More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5472 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5472  hypothetical protein  100 
 
 		 330 aa  667    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0855  hypothetical protein  83.33 
 
 		 353 aa  523  1e-147  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.898803 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0784  hypothetical protein  83.33 
 
 		 328 aa  522  1e-147  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  65.02 
 
 		 320 aa  431  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3359  hypothetical protein  63.61 
 
 		 331 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  53.67 
 
 		 328 aa  322  6e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0521  hypothetical protein  52.67 
 
 		 326 aa  318  6e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895579  normal  0.13289 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0579  hypothetical protein  52.49 
 
 		 322 aa  315  5e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444417  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2413  hypothetical protein  49.38 
 
 		 325 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.325014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  49.5 
 
 		 330 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  49.5 
 
 		 330 aa  307  2.0000000000000002e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0982  hypothetical protein  54.07 
 
 		 328 aa  304  1.0000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160235  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1184  hypothetical protein  50.46 
 
 		 356 aa  303  4.0000000000000003e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000425301  normal  0.947085 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1070  hypothetical protein  47.68 
 
 		 332 aa  298  7e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.530289  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  48.84 
 
 		 334 aa  297  1e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5205  hypothetical protein  48.63 
 
 		 321 aa  297  2e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.419234  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1292  hypothetical protein  51.5 
 
 		 325 aa  294  1e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0982133  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5108  extra-cytoplasmic solute receptor  46.93 
 
 		 326 aa  293  2e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000000351886  normal  0.964391 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3194  hypothetical protein  45.6 
 
 		 318 aa  293  3e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1145  hypothetical protein  47.88 
 
 		 325 aa  293  3e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1312  hypothetical protein  46.31 
 
 		 320 aa  292  5e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  48.53 
 
 		 325 aa  291  1e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  47.08 
 
 		 328 aa  291  2e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2023  hypothetical protein  48.12 
 
 		 327 aa  290  2e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  46.63 
 
 		 327 aa  287  2e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  47.84 
 
 		 328 aa  286  2e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3996  hypothetical protein  45.9 
 
 		 321 aa  285  7e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.96574  normal  0.364357 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3346  hypothetical protein  45.9 
 
 		 321 aa  285  7e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0146351  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0228  hypothetical protein  46.82 
 
 		 328 aa  285  9e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  47.99 
 
 		 325 aa  283  3.0000000000000004e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  47.99 
 
 		 327 aa  283  3.0000000000000004e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5244  hypothetical protein  49.82 
 
 		 322 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  45.45 
 
 		 328 aa  282  4.0000000000000003e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  47.32 
 
 		 339 aa  282  5.000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3250  hypothetical protein  49.83 
 
 		 330 aa  280  4e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  42.86 
 
 		 331 aa  279  5e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0879  hypothetical protein  46.69 
 
 		 322 aa  279  6e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.381567 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5284  hypothetical protein  47.88 
 
 		 330 aa  278  7e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145464  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  45.97 
 
 		 322 aa  278  1e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  46.75 
 
 		 345 aa  277  2e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  43.53 
 
 		 328 aa  276  3e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  46.75 
 
 		 345 aa  276  3e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3547  hypothetical protein  51.15 
 
 		 330 aa  276  4e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0902  hypothetical protein  46.84 
 
 		 320 aa  275  8e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0987  hypothetical protein  46.84 
 
 		 320 aa  275  8e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2205  hypothetical protein  43.6 
 
 		 324 aa  275  9e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0725118 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  46.22 
 
 		 330 aa  274  1.0000000000000001e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4634  hypothetical protein  46.77 
 
 		 322 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.898459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0483  hypothetical protein  44.51 
 
 		 334 aa  273  2.0000000000000002e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  46.31 
 
 		 323 aa  273  2.0000000000000002e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4438  extra-cytoplasmic solute receptor  45.08 
 
 		 329 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000369974  normal  0.285012 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2409  hypothetical protein  46.98 
 
 		 322 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.417331  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1326  hypothetical protein  45.9 
 
 		 312 aa  273  2.0000000000000002e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.12583  hitchhiker  7.14872e-17 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2981  hypothetical protein  46.98 
 
 		 322 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  45.18 
 
 		 324 aa  273  3e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  46.86 
 
 		 330 aa  271  8.000000000000001e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  46.86 
 
 		 330 aa  271  8.000000000000001e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  44.04 
 
 		 330 aa  271  9e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  43.9 
 
 		 339 aa  271  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5118  hypothetical protein  46.18 
 
 		 320 aa  271  1e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.534032 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3459  hypothetical protein  45.28 
 
 		 324 aa  271  1e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.505499  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1325  hypothetical protein  43.16 
 
 		 330 aa  271  1e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3994  hypothetical protein  44.11 
 
 		 322 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.189336 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3371  hypothetical protein  44.85 
 
 		 332 aa  269  4e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  44.97 
 
 		 325 aa  270  4e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  44.21 
 
 		 325 aa  269  5e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  43.42 
 
 		 318 aa  269  5e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1715  hypothetical protein  44.34 
 
 		 320 aa  268  5.9999999999999995e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.786272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1141  hypothetical protein  42.14 
 
 		 322 aa  268  7e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3024  hypothetical protein  45.15 
 
 		 332 aa  268  7e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  43.82 
 
 		 336 aa  268  8e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  44.93 
 
 		 325 aa  268  8.999999999999999e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1334  hypothetical protein  43.6 
 
 		 325 aa  268  1e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000781341 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  44.51 
 
 		 335 aa  267  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  46.18 
 
 		 327 aa  267  2e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  45.57 
 
 		 360 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  41.01 
 
 		 322 aa  266  4e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  43.69 
 
 		 325 aa  266  4e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  44.59 
 
 		 339 aa  265  1e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  42.15 
 
 		 326 aa  263  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2106  hypothetical protein  43.32 
 
 		 337 aa  263  3e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  46.58 
 
 		 333 aa  263  3e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4401  hypothetical protein  48.83 
 
 		 321 aa  263  3e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0268815  normal  0.198915 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  44.48 
 
 		 330 aa  262  4.999999999999999e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1270  hypothetical protein  44.82 
 
 		 323 aa  262  4.999999999999999e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  43.25 
 
 		 332 aa  262  6.999999999999999e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5221  Bug family extra-cytoplasmic solute receptor  44.24 
 
 		 347 aa  261  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  41.34 
 
 		 328 aa  261  1e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  46.05 
 
 		 328 aa  261  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3088  putative signal peptide protein  45.67 
 
 		 317 aa  260  2e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0784453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  46.15 
 
 		 331 aa  260  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  42.47 
 
 		 337 aa  260  2e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  45.42 
 
 		 349 aa  260  2e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2912  hypothetical protein  44.97 
 
 		 337 aa  260  3e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  41.03 
 
 		 328 aa  259  5.0000000000000005e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0790  hypothetical protein  45.97 
 
 		 328 aa  258  7e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  43.19 
 
 		 326 aa  258  7e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  42.67 
 
 		 356 aa  258  7e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3678  hypothetical protein  43.24 
 
 		 327 aa  258  1e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  43.64 
 
 		 353 aa  257  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>