More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5484 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_5484  GTP-binding protein Obg/CgtA  100 
 
 
371 aa  756    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.215863  normal  0.278538 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0772  GTPase ObgE  88.57 
 
 
357 aa  620  1e-176  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0843  GTPase ObgE  88.29 
 
 
379 aa  617  1e-176  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.946123  normal  0.830278 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4216  GTPase ObgE  84.83 
 
 
362 aa  602  1.0000000000000001e-171  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.862872  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3673  GTPase ObgE  86.93 
 
 
357 aa  597  1e-170  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.291643  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1270  GTPase ObgE  85.14 
 
 
355 aa  592  1e-168  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0124615  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0749  GTPase ObgE  82.15 
 
 
364 aa  579  1e-164  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00709359 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0837  GTPase ObgE  83.48 
 
 
361 aa  577  1.0000000000000001e-163  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.330133  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0513  hypothetical protein  76.9 
 
 
370 aa  550  1e-155  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.609745  normal  0.0660512 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3915  GTPase ObgE  78.99 
 
 
363 aa  548  1e-155  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0260013 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3275  GTP-binding protein Obg/CgtA  71.97 
 
 
369 aa  516  1.0000000000000001e-145  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000381573 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2820  GTPase ObgE  69.34 
 
 
366 aa  479  1e-134  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0271751  normal  0.376646 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3065  GTPase ObgE  73.13 
 
 
364 aa  480  1e-134  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.72259  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3104  GTPase ObgE  74.1 
 
 
365 aa  479  1e-134  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2655  GTPase ObgE  73.13 
 
 
364 aa  480  1e-134  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.031606  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2956  GTPase ObgE  73.19 
 
 
365 aa  477  1e-133  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2650  GTPase ObgE  70.29 
 
 
370 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0689213  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3668  GTPase ObgE  71.22 
 
 
370 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0100142  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1142  GTPase ObgE  70.92 
 
 
372 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3487  GTPase ObgE  70.62 
 
 
372 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0444  GTPase ObgE  70.62 
 
 
372 aa  463  1e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2521  GTPase ObgE  70.62 
 
 
372 aa  463  1e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.685664  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1303  GTPase ObgE  70.62 
 
 
372 aa  463  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3522  GTPase ObgE  70.62 
 
 
372 aa  463  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.091064  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3524  GTPase ObgE  70.62 
 
 
372 aa  463  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3260  GTPase ObgE  70.62 
 
 
372 aa  463  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3447  GTPase ObgE  70.87 
 
 
373 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.179081  hitchhiker  0.00548922 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0511  GTPase ObgE  68.88 
 
 
370 aa  454  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.166146  normal  0.91816 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0509  GTPase ObgE  70.57 
 
 
373 aa  457  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.626266 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0553  GTPase ObgE  71.22 
 
 
370 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000106913  normal  0.0178049 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0196  GTPase ObgE  65.92 
 
 
362 aa  452  1.0000000000000001e-126  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00825185  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0101  GTPase ObgE  71.22 
 
 
370 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.113103  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0214  GTPase ObgE  67.05 
 
 
370 aa  451  1.0000000000000001e-126  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.301302 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0486  GTPase ObgE  68.59 
 
 
370 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.165624  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0583  GTPase ObgE  71.22 
 
 
370 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0349123  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2800  GTPase ObgE  71.22 
 
 
369 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0270558  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2217  GTPase ObgE  65.88 
 
 
353 aa  434  1e-121  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000677684  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1631  GTPase ObgE  67.17 
 
 
397 aa  413  1e-114  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1817  GTPase ObgE  61.47 
 
 
354 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.389419  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3472  GTPase ObgE  62.72 
 
 
363 aa  395  1e-109  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.004996  normal  0.428622 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3208  GTPase ObgE  60.7 
 
 
347 aa  397  1e-109  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0703  GTPase ObgE  60.95 
 
 
407 aa  392  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.718504 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0866  GTPase ObgE  65.77 
 
 
350 aa  392  1e-108  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4495  GTPase ObgE  57.87 
 
 
408 aa  388  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.589803  normal  0.496901 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0690  GTPase ObgE  57.3 
 
 
408 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0799  GTP-binding protein, GTP1/Obg family  60.42 
 
 
407 aa  385  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2702  GTPase ObgE  58.19 
 
 
341 aa  386  1e-106  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4858  GTPase ObgE  60.42 
 
 
407 aa  387  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0722  GTPase ObgE  57.3 
 
 
408 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0320956 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0722  GTPase ObgE  57.3 
 
 
408 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.91341 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0476  GTPase ObgE  57.48 
 
 
395 aa  385  1e-106  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2574  GTPase ObgE  57.6 
 
