  hypothetical protein  70.18 
 
 
243 aa  305  5.0000000000000004e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000146314  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3592  hypothetical protein  70.18 
 
 
243 aa  305  5.0000000000000004e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1170  hypothetical protein  70.18 
 
 
243 aa  305  5.0000000000000004e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000118885  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0020  hypothetical protein  51.82 
 
 
246 aa  256  3e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00300122 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1182  protein of unknown function DUF969  52.81 
 
 
239 aa  250  1e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.8067  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6525  protein of unknown function DUF969  53.33 
 
 
245 aa  236  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120098  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2570  protein of unknown function DUF969  51.83 
 
 
228 aa  232  4.0000000000000004e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4532  hypothetical protein  52.94 
 
 
229 aa  226  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.754245 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3452  hypothetical protein  51.13 
 
 
229 aa  224  1e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.159434 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2013  hypothetical protein  51.85 
 
 
229 aa  223  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.319899  normal  0.403491 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3959  hypothetical protein  51.13 
 
 
229 aa  221  7e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.413455 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3466  hypothetical protein  51.85 
 
 
229 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.553486  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4059  hypothetical protein  51.85 
 
 
229 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.292626  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4307  hypothetical protein  51.85 
 
 
229 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0933  hypothetical protein  50 
 
 
229 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.262874  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1378  hypothetical protein  48.64 
 
 
230 aa  209  4e-53  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0656  hypothetical protein  48.18 
 
 
230 aa  208  5e-53  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0577  hypothetical protein  48.18 
 
 
230 aa  208  5e-53  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2480  hypothetical protein  53.92 
 
 
217 aa  202  3e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2871  hypothetical protein  46.05 
 
 
231 aa  194  8.000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3085  hypothetical protein  45.49 
 
 
233 aa  194  1e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.831392  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2151  hypothetical protein  46.05 
 
 
231 aa  194  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3117  hypothetical protein  45.41 
 
 
231 aa  192  3e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000991009  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3099  hypothetical protein  44.44 
 
 
233 aa  191  7e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2879  hypothetical protein  44.44 
 
 
234 aa  191  7e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.225033  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3094  hypothetical protein  44.44 
 
 
234 aa  191  7e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3118  hypothetical protein  45.87 
 
 
231 aa  191  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2807  permease  45.29 
 
 
234 aa  191  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2846  permease  44.54 
 
 
230 aa  190  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0437  protein of unknown function DUF969  44.44 
 
 
223 aa  179  4e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000406355  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2881  protein of unknown function DUF969  52.06 
 
 
236 aa  176  3e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1372  hypothetical protein  37.95 
 
 
230 aa  154  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.157148  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1834  hypothetical protein  38.77 
 
 
227 aa  152  5.9999999999999996e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.320572 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1415  hypothetical protein  36.57 
 
 
226 aa  147  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0773605  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1680  hypothetical protein  37.04 
 
 
226 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.936458  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0177  hypothetical protein  35.27 
 
 
224 aa  139  3.9999999999999997e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000813125  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1237  protein of unknown function DUF969  34.48 
 
 
221 aa  125  5e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>