50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5409 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5409  hypothetical protein  100 
 
 		 220 aa  441  1e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2761  protein of unknown function DUF799  71.86 
 
 		 224 aa  292  3e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.936694  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3429  hypothetical protein  69.61 
 
 		 224 aa  290  2e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4602  protein of unknown function DUF799  57.49 
 
 		 219 aa  240  1e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4281  hypothetical protein  57.49 
 
 		 219 aa  238  4e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4223  protein of unknown function DUF799  57.42 
 
 		 219 aa  237  8e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.644744  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1339  putative lipoprotein  58.45 
 
 		 218 aa  236  1e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2721  putative lipoprotein  58.45 
 
 		 218 aa  236  2e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1451  hypothetical protein  58.45 
 
 		 218 aa  236  2e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3560  hypothetical protein  54.09 
 
 		 221 aa  231  5e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0259131  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4014  protein of unknown function DUF799  56.46 
 
 		 219 aa  226  2e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.741538  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01774  lipoprotein  53.55 
 
 		 223 aa  222  4e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0155892  normal  0.405057 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1388  hypothetical protein  55.19 
 
 		 219 aa  222  4e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1455  hypothetical protein  56.77 
 
 		 225 aa  219  3e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0050  putative lipoprotein  57.21 
 
 		 221 aa  216  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.99075  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1252  lipoprotein, putative  57.21 
 
 		 220 aa  210  1e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5337  hypothetical protein  52.26 
 
 		 219 aa  208  6e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.232153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2997  hypothetical protein  47.14 
 
 		 224 aa  191  5e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.657321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2912  hypothetical protein  52.66 
 
 		 221 aa  191  6e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3204  putative lipoprotein  50.25 
 
 		 224 aa  187  9e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3022  hypothetical protein  47.17 
 
 		 224 aa  187  9e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3003  hypothetical protein  47.17 
 
 		 224 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0107  putative lipoprotein  50.26 
 
 		 228 aa  187  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.123438  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2889  putative lipoprotein  50.26 
 
 		 228 aa  187  1e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3968  putative lipoprotein  50.26 
 
 		 224 aa  187  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3887  putative lipoprotein  50.26 
 
 		 224 aa  187  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.488572  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3465  putative lipoprotein  50.26 
 
 		 224 aa  187  1e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2389  hypothetical protein  47.17 
 
 		 224 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3084  putative lipoprotein  50.26 
 
 		 224 aa  186  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1653  putative lipoprotein  50.26 
 
 		 224 aa  186  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00590  putative lipoprotein  56.89 
 
 		 169 aa  175  5e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.592522  normal  0.156495 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0882  glycosyltransferase  45.16 
 
 		 223 aa  166  2.9999999999999998e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1129  lipoprotein  43.12 
 
 		 225 aa  166  2.9999999999999998e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0269959  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1495  lipoprotein  37.8 
 
 		 224 aa  138  7e-32  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.196072  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4118  hypothetical protein  31.25 
 
 		 230 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05523  hypothetical protein  35.39 
 
 		 214 aa  108  8.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0394  putative lipoprotein  33.16 
 
 		 231 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0423  protein of unknown function DUF799  33.16 
 
 		 224 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4671  hypothetical protein  30.53 
 
 		 211 aa  103  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.195271  normal  0.101554 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0422  protein of unknown function DUF799  33.16 
 
 		 224 aa  101  7e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.754874  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1766  hypothetical protein  32.63 
 
 		 202 aa  101  7e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.12485  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3789  hypothetical protein  27.72 
 
 		 245 aa  92  6e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00728655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3071  putative lipoprotein  26.49 
 
 		 195 aa  48.9  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1196  hypothetical protein  22.31 
 
 		 449 aa  48.1  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00854603  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2498  putative lipoprotein  27.46 
 
 		 199 aa  47  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1992  hypothetical protein  27.06 
 
 		 196 aa  45.8  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.580789  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3264  lipoprotein, putative  25 
 
 		 189 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3169  lipoprotein, putative  26.77 
 
 		 191 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1833  putative lipoprotein  27.56 
 
 		 190 aa  42.4  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1121  hypothetical protein  25.74 
 
 		 196 aa  42  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00601274  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>