43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5514 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5514  hypothetical protein  100 
 
 		 1504 aa  2989    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3246  hypothetical protein  32.57 
 
 		 2760 aa  184  1e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  31.76 
 
 		 6885 aa  133  3e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4277  Ig domain-containing protein  39.62 
 
 		 690 aa  90.9  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.191701 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0529  Ig domain-containing protein  35.9 
 
 		 3209 aa  89.4  5e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000000708998 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2421  conserved repeat domain protein  43.31 
 
 		 3373 aa  85.1  0.000000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0570  conserved repeat domain protein  40 
 
 		 2047 aa  82.4  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4196  conserved repeat domain protein  42.86 
 
 		 666 aa  79  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00838745  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1934  conserved repeat domain-containing protein  38.14 
 
 		 1263 aa  73.6  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.426713  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1068  hypothetical protein  38.98 
 
 		 5166 aa  70.5  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0772  fibronectin type III domain-containing protein  37.6 
 
 		 497 aa  67.4  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4990  Ig domain-containing protein  35.62 
 
 		 1532 aa  66.2  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2197  hypothetical protein  38.98 
 
 		 5203 aa  66.2  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0759  hypothetical protein  39.13 
 
 		 907 aa  64.7  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.747993 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5804  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  35.66 
 
 		 1394 aa  60.1  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.512223  normal  0.443028 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3132  conserved repeat domain protein  41.89 
 
 		 5517 aa  59.3  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.593801 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  36.92 
 
 		 3191 aa  58.9  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4713  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.15 
 
 		 1284 aa  58.9  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.814549 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1602  Cna B domain-containing protein  31.93 
 
 		 2656 aa  55.5  0.000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4710  ubiquitin  36.67 
 
 		 287 aa  53.1  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2043  hypothetical protein  35.06 
 
 		 2604 aa  52.8  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0241437 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0756  polymorphic outer membrane protein  42.68 
 
 		 2042 aa  52.8  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.442384  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0599  cell wall anchor domain-containing protein  24.87 
 
 		 1337 aa  51.2  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0585  cell wall anchor domain-containing protein  24.87 
 
 		 1337 aa  51.2  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1738  conserved repeat domain protein  27.47 
 
 		 1519 aa  50.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2474  conserved repeat domain protein  36.28 
 
 		 1293 aa  50.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.558033  hitchhiker  0.00737149 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0109  fibronectin type III domain-containing protein  30.5 
 
 		 1225 aa  51.2  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3822  Cna B domain protein  35.83 
 
 		 1243 aa  49.3  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0177  conserved repeat domain protein  32.88 
 
 		 5544 aa  49.3  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0400356 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0460  FG-GAP repeat-containing protein  32.22 
 
 		 2474 aa  49.3  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0854  conserved repeat domain protein  27.64 
 
 		 1150 aa  48.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.31154  normal  0.948957 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3285  Outer membrane autotransporter barrel  45.95 
 
 		 1895 aa  48.5  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.761058 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2821  hypothetical protein  28.06 
 
 		 2620 aa  47.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0867101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3535  Carbonate dehydratase  34.09 
 
 		 440 aa  46.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00169565 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0600  cell wall anchor domain-containing protein  31.4 
 
 		 1153 aa  46.6  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0586  cell wall anchor domain-containing protein  31.4 
 
 		 1153 aa  46.6  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2261  putative invasin  28.06 
 
 		 2296 aa  46.2  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000213417  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0312  hypothetical protein  30.81 
 
 		 775 aa  46.2  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0887413  decreased coverage  0.00223033 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1146  putative invasin  27.55 
 
 		 2358 aa  45.8  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0236559  hitchhiker  0.00000000373637 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3592  hypothetical protein  37.04 
 
 		 1727 aa  45.8  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01881  hypothetical protein  27.55 
 
 		 2367 aa  45.4  0.008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0890809  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01891  adhesin  27.55 
 
 		 2383 aa  45.4  0.008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0926069  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1674  Ig domain protein group 1 domain protein  27.55 
 
 		 2358 aa  45.4  0.008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>