More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5666 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5666  amidohydrolase 3  100 
 
 		 554 aa  1130    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.498872  normal  0.0259745 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4295  amidohydrolase 3  82.55 
 
 		 557 aa  932    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6052  amidohydrolase 3  57.55 
 
 		 555 aa  623  1e-177  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.863749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7627  amidohydrolase-like  56.63 
 
 		 555 aa  616  1e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.137819 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4359  Amidohydrolase 3  54.45 
 
 		 552 aa  600  1e-170  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.747715 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5757  amidohydrolase:amidohydrolase-like  54.25 
 
 		 547 aa  584  1.0000000000000001e-165  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.691063  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0108  Amidohydrolase 3  52.91 
 
 		 547 aa  568  1e-161  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134206  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0134  amidohydrolase-like  53.27 
 
 		 547 aa  570  1e-161  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.900918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3250  amidohydrolase 3  52.92 
 
 		 542 aa  555  1e-157  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.383305  normal  0.632693 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1985  amidohydrolase 3  52.08 
 
 		 554 aa  553  1e-156  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4766  amidohydrolase 3  51.64 
 
 		 545 aa  544  1e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4287  amidohydrolase 3  50.9 
 
 		 544 aa  526  1e-148  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.275898  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0099  hypothetical protein  31.63 
 
 		 577 aa  244  3e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.119429  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0005  twin-arginine translocation pathway signal  32.8 
 
 		 584 aa  239  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0597  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  31.06 
 
 		 575 aa  225  2e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0635  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  30.88 
 
 		 575 aa  223  4.9999999999999996e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2000  twin-arginine translocation pathway signal  29.23 
 
 		 638 aa  213  1e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0736  amidohydrolase 3  33.99 
 
 		 536 aa  206  1e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0656369  normal  0.367651 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0742  amidohydrolase 3  33.99 
 
 		 536 aa  206  1e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.838024  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0756  amidohydrolase 3  33.99 
 
 		 536 aa  206  1e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.398429  normal  0.248868 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1124  amidohydrolase 3  30.09 
 
 		 625 aa  193  6e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.70056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3353  amidohydrolase 3  30.54 
 
 		 583 aa  193  8e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.742336  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2185  Amidohydrolase 3  26.39 
 
 		 563 aa  192  1e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0420  amidohydrolase-like  29.31 
 
 		 581 aa  191  4e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10562  hypothetical protein  31.53 
 
 		 537 aa  186  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.036236 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2078  hypothetical protein  26.4 
 
 		 576 aa  182  1e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2836  amidohydrolase 3  25.44 
 
 		 597 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214714 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3458  hypothetical protein  29.51 
 
 		 601 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.55725  normal  0.0698709 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3889  Amidohydrolase 3  38.31 
 
 		 624 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004324  metal-dependent hydrolase  28.52 
 
 		 581 aa  172  1e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3333  amidohydrolase 3  30.89 
 
 		 538 aa  171  3e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.827227 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  26.25 
 
 		 539 aa  167  5.9999999999999996e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3462  amidohydrolase 3  28.84 
 
 		 650 aa  166  8e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4035  Amidohydrolase 3  30.84 
 
 		 556 aa  159  9e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.787006  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1013  Amidohydrolase 3  29.46 
 
 		 548 aa  158  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.668342  normal  0.733638 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2765  amidohydrolase  30.43 
 
 		 543 aa  155  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.270794  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0100  hypothetical protein  25.3 
 
 		 604 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1541  putative amidohydrolase 3  28.94 
 
 		 648 aa  153  8e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.260198  normal  0.229672 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0803  Amidohydrolase 3  26.32 
 
 		 564 aa  153  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.379476 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4036  amidohydrolase 3  26.91 
 
 		 601 aa  152  1e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2075  putative lipoprotein  26.94 
 
 		 585 aa  150  4e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.860152  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1885  Amidohydrolase 3  26.67 
 
 		 587 aa  149  1.0000000000000001e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.5166  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1096  Amidohydrolase 3  31.9 
 
 		 525 aa  147  5e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0760  amidohydrolase 3  26.24 
 
 		 592 aa  147  5e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3404  Amidohydrolase 3  29.01 
 
 		 586 aa  146  9e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000897209  hitchhiker  0.00001315 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3243  amidohydrolase 3  28.8 
 
 		 573 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.262757  normal  0.0106893 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0426  Amidohydrolase 3  25.48 
 