 
341 aa  384  1e-105  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2248  GTPase ObgE  58.28 
 
 
345 aa  379  1e-104  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.0000169157  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0857  GTPase ObgE  58.59 
 
 
397 aa  380  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.121335  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0847  GTP1/OBG domain-containing protein  57.8 
 
 
358 aa  379  1e-104  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5206  GTPase ObgE  60.23 
 
 
406 aa  381  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.683682  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60445  GTPase ObgE  60.23 
 
 
406 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00233536 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40770  GTPase ObgE  60.36 
 
 
405 aa  377  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3680  GTPase ObgE  58.52 
 
 
406 aa  378  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.96249 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3035  GTPase ObgE  56.72 
 
 
345 aa  371  1e-102  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.736033  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0248  GTPase ObgE  57.87 
 
 
392 aa  370  1e-101  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0871  GTPase ObgE  63.08 
 
 
387 aa  365  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0184633  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1006  GTPase ObgE  61.23 
 
 
389 aa  365  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000134861  decreased coverage  0.00000589779 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03729  GTPase ObgE  59.46 
 
 
392 aa  364  2e-99  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0913386  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0956  GTPase ObgE  61.85 
 
 
386 aa  361  9e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3476  GTPase ObgE  58.15 
 
 
391 aa  360  2e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000303711  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2007  GTP-binding protein Obg/CgtA  56.2 
 
 
356 aa  359  4e-98  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.339199  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3736  GTPase ObgE  61.04 
 
 
397 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0046392  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1525  GTPase ObgE  52.86 
 
 
357 aa  357  2.9999999999999997e-97  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0343  GTPase ObgE  56.2 
 
 
346 aa  356  3.9999999999999996e-97  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000591605  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3609  GTPase ObgE  56.74 
 
 
390 aa  355  5e-97  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000696199  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3978  GTPase ObgE  56.74 
 
 
390 aa  355  5e-97  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000165157  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3743  GTPase ObgE  56.74 
 
 
390 aa  355  5e-97  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4236  GTP-binding protein Obg/CgtA  56.05 
 
 
396 aa  355  6.999999999999999e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000643018  hitchhiker  0.00000182471 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0561  GTPase ObgE  57.55 
 
 
390 aa  353  2e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00587502  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0268  GTP-binding protein Obg/CgtA  58.11 
 
 
375 aa  353  2.9999999999999997e-96  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1504  GTPase ObgE  55.65 
 
 
405 aa  352  7e-96  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1683  GTPase ObgE  55.08 
 
 
405 aa  351  1e-95  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0638359  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1582  GTPase ObgE  52.29 
 
 
357 aa  351  1e-95  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3357  GTPase ObgE  58.11 
 
 
392 aa  350  2e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0207536  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1010  GTPase ObgE  54.8 
 
 
402 aa  350  2e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000125239  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3087  GTPase ObgE  61.85 
 
 
388 aa  350  2e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0476  GTPase ObgE  57.26 
 
 
390 aa  350  3e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000104171  normal  0.949161 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1681  GTPase ObgE  56.51 
 
 
339 aa  349  5e-95  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00207916  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0527  GTPase ObgE  57.31 
 
 
386 aa  349  6e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0796  GTPase ObgE  56.98 
 
 
390 aa  348  8e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000620978  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2855  GTPase ObgE  57.75 
 
 
395 aa  348  8e-95  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000349951  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1601  GTPase ObgE  54.93 
 
 
402 aa  347  2e-94  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000135042  hitchhiker  0.000110073 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0498  GTPase ObgE  56.21 
 
 
339 aa  347  2e-94  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000072734  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1121  GTPase ObgE  57.14 
 
 
350 aa  345  7e-94  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.261529  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3619  GTPase ObgE  56.01 
 
 
392 aa  344  2e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000171752  normal  0.293815 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0283  GTP-binding protein Obg/CgtA  55.71 
 
 
374 aa  343  2.9999999999999997e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0460  GTP-binding protein Obg/CgtA  55.71 
 
 
374 aa  343  2.9999999999999997e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00177259 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3598  GTPase ObgE  56.55 
 
 
390 aa  343  4e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3660  GTPase ObgE  56.55 
 
 
390 aa  343  4e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0449011  normal  0.0890894 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3491  GTPase ObgE  56.55 
 
 
390 aa  343  4e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000240056  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3493  GTPase ObgE  56.55 
 
 
390 aa  343  4e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364177  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3562  GTPase ObgE  56.55 
 
 
390 aa  343  4e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.238363  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001671  GTP-binding protein Obg  57.85 
 
 
391 aa  342  5.999999999999999e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000343056  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3217  GTPase ObgE  62.46 
 
 
388 aa  342  7e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000011291  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>