More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5402 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5402  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 168 aa  338  2e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.153615  normal  0.942445 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3574  transcriptional regulator, MarR family  44.59 
 
 		 174 aa  124  8.000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.930143  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5793  transcriptional regulator, MarR family  41.22 
 
 		 186 aa  107  6e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4468  transcriptional regulator, TrmB  42.28 
 
 		 206 aa  101  4e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.160154  normal  0.0294539 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0294  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 171 aa  100  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3740  transcriptional regulator, MarR family  31.94 
 
 		 164 aa  76.3  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7252  transcriptional regulator, MarR family  34.21 
 
 		 170 aa  71.6  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1325  MarR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 168 aa  71.2  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1800  MarR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 183 aa  70.9  0.000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.79218  normal  0.50534 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3334  transcriptional regulator, TrmB  32.43 
 
 		 151 aa  70.5  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1847  MarR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 178 aa  70.5  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.603807  normal  0.333569 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3813  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 147 aa  68.9  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.363185  normal  0.48019 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 148 aa  69.3  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1301  MarR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 144 aa  68.6  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.630849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1042  transcriptional regulator, MarR family  29.37 
 
 		 160 aa  68.6  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.465044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0832  MarR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 159 aa  68.2  0.00000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.431988  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3866  MarR family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 150 aa  67  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2455  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 148 aa  67.4  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1302  MarR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 154 aa  65.9  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.475565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1073  MarR family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 152 aa  64.7  0.0000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.136141  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0743  MarR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 159 aa  64.3  0.0000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.841359  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1995  MarR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 158 aa  64.7  0.0000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.911966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  31.13 
 
 		 139 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 139 aa  63.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 139 aa  63.5  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  31.13 
 
 		 139 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 139 aa  63.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04217  transcriptional regulator MarR/emrR family  28.26 
 
 		 149 aa  63.9  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3933  transcriptional regulator, MarR family  32.38 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  30.19 
 
 		 139 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 145 aa  62  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0069  transcriptional regulator, MarR family  27.64 
 
 		 166 aa  61.6  0.000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5157  transcriptional regulator, MarR family  26.28 
 
 		 165 aa  60.8  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.14169  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0811  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 149 aa  60.8  0.000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.770437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1709  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 178 aa  60.8  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.592382  normal  0.339139 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0131  transcriptional regulator, MarR family  32.82 
 
 		 156 aa  60.5  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000555257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0360  MarR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  32.14 
 
 		 162 aa  58.9  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  41.12 
 
 		 172 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  34.62 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2052  transcriptional regulator, MarR family  29.17 
 
 		 180 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000132777 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  32.14 
 
 		 162 aa  58.9  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1346  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0685392  normal  0.0717875 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1903  transcriptional regulator, MarR family  30.71 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0221368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7614  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 157 aa  58.5  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.647741  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0087  transcriptional regulator, MarR family  28.7 
 
 		 166 aa  58.5  0.00000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2739  MarR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  31.43 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5066  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.850935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2620  MarR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 152 aa  57.8  0.00000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.955931 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1008  MarR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.467576  normal  0.750434 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3117  MarR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 156 aa  57.8  0.00000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0562  MarR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 185 aa  57.4  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.490708 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5895  putative transcriptional regulator  33.08 
 
 		 156 aa  57.4  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3655  MarR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 163 aa  57.4  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00553213  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2299  MarR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 149 aa  57  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3139  putative transcription regulator protein  29.46 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 172 aa  56.2  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5714  MarR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00966957 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0613  MarR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31364  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1971  MarR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.30149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2977  transcriptional regulator, MarR family  37.18 
 
 		 158 aa  55.1  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.688657  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1796  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.630858  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1844  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.851332  hitchhiker  0.00903999 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1729  MarR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 177 aa  55.1  0.0000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.892869  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5227  MarR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.651457 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1914  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.202978  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4032  transcriptional regulatory protein  26.05 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0606552 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  24.82 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1107  MarR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  24.82 
 
 		 142 aa  53.9  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003355  MarR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 150 aa  53.9  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00113981  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5032  transcriptional regulator, MarR family  34.62 
 
 		 140 aa  53.9  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2116  MarR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 138 aa  53.9  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0902  MarR family transcriptional regulator  23.24 
 
 		 165 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2197  MarR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 170 aa  53.9  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0027451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1198  transcriptional regulator, MarR family  35.04 
 
 		 150 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.60771  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 171 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1384  MarR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 198 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6153  MarR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.834602  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4960  MarR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 167 aa  53.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0298636  normal  0.832443 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68110  putative transcriptional regulator  30.83 
 
 		 156 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000624146  normal  0.0136344 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1926  MarR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.609155  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1949  MarR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 149 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0745921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3190  MarR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 175 aa  52.8  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.7082 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0914  MarR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 143 aa  52.8  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.423224  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3546  MarR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 143 aa  52.8  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212621  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0023  transcriptional regulator, TrmB  36.62 
 
 		 151 aa  53.1  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1921  MarR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 155 aa  53.1  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.153298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4464  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 143 aa  52.4  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3696  MarR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 151 aa  52.4  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.134225  normal  0.172711 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2954  transcriptional regulator, MarR family  33.05 
 
 		 191 aa  52.8  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.237643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1423  MarR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 191 aa  52.8  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2077  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 157 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2286  hypothetical protein  23.18 
 
 		 167 aa  52  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3612  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 171 aa  52  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463026  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3945  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 145 aa  51.6  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.341405 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>