 		 539 aa  142  1.9999999999999998e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0253  amidohydrolase 3  29.38 
 
 		 551 aa  141  3e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  26.29 
 
 		 569 aa  140  6e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1859  amidohydrolase 3  28.96 
 
 		 549 aa  140  7e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.909827 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4231  Amidohydrolase 3  28.33 
 
 		 626 aa  140  7e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  31.44 
 
 		 530 aa  140  7.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1793  hypothetical protein  30.07 
 
 		 539 aa  139  1e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  30.4 
 
 		 556 aa  137  4e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2930  amidohydrolase 3  26.89 
 
 		 606 aa  137  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.143401 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  28.95 
 
 		 553 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4051  amidohydrolase 3  27.53 
 
 		 620 aa  133  6.999999999999999e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  25 
 
 		 520 aa  133  9e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2928  Amidohydrolase 3  26.64 
 
 		 562 aa  132  2.0000000000000002e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.548866  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1574  Amidohydrolase 3  30.02 
 
 		 540 aa  132  2.0000000000000002e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  24.01 
 
 		 574 aa  130  6e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2070  amidohydrolase 3  26.92 
 
 		 560 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1290  Amidohydrolase 3  27.18 
 
 		 603 aa  129  2.0000000000000002e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0346185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3185  amidohydrolase 3  26.44 
 
 		 560 aa  128  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.214251  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1491  Amidohydrolase 3  28.11 
 
 		 537 aa  128  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0764832 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  29.26 
 
 		 542 aa  128  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3380  amidohydrolase 3  26.76 
 
 		 583 aa  128  3e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.121577 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3329  amidohydrolase 3  26.76 
 
 		 583 aa  128  3e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.842  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3318  twin-arginine translocation pathway signal  26.87 
 
 		 543 aa  127  6e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.5989  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  26.69 
 
 		 527 aa  126  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  29.6 
 
 		 532 aa  126  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2780  amidohydrolase  27.57 
 
 		 576 aa  125  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2609  amidohydrolase 3  27.48 
 
 		 548 aa  125  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.506547 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3417  Amidohydrolase 3  27.17 
 
 		 545 aa  125  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.151731 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5168  amidohydrolase 3  28.15 
 
 		 541 aa  125  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.54245 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34970  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  28.34 
 
 		 541 aa  125  3e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.134464  normal  0.645084 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1737  Amidohydrolase 3  26.03 
 
 		 618 aa  124  4e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.493619  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1631  Amidohydrolase 3  29.58 
 
 		 537 aa  124  4e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0506733 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2102  amidohydrolase 3  28.04 
 
 		 928 aa  124  6e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7493  amidohydrolase family  27.59 
 
 		 564 aa  124  6e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0605616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3245  amidohydrolase 3  29.21 
 
 		 569 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00990212 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2637  Amidohydrolase 3  25.1 
 
 		 533 aa  120  7e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0535  Amidohydrolase 3  28.18 
 
 		 539 aa  120  9e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1072  Amidohydrolase 3  22.64 
 
 		 505 aa  119  9.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.185661  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  26.39 
 
 		 583 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  27.37 
 
 		 556 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2059  amidohydrolase 3  29.08 
 
 		 569 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1988  amidohydrolase 3  29.03 
 
 		 535 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118371  normal  0.562077 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1172  hypothetical protein  28.09 
 
 		 560 aa  117  6.9999999999999995e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0178452  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1551  amidohydrolase 3  27.93 
 
 		 542 aa  116  8.999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.56072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2426  amidohydrolase 3  25.27 
 
 		 549 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0970  Amidohydrolase 3  26.21 
 
 		 616 aa  116  1.0000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.31521  hitchhiker  0.000183819 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1075  exoenzymes regulatory protein aepa  28.16 
 
 		 543 aa  116  1.0000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00663021  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4441  Amidohydrolase 3  28.5 
 
 		 535 aa  115  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2425  Amidohydrolase 3  29.23 
 
 		 545 aa  115  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2586  amidohydrolase 3  27.64 
 
 		 537 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0687512  normal  0.83708 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3052  amidohydrolase 3  25.81 
 
 		 546 aa  114  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22680  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  29.75 
 
 		 543 aa  115  3e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2802  hypothetical protein  29.12 
 
 		 580 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.992935  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32950  hypothetical protein  29.12 
 
 		 580 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000236745 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>