216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5450 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_5450  endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 
257 aa  525  1e-148  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0806  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  84.3 
 
 
255 aa  431  1e-120  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.636912  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0877  endonuclease/exonuclease/phosphatase  84.3 
 
 
255 aa  431  1e-120  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3633  endonuclease/exonuclease/phosphatase  79.44 
 
 
252 aa  410  1e-114  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0240015  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1327  endonuclease/exonuclease/phosphatase  75.93 
 
 
245 aa  386  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.51669  hitchhiker  0.00270426 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4120  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  70.66 
 
 
250 aa  348  5e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1299  endonuclease/exonuclease/phosphatase  71.9 
 
 
252 aa  348  5e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4016  endonuclease/exonuclease/phosphatase  57.54 
 
 
276 aa  277  9e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.34924e-06 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1072  hypothetical protein  56.68 
 
 
270 aa  277  1e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.348031  normal  0.384131 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0359  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  45.08 
 
 
248 aa  194  9e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0344  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.67 
 
 
248 aa  191  8e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0469  hypothetical protein  44.26 
 
 
248 aa  187  1e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.744864  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0442  endonuclease/exonuclease/phosphatase  45.71 
 
 
262 aa  186  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0381  endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.98 
 
 
251 aa  181  7e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.853038  normal  0.111284 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0606  endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.51 
 
 
250 aa  176  4e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.374942  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3642  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.04 
 
 
249 aa  174  2e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.748827  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2380  endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.2 
 
 
251 aa  169  4e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.835809 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0014  endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.5 
 
 
277 aa  164  2e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.241981 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0048  hypothetical protein  39.84 
 
 
256 aa  162  4e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00965819  normal  0.1661 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3278  endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.04 
 
 
261 aa  160  3e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0026  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.52 
 
 
267 aa  157  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3504  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  40.59 
 
 
237 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.40759  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0445  endonuclease / exonuclease / phosphatase family protein  39.92 
 
 
251 aa  156  4e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.625659 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24830  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.41 
 
 
276 aa  155  4e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.669671  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0086  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.69 
 
 
257 aa  155  6e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0080  hypothetical protein  34.69 
 
 
302 aa  154  1e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3767  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.36 
 
 
252 aa  154  1e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0769557 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2645  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.98 
 
 
261 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.150024  normal  0.299573 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2631  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.84 
 
 
257 aa  151  9e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.363839 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4298  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.98 
 
 
259 aa  151  9e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2495  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.67 
 
 
257 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3007  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.95 
 
 
279 aa  150  3e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3724  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.95 
 
 
279 aa  150  3e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.236792  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3265  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.67 
 
 
257 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.585826  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1787  endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.04 
 
 
264 aa  149  6e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.717183  normal  0.757673 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4056  endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.04 
 
 
264 aa  149  6e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3655  endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.04 
 
 
264 aa  147  2e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0227458 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5036  aminoacyl-tRNA hydrolase  38.93 
 
 
265 aa  146  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0185176 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0534  hypothetical protein  35.11 
 
 
257 aa  144  1e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0510  hypothetical protein  34.92 
 
 
257 aa  144  2e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3150  hypothetical protein  39.42 
 
 
245 aa  142  4e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.610238  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2238  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.01 
 
 
251 aa  142  5e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2284  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.59 
 
 
262 aa  140  1e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0656369  hitchhiker  0.000754964 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2538  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.85 
 
 
260 aa  139  4e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0938  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  35.22 
 
 
253 aa  139  4e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2515  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.1 
 
 
256 aa  139  6e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.764021  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2852  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.22 
 
 
253 aa  139  6e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.350943  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0813  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  35.22 
 
 
253 aa  139  6e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0192282  normal  0.85473 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2424  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.78 
 
 
253 aa  139  7e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.123297  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0854  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  36.44 
 
 
253 aa  138  7e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0013  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.59 
 
 
242 aa  138  8e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.914403  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36680  hypothetical protein  37.76 
 
 
245 aa  138  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.21271  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00774  hypothetical protein  34.82 
 
 
253 aa  137  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0844  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  34.82 
 
 
253 aa  137  2e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00757  predicted DNase  34.82 
 
 
253 aa  137  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2562  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  34.82 
 
 
253 aa  137  2e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2853  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.82 
 
 
253 aa  137  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00512011 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0848  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  35.37 
 
 
252 aa  134  1e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0961  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  35.37 
 
 
252 aa  134  1e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0908  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  35.37 
 
 
252 aa  134  1e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0916506  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0940  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  35.37 
 
 
252 aa  134  1e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00426171  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0876  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  35.37 
 
 
252 aa  134  1e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3616  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.9 
 
 
287 aa  133  3e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1028  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  32.81 
 
 
255 aa  130  3e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1281  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.4 
 
 
253 aa  129  6e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1158  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  32.41 
 
 
255 aa  127  2e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.426304  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1391  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.06 
 
 
250 aa  124  1e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0570  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.07 
 
 
250 aa  120  2e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.98478  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6399  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.2 
 
 
271 aa  114  1e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3096  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.43 
 
 
271 aa  112  6e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2962  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.43 
 
 
271 aa  112  6e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.780318 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3052  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.56 
 
 
271 aa  110  2e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3071  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.56 
 
 
271 aa  110  2e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.51453 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2438  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.56 
 
 
271 aa  110  2e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3049  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.17 
 
 
271 aa  107  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.687036  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3386  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  33.07 
 
 
270 aa  106  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0247  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  33.07 
 
 
270 aa  106  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.324157  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2960  hypothetical protein  33.07 
 
 
270 aa  106  4e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0429  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  33.07 
 
 
270 aa  106  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0125577  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0235  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  33.07 
 
 
270 aa  106  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.102348  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2128  hypothetical protein  33.07 
 
 
270 aa  106  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1473  hypothetical protein  35.56 
 
 
273 aa  106  4e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.257293  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0384  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.3 
 
 
265 aa  104  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0213  hypothetical protein  36 
 
 
230 aa  104  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0102  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.13 
 
 
265 aa  104  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2520  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.38 
 
 
232 aa  103  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3294  hypothetical protein  37.71 
 
 
230 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0496  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.66 
 
 
246 aa  102  7e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5005  hypothetical protein  32.95 
 
 
245 aa  102  8e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4337  putative metal-dependent hydrolase  32.3 
 
 
265 aa  102  9e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3253  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.67 
 
 
253 aa  96.3  5e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.378001  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5307  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.2 
 
 
244 aa  95.1  9e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4026  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.12 
 
 
265 aa  92.4  7e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2394  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.74 
 
 
240 aa  92.4  7e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0672115  normal  0.448912 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5411  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.17 
 
 
250 aa  91.7  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.746518 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0201  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.92 
 
 
264 aa  90.9  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1524  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.51 
 
 
228 aa  90.5  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6090  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.2 
 
 
258 aa  90.5  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18128  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2124  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.2 
 
 
240 aa  89.7  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.908976 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0472  hypothetical protein  33.2 
 
 
240 aa  89.7  4e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>